UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ceh-27F46F3.15.9999999999999995e-109chrV 11,663,161ceh-27 encodes a homeodomain protein of the NK-2 class that contains Drosophila scarecrow and human NKX-2 (OMIM:606727); CEH-27 activity is essential for embryogenesis and appears to be required for maintaining hypodermal integrity during movement as embryos lacking CEH-27 burst at a breach in the ventral hypodermis upon commencement of muscle contractions; CEH-27 expression is first detected in the ~100-cell embryo in what appear to be MS-derived cells while in later embryos expression is seen in a number of cells in the anterior head region.
2R07C3.8R07C3.8n/achrII 914,449
3srg-62C24B9.12n/achrV 2,741,420C. elegans SRG-62 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
4F20E11.7F20E11.7n/achrV 17,465,622contains similarity to Pfam domain PF03436 Domain of unknown function (DUF281) contains similarity to Interpro domains IPR005098 (Protein of unknown function DUF281), IPR006662 (Thioredoxin-related)
5K09E2.2K09E2.2n/achrX 8,677,297
6nhr-276Y71A12C.1n/achrI 14,042,539C. elegans NHR-276 protein; contains similarity to Pfam domain PF00104 Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
7F53A9.5F53A9.5n/achrX 8,699,785contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
8C41D11.3C41D11.3n/achrI 4,430,732contains similarity to Interpro domain IPR001041 (Ferredoxin)
9cpsf-2F09G2.4n/achrV 7,181,006C. elegans CPSF-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00753 (Metallo-beta-lactamase superfamily) , PF07521 (RNA-metabolising metallo-beta-lactamase) contains similarity to Interpro domains IPR011108 (RNA-metabolising metallo-beta-lactamase), IPR001279 (Beta-lactamase-like)
10T07D3.2T07D3.2n/achrII 902,779contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
11W03H9.1W03H9.1n/achrII 14,148,639contains similarity to Pfam domain PF06918 Protein of unknown function (DUF1280) contains similarity to Interpro domain IPR009689 (Protein of unknown function DUF1280)
12F29A7.4F29A7.4n/achrII 2,750,080contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein C2orf32; ENSEMBL:ENSP00000263655
13W02H3.1W02H3.1n/achrX 11,104,112contains similarity to Bacillus halodurans Myo-inositol 2-dehydrogenase.; TR:Q9KAH1
14H16D19.3H16D19.3n/achrI 12,639,596contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
15srh-257T06E6.6n/achrV 15,409,280C. elegans SRH-257 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR013333 (Ryanodine receptor, N-terminal)
16srh-272F37B4.4n/achrV 2,864,166C. elegans SRH-272 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17nhr-118F13A2.8n/achrV 4,408,904C. elegans NHR-118 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core), IPR000003 ()
18C14C6.6C14C6.6n/achrV 546,947contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
19srbc-8C18B10.5n/achrV 7,484,197C. elegans SRBC-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
20K04F1.13K04F1.13n/achrV 1,652,895contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
21math-16C16C4.8n/achrII 1,878,171C. elegans MATH-16 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
22F52E10.2F52E10.2n/achrX 16,282,921contains similarity to Borrelia burgdorferi EppA.; TR:Q840B4
23C33A11.2C33A11.2n/achrX 15,367,917contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG4025-PA;; FLYBASE:CG4025
24F53E10.5F53E10.5n/achrV 2,597,474
25sre-5B0212.2n/achrIV 3,566,503C. elegans SRE-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
26Y113G7A.14Y113G7A.14n/achrV 20,132,595contains similarity to Lumpy skin disease virus LSDV134 variola virus B22R-like protein.; TR:Q91MN0
27srw-96K04F1.2n/achrV 1,674,580C. elegans SRW-96 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit)
28F37C4.7F37C4.7n/achrIV 3,878,770
29F26A1.14F26A1.14n/achrIII 4,849,521contains similarity to Interpro domains IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR008431 (Cyclic nucleotide phosphodiesterase)
30K10B4.4K10B4.4n/achrII 124,170contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR005390 (Neuromedin U receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
31M4.1M4.1n/achrIV 3,215,716contains similarity to Pfam domain PF00498 FHA domain contains similarity to Interpro domains IPR008984 (SMAD/FHA domain), IPR009053 (Prefoldin), IPR000253 (Forkhead-associated)
32T11F8.2T11F8.2n/achrIV 5,477,982
33ZK228.1ZK228.1n/achrV 18,445,683contains similarity to Mus musculus SOX-13 protein.; SW:SX13_MOUSE
34srbc-41F16B4.10n/achrV 1,613,815C. elegans SRBC-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like)
35C45E5.2C45E5.2n/achrIV 5,742,716contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
36sre-32W05H5.7n/achrII 12,455,773C. elegans SRE-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000293 (Channel forming colicin, C-terminal cytotoxic)
37C24G7.1C24G7.1n/achrI 4,110,897contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
38srh-236Y68A4A.9n/achrV 17,211,345C. elegans SRH-236 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
39C50B8.3C50B8.3n/achrV 13,567,762contains similarity to Pfam domain PF08547 Complex I intermediate-associated protein 30 (CIA30) contains similarity to Interpro domain IPR013857 (NADH:ubiquinone oxidoreductase complex I intermediate-associated protein 30)
40sri-39F33H12.2n/achrII 2,588,572C. elegans SRI-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41gnrr-7F13D2.3n/achrX 11,186,568C. elegans GNRR-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
42clec-24F49A5.4n/achrV 16,863,042C. elegans CLEC-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
43srw-14C41G6.8n/achrV 15,226,687C. elegans SRW-14 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000975 (Interleukin-1)
44srbc-82C31A11.4n/achrV 16,301,000C. elegans SRBC-82 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
45srg-44F31E9.2n/achrV 17,329,671C. elegans SRG-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
46str-238R09E12.4n/achrV 768,810C. elegans STR-238 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47F36H12.17F36H12.17n/achrIV 5,277,187
48srz-54Y102A5C.25n/achrV 16,981,243C. elegans SRZ-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
49C17C3.9C17C3.9n/achrII 5,531,799
50C07A4.3C07A4.3n/achrX 10,175,118contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)