UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F46F5.5F46F5.50chrII 812,930contains similarity to Interpro domain IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
2unc-3Y16B4A.1n/achrX 14,778,472The unc-3 gene encodes a protein with homology to immunoglobulin (Ig) domain-containing transcription factors such as OLF-1 or SU(H).
3srg-32T21C9.7n/achrV 10,587,952C. elegans SRG-32 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
4clec-198C49C3.13n/achrIV 17,349,079C. elegans CLEC-198 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
5T05H10.8T05H10.8n/achrII 8,060,196contains similarity to Streptococcus pneumoniae Cell division regulator, negative regulator of FtsZ ringsformation.; TR:Q8DQE5
6F16G10.6F16G10.6n/achrII 2,377,526contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
7Y37A1B.9Y37A1B.9n/achrIV 14,018,009contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
8C24A11.5C24A11.5n/achrI 5,385,191
9F41H8.2F41H8.2n/achrV 827,588contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
10C06C6.1C06C6.1n/achrV 16,011,384contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR010916 (TonB box, conserved site)
11gpa-9F56H9.4n/achrV 12,648,055gpa-9 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases; it is expressed in ASJ, PHB, PVQ, pharyngeal muscle, and the spermatheca.
12nhr-149C03G6.12n/achrV 7,349,121C. elegans NHR-149 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
13C08F11.2C08F11.2n/achrIV 13,622,516contains similarity to Methanobacterium thermoautotrophicum Hypothetical protein MTH421.; SW:Y421_METTH
14F44A2.2F44A2.2n/achrV 9,319,570contains similarity to Pfam domains PF02214 (K+ channel tetramerisation domain) , PF07885 (Ion channel) , PF00520 (Ion transport protein) contains similarity to Interpro domains IPR005821 (Ion transport), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003971 (Potassium channel, voltage dependent, Kv9), IPR003968 (Potassium channel, voltage dependent, Kv), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation), IPR003091 (Voltage-dependent potassium channel), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003974 (Potassium channel, voltage dependent, Kv3)
15srx-98F19B10.8n/achrII 3,670,182C. elegans SRX-98 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
16str-140C09H5.3n/achrV 8,066,820C. elegans STR-140 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17F45E12.6F45E12.6n/achrII 7,313,979
18F16G10.8F16G10.8n/achrII 2,382,692contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
19C03C10.7C03C10.7n/achrIII 4,096,446contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Profilin synthetic lethal protein, has region of coiled-coil structure; subunit of the Exocyst complex--the Exocyst complex contains the gene products encoded by SEC3, SEC5, SEC6, SEC8, SEC10, SEC15 and EXO70 and is required for exocytosis; SGD:YER008C
20C17H1.6C17H1.6n/achrI 13,131,624contains similarity to Danio rerio Arginine and glutamate-rich protein 1-B.; SW:Q6P5L7
21F33D11.8F33D11.8n/achrI 5,854,677
22nhr-187F47C10.4n/achrV 3,861,996C. elegans NHR-187 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
23fbxa-41F52D2.1n/achrX 1,949,939This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
24str-131C09H5.6n/achrV 8,081,002C. elegans STR-131 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25R10A10.1R10A10.1n/achrI 6,418,689
26srsx-39M01B2.9n/achrV 15,255,926C. elegans SRSX-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
27ceh-30C33D12.7n/achrX 3,064,554ceh-30 encodes a homeodomain protein most similar to Drosophila and mammalian BarH1 (OMIM:605211) which function in neuronal cell fate determination; the precise biological role of CEH-30 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
28T05A6.5T05A6.5n/achrII 7,824,034contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
29nhr-159C17E7.7n/achrV 3,876,286C. elegans NHR-159 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
30str-63C17B7.1n/achrV 3,352,167C. elegans STR-63 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31Y40B1A.1Y40B1A.1n/achrI 13,346,056contains similarity to Lampropeltis getula nigrita Cytochrome b.; TR:Q953V8
32Y70C5C.3Y70C5C.3n/achrV 16,714,293contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
33F14H8.4F14H8.4n/achrV 15,024,402contains similarity to Clostridium acetobutylicum Protein containing a domain related to multimeric flavodoxin WrbAsfamily.; TR:Q97H25
34F55B12.2F55B12.2n/achrV 13,816,154contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
35Y54G9A.1Y54G9A.1n/achrII 13,700,041contains similarity to Carabus linnei NADH dehydrogenase subunit 5 (Fragment).; TR:O79584
36E02H4.4E02H4.4n/achrX 14,259,690contains similarity to Arabidopsis thaliana Uncharacterized protein At1g15830.1.; TR:Q3EDB7
37egl-10F28C1.2n/achrV 12,459,067egl-10 encodes an RGS protein, expressed in neurons, that affects egg laying and negatively regulates GOA-1 (Galpha[o]) signalling; it requires the Gbeta(5) ortholog GPB-2 for this activity, and genetically interacts with the egl-30 and goa-1 signaling pathways.
38srj-27T01G5.3n/achrV 15,126,838C. elegans SRJ-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39F16G10.14F16G10.14n/achrII 2,398,093contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
40ttx-3C40H5.5n/achrX 11,766,841ttx-3 encodes a LIM homeodomain protein required for functions of the interneuron AIY, including thermosensory behavior and olfactory learning.
41srg-41T19C4.3n/achrV 11,161,148C. elegans SRG-41 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000500 (Connexins), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
42C24G7.4C24G7.4n/achrI 4,096,469contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
43Y44A6B.3Y44A6B.3n/achrV 20,633,182contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
44fmo-2K08C7.5n/achrIV 10,683,426fmo-2 encodes a flavin-containing monoxygenase homologous to human FMO1, FMO2, and FMO3 (OMIM:602079, mutated in trimethylaminuria).
45srh-109T19C9.4n/achrV 17,219,817C. elegans SRH-109 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46jkk-1F35C8.3n/achrX 5,370,204jkk-1 encodes a member of the MAP kinase kinase superfamily that affects synaptic vesicle localization and is required in type-D motor neurons for normal locomotion; can function in the Hog1 MAP kinase pathway I in yeast as an activator of JNK and is expressed in most neurons
47ttr-13Y44A6B.4n/achrV 20,631,647C. elegans TTR-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
48F45F2.1F45F2.1n/achrV 8,538,519contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domain IPR004878 (Protein of unknown function DUF270)
49T23D5.8T23D5.8n/achrV 15,747,913contains similarity to Interpro domain IPR000168 (Nematode 7TM chemoreceptor (probably olfactory))
50T08G5.8T08G5.8n/achrV 14,048,191contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)