UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F47B10.4F47B10.41e-47chrX 10,891,428contains similarity to Cyanophage P60 Thioredoxin C3.; TR:Q8W710
2F07C4.11F07C4.11n/achrV 7,642,685contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
3T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
4nhr-241Y69H2.8n/achrV 18,700,186C. elegans NHR-241 protein
5nhr-278ZK6.1n/achrV 409,173C. elegans NHR-278 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000679 (Zinc finger, GATA-type), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
6F19B10.1F19B10.1n/achrII 3,683,855contains similarity to Gallus gallus Neurofilament medium polypeptide (NF-M) (Neurofilament triplet Msprotein) (160 kDa neurofilament protein).; SW:P16053
7Y76A2B.2Y76A2B.2n/achrIII 13,533,575contains similarity to Homo sapiens Reticulon-4 receptor precursor; ENSEMBL:ENSP00000043402
8srz-48F20E11.1n/achrV 17,459,315C. elegans SRZ-48 protein ;
9dhs-27C04F6.5n/achrX 3,415,914dhs-27 encodes a short-chain dehydrogenase predicted to be mitochondrial.
10fbxb-99Y8A9A.5n/achrII 3,792,968This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
11clec-243Y68A4B.1n/achrV 17,248,138C. elegans CLEC-243 protein; contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domains IPR002921 (Lipase, class 3), IPR008262 (Lipase, active site)
12srw-35T08G3.10n/achrV 16,472,391C. elegans SRW-35 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
13C38H2.2C38H2.2n/achrIII 10,383,431C38H2.2 encodes a core 1 UDP-Gal:GalNAcalpha1-Ser/Thr beta1,3-galactosyltransferase (core 1 beta3-Gal-T or T-synthase, EC2.4.1.122); C38H2.2 protein is predicted to be primarily extracellular, with an N-terminal transmembrane domain; C38H2.2 shares 6 conserved cysteine residues with all known T-synthases, and is ubiquitously expressed; enzymatically active C38H2.2 can be generated from insect but not mammalian cells, suggesting that invertebrate-specific chaperones are required for its activity.
14C36C5.4C36C5.4n/achrV 3,167,003contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
15nhr-126F44C8.10n/achrV 2,230,032nhr-126 encodes a member of the nuclear hormone receptor family.
16srt-30R08F11.2n/achrV 3,799,527C. elegans SRT-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
17srv-36F57G8.8n/achrV 16,324,110C. elegans SRV-36 protein ;
18ZC13.2ZC13.2n/achrX 881,854
19C05G5.5C05G5.5n/achrX 14,758,374contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000360931
20K10H10.9K10H10.9n/achrII 14,514,333contains similarity to Vibrio vulnificus Conserved hypothetical protein.; TR:Q8D6Y7
21T24D5.4T24D5.4n/achrX 12,597,224contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
22C17B7.10C17B7.10n/achrV 3,341,460C17B7.10 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; C17B7.10 has no clear orthologs in other organisms.
23srbc-15F15E11.10n/achrV 2,346,927C. elegans SRBC-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
24srg-26C10G8.1n/achrV 5,332,145C. elegans SRG-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
25F58G11.4F58G11.4n/achrV 13,674,239contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
26K10C3.4K10C3.4n/achrI 9,861,391contains similarity to Xenopus laevis Transmembrane protein 98.; SW:Q6INX1
27ZC53.4ZC53.4n/achrX 1,931,714contains similarity to Tetrahymena thermophila SB210 Putative uncharacterized protein.; TR:Q227Y0
28T08G5.8T08G5.8n/achrV 14,048,191contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
29srh-49C10G11.4n/achrI 6,298,750C. elegans SRH-49 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30C11G6.3C11G6.3n/achrX 16,343,288contains similarity to Pfam domain PF00628 PHD-finger contains similarity to Interpro domains IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR000956 (Stathmin), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR003026 (Transcription factor Otx1, C-terminal), IPR000533 (Tropomyosin), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
31F55C5.6F55C5.6n/achrV 12,280,460contains similarity to Pfam domain PF01593 Flavin containing amine oxidoreductase contains similarity to Interpro domains IPR000759 (Adrenodoxin reductase), IPR002937 (Amine oxidase), IPR016040 (NAD(P)-binding)
32W09C3.3W09C3.3n/achrI 4,708,334contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
33LLC1.2LLC1.2n/achrIV 14,460,481contains similarity to Pfam domain PF06879 Protein of unknown function (DUF1261) contains similarity to Interpro domain IPR009673 (Protein of unknown function DUF1261)
34C46A5.4C46A5.4n/achrIV 7,752,034contains similarity to Pfam domain PF03098 Animal haem peroxidase contains similarity to Interpro domains IPR010255 (Haem peroxidase), IPR002007 (Haem peroxidase, animal)
35fbxb-6F07E5.1n/achrII 2,066,717This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
36Y38H6C.9Y38H6C.9n/achrV 20,516,299contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
37lact-7C40H5.4n/achrX 11,762,779lact-7 encodes a beta-lactamase domain-containing protein.
38C11H1.2C11H1.2n/achrX 14,306,277contains similarity to Interpro domain IPR015672 (G-protein coupled receptor 89-related)
39F39F10.5F39F10.5n/achrX 16,913,317
40Y116A8C.11Y116A8C.11n/achrIV 16,989,256contains similarity to Streptococcus pyogenes serotype M5 M protein, serotype 5 precursor.; SW:P02977
41T21E12.3T21E12.3n/achrI 4,403,989contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
42math-6C16C4.11n/achrII 1,884,167C. elegans MATH-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
43nhr-187F47C10.4n/achrV 3,861,996C. elegans NHR-187 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
44C50H2.5C50H2.5n/achrV 9,919,252contains similarity to Interpro domains IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
45T21B6.4T21B6.4n/achrX 10,934,829contains similarity to Interpro domain IPR003006 (Immunoglobulin/major histocompatibility complex, conserved site)
46ilys-1C45G7.1n/achrIV 2,470,894C. elegans ILYS-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF05497 Destabilase contains similarity to Interpro domain IPR008597 (Destabilase)
47srbc-25F40D4.6n/achrV 17,174,753C. elegans SRBC-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
48cfi-1T23D8.8n/achrI 9,997,318cfi-1 encodes a DNA-binding protein containing an AT-rich interaction domain (ARID) that affects differentiation of the URA sensory neurons, AVD, and PVC interneurons; acts downstream of UNC-86 and LIN-32 in controlling URA and IL2 cell fate, and is expressed in some neurons and muscle cells.
49R11D1.4R11D1.4n/achrV 12,713,623contains similarity to Xenopus laevis Similar to kinesin-like 1.; TR:Q8AVK8
50srd-9T09D3.1n/achrV 5,352,409C. elegans SRD-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)