UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F48A9.1F48A9.10chrI 6,595,234
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3C01F1.5C01F1.5n/achrII 4,280,801contains similarity to Interpro domain IPR001506 (Peptidase M12A, astacin)
4amx-2B0019.1n/achrI 12,762,264C. elegans AMX-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01593 Flavin containing amine oxidoreductase contains similarity to Interpro domains IPR002937 (Amine oxidase), IPR016040 (NAD(P)-binding)
5F41A4.1F41A4.1n/achrIV 686,411contains similarity to Pfam domain PF00024 PAN domain contains similarity to Interpro domains IPR000177 (Apple), IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN), IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
6F38E1.9F38E1.9n/achrV 8,358,662contains similarity to Pfam domain PF04193 PQ loop repeat contains similarity to Interpro domains IPR006603 (Cystinosin/ERS1p repeat), IPR016817 (Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein)
7K07E3.2K07E3.2n/achrX 8,105,875
8F10E7.5F10E7.5n/achrII 7,112,410contains similarity to Pfam domain PF00466 Ribosomal protein L10 contains similarity to Interpro domain IPR001790 (Ribosomal protein L10)
9his-39F45F2.2n/achrV 8,536,492his-39 encodes an H2B histone; by homology, HIS-39 is predicted to function as a nucleosome component required for packaging of DNA into chromatin; loss of his-39 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities; his-39 is a replication-dependent histone locus that resides in the HIS2 cluster on chromosome V.
10clec-66F35C5.9n/achrII 12,905,422C. elegans CLEC-66 protein; contains similarity to Pfam domains PF00092 (von Willebrand factor type A domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
11gsp-1F29F11.6n/achrV 10,684,438C. elegans GSP-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
12C52A10.3C52A10.3n/achrV 5,238,510contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
13F34D10.4F34D10.4n/achrIII 3,737,977contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
14F17A2.4F17A2.4n/achrX 12,311,694contains similarity to Naja philippinensis;Naja samarensis;Naja sputatrix Short neurotoxin 1 (NTX I).; SW:NXS1_NAJPH
15F55G1.13F55G1.13n/achrIV 7,496,503F55G1.13 encodes a protein that contains EGF-like repeats that are most closely related to those of Notch family members.
16gbh-1D2089.5n/achrII 10,692,053gbh-1 encodes a predicted ortholog of human hBBOX1; expressed in the intestine and in head and body muscles.
17srg-10T04A8.1n/achrIII 4,678,679C. elegans SRG-10 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
18dylt-1F13G3.4n/achrI 7,300,621dylt-1 encodes a putative dynein light chain subunit that inhibits DHC-1 in vivo, but is otherwise dispensable for viability; DYLT-1 is paralogous to DYLT-3, and orthologous to human DYNLT1 and DYNLT3 (OMIM: 300302); dylt-1(RNAi) and dylt-1(ok417) both suppress the lethality of conditional dhc-1 mutations, and dylt-1(RNAi) suppresses dhc-1(or195) spindle length and cytokinesis defects as well, indicating that DYLT-1 negatively regulates dynein; in oocytes and early embryos, DYLT-1 is associated with nuclear envelopes and centrosomes, and with meiotic and mitotic spindle poles; like DHC-1 itself, DYLT-1 is strongly mislocalized to centrosomes in dhc-1(or195) animals shifted to nonpermissive temperature.
19C49C3.5C49C3.5n/achrIV 17,329,906contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
20evl-14H38K22.1n/achrIII 4,308,081evl-14 encodes a homolog of the yeast sister cohesion protein Pds5p that functions during both mitosis and meiosis and is implicated in the maintenance of sister chromatid cohesion in late prophase, and affects vulval morphology, meiotic germline development, embryonic and larval viability, fertility, and cell divisions in the germ line as well as in vulval and somatic gonad lineages; some of the defects, such as somatic gonad defects, are due at least partially to cell division defects.
21C18B2.6C18B2.6n/achrX 3,615,375contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
22F07A5.3F07A5.3n/achrI 7,355,830contains similarity to Pfam domain PF01130 CD36 family contains similarity to Interpro domain IPR002159 (CD36 antigen)
23gpa-18W03F8.9n/achrIV 5,192,340gpa-18 encodes a divergent G protein alpha subunit, with roughly as much similarity to fungal as to metazoan homologs.
24K08D10.5K08D10.5n/achrIV 4,168,957contains similarity to Rhodopirellula baltica DNA-binding protein SMUBP-2.; TR:Q7UWP1
25T15D6.11T15D6.11n/achrI 12,397,457contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
26bbs-2F20D12.3n/achrIV 7,935,876bbs-2 is orthologous to human BBS2 (OMIM:606151, mutated in Bardet-Biedl syndrome 2); while the function of BBS-2 is unknown, it shares conserved domains with its human paralogs BBS1 and BBS7, which also are mutated in other Bardet-Biedl syndromes.
27tre-4F15A2.2n/achrX 13,473,950C. elegans TRE-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01204 Trehalase contains similarity to Interpro domains IPR001661 (Glycoside hydrolase, family 37), IPR000886 (Endoplasmic reticulum, targeting sequence), IPR008928 (Six-hairpin glycosidase-like)
28srm-2T28H11.3n/achrIV 5,009,723C. elegans SRM-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29dmd-5F10C1.5n/achrII 5,773,110C. elegans DMD-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00751 DM DNA binding domain contains similarity to Interpro domain IPR001275 (DM DNA-binding)
30F21H7.10F21H7.10n/achrV 16,255,295contains similarity to Interpro domain IPR003066 (Salmonella invasion protein InvJ)
31F01D5.3F01D5.3n/achrII 13,999,536contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domains IPR001368 (TNFR/CD27/30/40/95 cysteine-rich region), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
32T16G12.6T16G12.6n/achrIII 10,072,699contains similarity to Interpro domain IPR016024 (Armadillo-type fold)
33C15H11.9C15H11.9n/achrV 14,424,428contains similarity to Pfam domain PF04939 Ribosome biogenesis regulatory protein (RRS1) contains similarity to Interpro domain IPR007023 (Ribosomal biogenesis regulatory protein)
34F56D1.2F56D1.2n/achrII 5,476,416contains similarity to Pfam domain PF08357 SEFIR domain contains similarity to Interpro domain IPR013568 (SEFIR)
35T19C9.8T19C9.8n/achrV 17,239,506contains similarity to Amsacta moorei entomopoxvirus AMV141.; TR:Q9EMQ8
36his-43F08G2.2n/achrII 13,827,426his-43 encodes an H2A histone.
37B0495.9B0495.9n/achrII 7,708,071
38sri-27ZK697.4n/achrV 1,726,643C. elegans SRI-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39gst-7F11G11.2n/achrII 4,882,703gst-7 encodes a predicted glutathione S-transferase.
40F13H10.5F13H10.5n/achrIV 10,992,558contains similarity to Pfam domain PF01663 Type I phosphodiesterase / nucleotide pyrophosphatase contains similarity to Interpro domains IPR017849 (Alkaline phosphatase-like, alpha/beta/alpha), IPR002591 (Type I phosphodiesterase/nucleotide pyrophosphatase/phosphate transferase), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
41F54D7.2F54D7.2n/achrI 4,807,641contains similarity to Pfam domain PF01066 CDP-alcohol phosphatidyltransferase contains similarity to Interpro domains IPR014472 (Choline/ethanolaminephosphotransferase), IPR000462 (CDP-alcohol phosphatidyltransferase)
42C06G1.5C06G1.5n/achrX 16,640,570contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
43C44B7.11C44B7.11n/achrII 6,895,805contains similarity to Pfam domain PF04389 Peptidase family M28 contains similarity to Interpro domain IPR007484 (Peptidase M28)
44C50H11.8C50H11.8n/achrV 3,055,230
45B0205.8B0205.8n/achrI 10,729,585contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein LOC25940; ENSEMBL:ENSP00000238823
46K02B7.1K02B7.1n/achrII 14,689,509contains similarity to Pfam domains PF00628 (PHD-finger) (2), PF00439 (Bromodomain) contains similarity to Interpro domains IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR001487 (Bromodomain), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
47T07C4.10T07C4.10n/achrIII 10,323,248contains similarity to Interpro domains IPR002957 (Keratin, type I), IPR000533 (Tropomyosin), IPR009053 (Prefoldin)
48acr-23F59B1.9n/achrV 3,655,579acr-23 encodes an alpha 7-like homomer-forming subunit of the nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) superfamily which encode ligand-gated ion channels that regulate fast action of acetylcholine at neuromuscular junctions and in the nervous system; ACR-23 is a member of the DEG-3-like group of nAChR subunits which appears to be unique to nematodes.
49C56C10.11C56C10.11n/achrII 6,599,683
50C11D2.3C11D2.3n/achrIV 6,154,348