UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1hum-4F46C3.30chrX 11,426,926hum-4 encodes a class XII myosin, an unconventional myosin.
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3Y43C5A.4Y43C5A.4n/achrIV 10,278,717contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
4R57.2R57.2n/achrX 298,212contains similarity to Pfam domain PF01682 DB module contains similarity to Interpro domain IPR002602 (Protein of unknown function DB)
5Y57A10C.8Y57A10C.8n/achrII 12,428,881contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002355 (Multicopper oxidase, copper-binding site)
6F46F3.3F46F3.3n/achrV 11,668,418contains similarity to Dictyostelium discoideum Hypothetical protein.; TR:Q86J27
7che-3F18C12.1n/achrI 8,071,859The dynein heavy chain (DHC) 1b isoform that affects the establishment and maintainance of the structural integrity of sensory cilia and also has a role in intraflagellar transport; it is expressed in ciliated sensory neurons.
8bbs-5R01H10.6n/achrIII 10,260,159C. elegans BBS-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF07289 Protein of unknown function (DUF1448) contains similarity to Interpro domains IPR006606 (Protein of unknown function DUF1448), IPR008162 (Inorganic pyrophosphatase), IPR014003 (Protein of unknown function DM16)
9rsr-1F28D9.1n/achrI 11,179,945C. elegans RSR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01480 PWI domain contains similarity to Interpro domains IPR002483 (Splicing factor PWI), IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5), IPR002185 (Dopamine D4 receptor)
10F35A5.5F35A5.5n/achrX 3,794,638contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
11E04F6.2E04F6.2n/achrII 7,200,583contains similarity to Drosophila pseudoobscura GA13509-PA (Fragment).; TR:Q28YG6
12fbxa-153B0391.5n/achrV 15,608,029fbxa-153 encodes a protein with an N-terminal F-box domain and a C-terminal FTH domain; FBXA-153 has no obvious non-nematode orthologs; FBXA-153 shares N-terminal UNC-13 binding, and thus may share at least some functions, with ERI-1, W04D2.6, and Y55F3AM.13; FBXA-153 has no obvious function in mass RNAi assays.
13ZK896.9ZK896.9n/achrIV 12,857,434ZK896.9 encodes a putative transporter of UDP-N-acetylglucosamine (UDP-GlcNAc) and UDP-N-acetylgalactosamine (UDP-GalNAc), orthologous to human SLC35A3 (OMIM:605632) and paralogous to C03H5.2 and SRF-3; ZK896.9 has no obvious function in RNAi assays, but this could reflect genetic redundancy with its paralogs.
14nhr-278ZK6.1n/achrV 409,173C. elegans NHR-278 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000679 (Zinc finger, GATA-type), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
15nhr-255ZK678.2n/achrX 15,743,376C. elegans NHR-255 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000679 (Zinc finger, GATA-type), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
16F27E11.1F27E11.1n/achrV 3,464,980contains similarity to Pfam domains PF01773 (Na+ dependent nucleoside transporter N-terminus) , PF07670 (Nucleoside recognition) , PF07662 (Na+ dependent nucleoside transporter C-terminus) contains similarity to Interpro domains IPR008276 (Concentrative nucleoside transporter), IPR002668 (Na+ dependent nucleoside transporter), IPR011657 (Na+ dependent nucleoside transporter, C-terminal), IPR011642 (Nucleoside recognition)
17lev-8C35C5.5n/achrX 11,562,231lev-8 encodes a novel nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) alpha subunit that is a member of the ACR-8 group of nAChR subunits; LEV-8 activity is required for normal rates of pharyngeal pumping and for fully wild-type responses (increased egg laying and body wall muscle contraction) to the nAChR agonist and antihelmintic levamisole; expression of a LEV-8::GFP reporter construct begins at the L1 larval stage and is detected in neurons, body wall and uterine muscle cells, and socket cells of the IL and OL mechanosensory neurons; expression in body wall muscles is strongest in the anterior, consistent with increased levamisole resistance of head, or anterior, muscles seen in lev-8 mutant animals.
18tag-224B0496.8n/achrIV 7,450,248tag-224 encodes an ortholog of Drosophila CG6522-PA and of human LMCD1 and TESTIN; TAG-224 is dispensable for Wnt-directed planar cell polarity and the fully asymmetrical division of B.a versus B.p cells.
19rom-2C48B4.2n/achrIII 9,593,829C. elegans ROM-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF01694 (Rhomboid family) , PF00036 (EF hand) contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR002610 (Peptidase S54, rhomboid), IPR017213 (Peptidase S54, rhomboid, metazoan)
20C03A3.3C03A3.3n/achrX 11,268,134contains similarity to Pfam domain PF00753 Metallo-beta-lactamase superfamily contains similarity to Interpro domain IPR001279 (Beta-lactamase-like)
21T02G6.3T02G6.3n/achrI 11,814,056contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 2 of Q86UP2 Kinectin; ENSEMBL:ENSP00000337744
22T21D12.7T21D12.7n/achrIV 290,077contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR013090 (Phospholipase A2, active site), IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
23R07D5.2R07D5.2n/achrX 15,113,200contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR008979 (Galactose-binding like)
24ZK470.1ZK470.1n/achrX 4,166,695contains similarity to Interpro domain IPR007248 (Mpv17/PMP22)
25C49C3.8C49C3.8n/achrIV 17,335,930contains similarity to Interpro domains IPR006570 (SPK), IPR009057 (Homeodomain-like)
26Y39A1A.7Y39A1A.7n/achrIII 10,619,501contains similarity to Sus scrofa Lymphocyte antigen 64-like protein.; TR:Q7YRL4
27C32B5.5C32B5.5n/achrII 974,906contains similarity to Pfam domain PF00646 F-box domain
28Y44A6D.3Y44A6D.3n/achrV 20,786,983contains similarity to Interpro domain IPR009057 (Homeodomain-like)
29R07A4.4R07A4.4n/achrX 10,753,200contains similarity to Pfam domain PF00024 PAN domain contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
30nhr-44T19A5.4n/achrV 8,962,974C. elegans NHR-44 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
31R10E11.5R10E11.5n/achrIII 9,787,703contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ77065, highly similar to Homo sapiens golgi autoantigen, golgin subfamily a, 4 (GOLGA4), mRNA; ENSEMBL:ENSP00000349305
32C39B10.5C39B10.5n/achrX 10,447,468contains similarity to Saccharomyces cerevisiae bZIP protein; transcription factor; SGD:YIR018W
33T21B4.3T21B4.3n/achrII 12,495,897contains similarity to Pfam domain PF01681 C6 domain contains similarity to Interpro domain IPR002601 (Protein of unknown function C6)
34let-23ZK1067.1n/achrII 9,202,659let-23 encodes an EGF-receptor-family transmembrane tyrosine kinase that affects viability, inductive signaling during development of the vulva, male spicule formation, posterior development of the epidermis, ovulation and behavioral quiescience during lethargus; it is genetically upstream of the let-60/RAS pathway with respect to viability and vulval development, is upstream of phosopholipase C gamma with respect to fertility and quiesence, and is expressed in vulval precursor cells and the ALA neuron.
35C17H1.4C17H1.4n/achrI 13,111,470contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Smooth muscle caldesmon, putative.; TR:A2FBI1
36his-45B0035.10n/achrIV 11,326,794his-45 encodes an H3 histone.
37F11A5.8F11A5.8n/achrV 16,208,396contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
38F15A4.5F15A4.5n/achrII 12,470,242contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8ICX2
39Y102A5C.27Y102A5C.27n/achrV 16,988,446contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
40C08H9.6C08H9.6n/achrII 9,873,847contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
41F53B7.2F53B7.2n/achrV 10,993,353F53B7.2 encodes a homolog of the functionally active Fmrf Receptor (FR; CG2114) of D. melanogaster; it is thus possible that F53B7.2 is a receptor for one of the FMRF-like neurotransmitters in C. elegans (e.g., FLP-1 through FLP-12).
42F37E3.2F37E3.2n/achrI 6,427,369contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype)
43fbxb-53F36H5.5n/achrII 1,759,512This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
44K04C1.3K04C1.3n/achrX 14,242,549contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR001766 (Fork head transcription factor)
45R08B4.3R08B4.3n/achrX 11,119,911contains similarity to Homo sapiens 23 kDa protein; VG:OTTHUMP00000170038
46srh-129F14F9.7n/achrV 5,143,034C. elegans SRH-129 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001036 (Acriflavin resistance protein), IPR010916 (TonB box, conserved site)
47cyp-34A4T09H2.1n/achrV 3,950,999C. elegans CYP-34A4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
48pes-1T28H11.4n/achrIV 5,004,039C. elegans PES-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00250 Fork head domain contains similarity to Interpro domains IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR001766 (Fork head transcription factor)
49srd-9T09D3.1n/achrV 5,352,409C. elegans SRD-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
50F38B6.6F38B6.6n/achrX 6,687,229contains similarity to Pfam domains PF07719 (Tetratricopeptide repeat) (4), PF08409 (Domain of unknown function (DUF1736)) , PF00515 (Tetratricopeptide repeat) (5)contains similarity to Interpro domains IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR013618 (Region of unknown function DUF1736), IPR008940 (Protein prenyltransferase), IPR001440 (Tetratricopeptide TPR-1), IPR013105 (Tetratricopeptide TPR2), IPR013026 (Tetratricopeptide region)