UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F47B7.7F47B7.70chrX 3,779,589contains similarity to Ostertagia ostertagi Putative ES protein (Fragment).; TR:Q8WQ03
2F39E9.4F39E9.4n/achrII 3,284,898F39E9.4 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F39E9.4 has no clear orthologs in other organisms.
3gpa-2F38E1.5n/achrV 8,372,499gpa-2 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases that is involved in dauer formation and chemotaxis to water-soluble odorants; it is expressed in the phasmid neurons PHA and PHB, three pharyngeal neurons, one interneuron, three pairs of head neurons, and the anal sphincter muscle.
4C31B8.7C31B8.7n/achrV 2,901,878contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
5T05A8.1T05A8.1n/achrII 2,709,077
6nas-25F46C5.3n/achrII 8,827,065nas-25 encodes an astacin-like metalloprotease; large-scale expression studies reveal that a nas-25::GFP promoter fusion is expressed in the pharynx and pharyngeal-intestinal valve.
7nhr-7F54D1.4n/achrIV 11,267,544C. elegans NHR-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
8tag-192T04D1.4n/achrI 4,692,225C. elegans TAG-192 protein; contains similarity to Pfam domains PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) , PF07533 (Associated with TFs and helicases) , PF00385 ('chromo' (CHRromatin Organisation MOdifier) domain) , PF00176 (SNF2 family N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR000953 (Chromo domain), IPR000330 (SNF2-related), IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR001005 (SANT, DNA-binding), IPR000694 (Proline-rich region), IPR016197 (Chromo domain-like), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR006576 (BRK), IPR009057 (Homeodomain-like), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
9T27A3.5T27A3.5n/achrI 6,101,032contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
10tbx-35ZK177.10n/achrII 5,524,762C. elegans TBX-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF00907 T-box contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR001699 (Transcription factor, T-box)
11F55C12.2F55C12.2n/achrII 5,877,311
12ptr-5C53C11.3n/achrX 17,322,508ptr-5 encodes a nematode-specific member of the sterol sensing domain (SSD) proteins, distantly paralogous to Drosophila PATCHED (PTC) and human PTCH (OMIM:601309, mutated in basal cell nevus syndrome); PTR-5 is weakly required for normal molting from L4 to adult stages; PTR-5 is also required for normal growth to full size and locomotion; PTR-5 is expressed in head and tail neurons, and in ventral nerve cord.
13C33F10.8C33F10.8n/achrII 4,824,276This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
14T19D7.5T19D7.5n/achrX 665,501
15C06C3.8C06C3.8n/achrII 9,388,665contains similarity to Pfam domain PF03353 DUF278 contains similarity to Interpro domains IPR005020 (Protein of unknown function DUF278), IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease), IPR006578 (MADF)
16acs-17C46F4.2n/achrX 5,939,959C. elegans ACS-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
17F41B4.1F41B4.1n/achrX 6,824,820contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein ENSP00000368755 (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000368755
18dod-24C32H11.12n/achrIV 12,940,724C. elegans DOD-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003366 (CUB-like region)
19R01E6.7R01E6.7n/achrX 13,568,618contains similarity to Ectocarpus siliculosus virus EsV-1-142.; TR:Q8QKY0
20CD4.1CD4.1n/achrV 5,608,204
21F47B7.4F47B7.4n/achrX 3,765,997contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
22F31B12.2F31B12.2n/achrX 10,822,704contains similarity to Mus musculus Splicing factor, arginine/serine-rich 12 (Serine-arginine-richssplicing regulatory protein 86) (SRrp86).; SW:SFRC_MOUSE
23C17C3.2C17C3.2n/achrII 5,566,360
24C54E4.1C54E4.1n/achrIV 2,176,591
25srbc-34Y113G7B.9n/achrV 20,202,676C. elegans SRBC-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
26K07E12.2K07E12.2n/achrIII 6,737,547
27W03D8.8W03D8.8n/achrI 2,793,293contains similarity to Pfam domains PF08840 (BAAT / Acyl-CoA thioester hydrolase C terminal) , PF04775 (Acyl-CoA thioester hydrolase / Bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase) contains similarity to Interpro domains IPR006862 (Acyl-CoA thioester hydrolase/bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase), IPR014940 (BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase C-terminal), IPR016662 (Acyl-CoA thioesterase, long chain)
28T15B7.6T15B7.6n/achrV 6,826,715
29R13A5.9R13A5.9n/achrIII 7,577,267contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR001958 (Tetracycline resistance protein, TetA), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
30srh-83F09G2.7n/achrV 7,165,183C. elegans SRH-83 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31twk-21T01B4.1n/achrX 16,302,750C. elegans TWK-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
32Y39E4A.1Y39E4A.1n/achrIII 12,951,765contains similarity to Mus musculus Nuclear protein ZAP3.; SW:ZAP3_MOUSE
33T23F1.3T23F1.3n/achrV 15,456,730contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
34C07H6.2C07H6.2n/achrIII 7,521,145contains similarity to Pfam domain PF07491 Protein phosphatase inhibitor contains similarity to Interpro domain IPR011107 (Protein phosphatase inhibitor)
35F08D12.2F08D12.2n/achrII 2,782,368contains similarity to Pfam domain PF04942 CC domain contains similarity to Interpro domain IPR007026 (Domian of unknown function, DUF-CC)
36col-63ZK265.2n/achrI 8,244,320C. elegans COL-63 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
37C39D10.6C39D10.6n/achrX 7,896,965
38cyp-33C7F41B5.2n/achrV 2,251,536C. elegans CYP-33C7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
39kcc-3K02A2.3n/achrII 7,428,601C. elegans KCC-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00324 Amino acid permease contains similarity to Interpro domains IPR000076 (K-Cl co-transporter), IPR004841 (Amino acid permease-associated region)
40C33C12.4C33C12.4n/achrII 2,165,992
41ugt-2AC3.8n/achrV 10,399,988C. elegans UGT-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
42skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
43gst-40F56B3.10n/achrIV 761,476C. elegans GST-40 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
44C49F8.2C49F8.2n/achrX 13,374,194contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
45nhr-248ZK218.6n/achrV 17,103,987C. elegans NHR-248 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
46W03F8.2W03F8.2n/achrIV 5,191,305contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif)
47ubq-2ZK1010.1n/achrIII 12,978,145ubq-2 encodes a bifunctional protein that contains two domains; an N-terminal ubiquitin peptide, and a C-terminal large ribosomal subunit protein L40 peptide.
48Y51A2D.18Y51A2D.18n/achrV 18,484,174contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005829 (Sugar transporter, conserved site), IPR005828 (General substrate transporter), IPR003663 (Sugar transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
49fat-7F10D2.9n/achrV 7,152,237fat-7 encodes an essential delta-9 fatty acid desaturase that is required for the synthesis of monounsaturated fatty acids; fat-7 can substitute for the functions of the other two fatty acid desaturases, fat-5 and fat-6; RNA interference has shown that fat-7 is required for viability and normal growth.
50K06A1.2K06A1.2n/achrII 6,445,339