UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F47B8.3F47B8.32e-150chrV 14,322,155contains similarity to Pfam domain PF00462 Glutaredoxin contains similarity to Interpro domains IPR002109 (Glutaredoxin), IPR012336 (Thioredoxin-like fold)
2T27F2.4T27F2.4n/achrV 11,650,405contains similarity to Interpro domain IPR004827 (Basic-leucine zipper (bZIP) transcription factor)
3C50F4.9C50F4.9n/achrV 9,523,727contains similarity to Streptococcus agalactiae Hypothetical protein.; TR:Q8E2N5
4nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
5F47E1.2F47E1.2n/achrX 9,059,694contains similarity to Pfam domain PF03137 Organic Anion Transporter Polypeptide (OATP) family contains similarity to Interpro domains IPR004156 (Organic anion transporter polypeptide OATP), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
6glb-15F35B12.8n/achrV 11,617,517glb-15 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
7K07A1.3K07A1.3n/achrI 9,587,656contains similarity to Pfam domain PF03412 Peptidase C39 family contains similarity to Interpro domain IPR005074 (Peptidase C39, bacteriocin processing)
8flp-14Y37D8A.15n/achrIII 12,912,600flp-14 encodes four copies of a single FMRFamide-related short peptide neurotransmitter; FLP-14 can increase pharyngeal action potential frequency, although its exact role in C. elegans neurotransmission is not yet clear.
9C02B8.3C02B8.3n/achrX 8,139,820
10nlp-10F37A8.4n/achrIII 3,934,743nlp-10 encodes four predicted neuropeptide-like proteins; nlp-10 is part of a GGxY neuropeptide family that has members in several other nematode species; nlp-10 is expressed in a variety of neurons, including ASK, ADL, CAN, two lateral neurons, two anterior pharyngeal neurons, one tail neuron, and one male tail neuron; as loss of nlp-10 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of nlp-10-encoded peptides in development and/or behavior is not yet known.
11C17B7.2C17B7.2n/achrV 3,349,796contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domain IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
12F48C1.8F48C1.8n/achrI 5,335,938contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR002395 (HMW kininogen), IPR000817 (Prion protein), IPR008119 (Dense granule Gra6 protein)
13F18G5.6F18G5.6n/achrX 9,263,128
14K11D12.8K11D12.8n/achrV 5,040,194
15C30B5.7C30B5.7n/achrII 6,225,999contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR003944 (Protease-activated receptor 4)
16cpx-2K03A11.2n/achrX 13,067,761C. elegans CPX-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF05835 Synaphin protein contains similarity to Interpro domain IPR008849 (Synaphin)
17M03A1.3M03A1.3n/achrII 4,558,668M03A1.3 encodes a protein with ~10 predicted transmembrane sequences; it has an internal repeat (in residues 74-351 and 377-668), with some similarity in these repeated domains to worm C05D12.1 and C13B4.1, and to mammalian stromal cell derived factor receptor 2.
18C18H7.9C18H7.9n/achrIV 603,317contains similarity to Pfam domains PF08242 (Methyltransferase domain) , PF08241 (Methyltransferase domain) contains similarity to Interpro domains IPR013217 (Methyltransferase type 12), IPR013216 (Methyltransferase type 11)
19fbxa-161C08E3.4n/achrII 1,607,102C. elegans FBXA-161 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
20F26A10.1F26A10.1n/achrX 7,627,709
21C13A2.7C13A2.7n/achrV 7,266,655
22K01D12.10K01D12.10n/achrV 12,406,600contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR003072 (Orphan nuclear receptor, NOR1 type), IPR003982 (Leukotriene B4 type 2 receptor)
23pqn-48K07D4.8n/achrII 4,040,965The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
24F23F1.7F23F1.7n/achrII 39,046contains similarity to Interpro domains IPR011001 (Saposin-like), IPR008139 (Saposin B)
25nhr-260C38C3.9n/achrV 1,510,828C. elegans NHR-260 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
26F20B6.4F20B6.4n/achrX 4,194,407
27EGAP5.1EGAP5.1n/achrX 5,163,174
28Y60C6A.1Y60C6A.1n/achrV 4,784,867contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
29M03E7.1M03E7.1n/achrV 5,624,123contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
30F49C12.10F49C12.10n/achrIV 9,318,735contains similarity to Pfam domain PF08241 Methyltransferase domain contains similarity to Interpro domain IPR013216 (Methyltransferase type 11)
31xbx-3M04D8.6n/achrIII 10,036,315C. elegans XBX-3 protein ;
32flp-24C24A1.1n/achrIII 725,550C. elegans FLP-24 protein ;
33C37C3.10C37C3.10n/achrV 7,862,685
34tag-243T04A8.4n/achrIII 4,686,618C. elegans TAG-243 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding)
35C02B8.7C02B8.7n/achrX 8,137,743
36F11A5.13F11A5.13n/achrV 16,226,353contains similarity to Clostridium acetobutylicum MDR-type permease.; TR:Q97D15
37D1086.5D1086.5n/achrV 14,089,587contains similarity to Bison bonasus MHC class II DR-beta chain (Fragment).; TR:O19256
38C55A1.6C55A1.6n/achrV 15,648,434contains similarity to Lactococcus lactis Protein maturation protein.; TR:Q9CEV9
39F08H9.4F08H9.4n/achrV 14,463,959F08H9.4 encodes a heat shock protein (HSP) of the HSP16 class; unlike most HSP16s in C. elegans, it is specifically expressed in a particular tissue (the excretory canal and ventral nerve-cord neurons), and its expression is only mildly induced by heat shock; however, F08H9.4 expression is increased by heat shock, is induced in a new tissue type (intestine) by heat shock, and probably aids heat shock resistance, since F08H9.4(RNAi) animals die as embryos in heat shock at a higher rate than normal; in general, HSP16 proteins are thought to act as passive ligands for unfolded proteins that keep them safe from aggregation until the proteins can be refolded by a large (ATP-consuming) HSP.
40grd-9C04E6.6n/achrV 5,896,978grd-9 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central low-complexity proline-rich domain, and a C-terminal Ground domain; the Ground domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins; GRD-9 is weakly required for normal molting; GRD-9 is also required for normal growth to full size, locomotion, and male tail development; all of these requirements may reflect common defects in cholesterol-dependent hedgehog-like signalling or in vesicle trafficking.
41F42C5.3F42C5.3n/achrIV 7,286,758contains similarity to Homo sapiens Intersectin 1 short form transcript variant 8; ENSEMBL:ENSP00000370685
42ZC412.1ZC412.1n/achrV 14,855,683contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
43C54D2.2C54D2.2n/achrX 7,839,011
44nas-28F42A10.8n/achrIII 6,182,093C. elegans NAS-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF01400 Astacin (Peptidase family M12A) contains similarity to Interpro domains IPR017050 (Peptidase M12A, astacin, nematode), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
45F14D7.5F14D7.5n/achrV 14,299,389contains similarity to Bacteroides thetaiotaomicron Hypothetical protein.; TR:Q8ABS0
46K04F1.12K04F1.12n/achrV 1,656,168contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
47srh-19F19G12.5n/achrX 1,414,840C. elegans SRH-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48F49C12.6F49C12.6n/achrIV 9,308,209contains similarity to Pfam domains PF06800 (Sugar transport protein) , PF07857 (CEO family (DUF1632)) contains similarity to Interpro domains IPR012435 (Protein of unknown function DUF1632), IPR010651 (Sugar transport), IPR005384 (Duffy antigen/chemokine receptor)
49C13A10.2C13A10.2n/achrII 1,357,598
50T08G5.2T08G5.2n/achrV 14,025,155contains similarity to Homo sapiens Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 1; ENSEMBL:ENSP00000312021