UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F45G2.10F45G2.103e-89chrIII 13,438,200contains similarity to Pfam domain PF01883 Domain of unknown function DUF59 contains similarity to Interpro domain IPR002744 (Protein of unknown function DUF59)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3R06A10.4R06A10.4n/achrI 1,092,733contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
4C53B7.6C53B7.6n/achrX 6,868,654
5srz-15C32H11.2n/achrIV 12,916,637C. elegans SRZ-15 protein ;
6Y6B3B.4Y6B3B.4n/achrI 13,765,684contains similarity to Interpro domain IPR000533 (Tropomyosin)
7srh-200F07C4.13n/achrV 7,652,983C. elegans SRH-200 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8T03F7.6T03F7.6n/achrV 11,295,604contains similarity to Interpro domain IPR001036 (Acriflavin resistance protein)
9F38A1.13F38A1.13n/achrIV 1,265,538
10Y57G11A.3Y57G11A.3n/achrIV 14,502,754contains similarity to Pfam domain PF00412 LIM domain contains similarity to Interpro domain IPR001781 (Zinc finger, LIM-type)
11K03D10.3K03D10.3n/achrI 14,122,952The K03D10.3 gene encodes a MYST acetyltransferase orthologous to the Drosophila MALES-ABSENT-ON-THE-FIRST (MOF) and CG1894 proteins, the human MOF protein, and the S. cerevisiae SAS2 protein.
12clec-177E03H12.2n/achrIV 4,987,125C. elegans CLEC-177 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
13mbr-1T01C1.2n/achrX 10,720,732C. elegans MBR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF05225 helix-turn-helix, Psq domain contains similarity to Interpro domains IPR011526 (Helix-turn-helix, Psq-like), IPR007889 (Helix-turn-helix, Psq)
14lin-1C37F5.1n/achrIV 2,288,106lin-1 encodes an Ets-domain-containing transcription factor that is a member of the ETS gene family that includes human ELK1, 3, and 4 (OMIM:600247); LIN-1 functions as a general effector of MAP kinase-mediated signaling; when MAP kinase is inactive, LIN-1 forms a complex with LIN-31/WH that inhibits vulval cell fate specification; upon MAP kinase activation (vulval induction), LIN-1 is phosphorylated, dissociates from LIN-31, and becomes inactive, thus allowing for vulval development.
15K02D7.5K02D7.5n/achrIV 309,359contains similarity to Pfam domain PF03083 MtN3/saliva family contains similarity to Interpro domain IPR004316 (MtN3 and saliva related transmembrane protein)
16F49E12.8F49E12.8n/achrII 8,393,450contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0335; TR:O15044
17srv-11H25K10.3n/achrIV 16,220,615C. elegans SRV-11 protein; contains similarity to Pfam domains PF01461 (7TM chemoreceptor) , PF01748 (Caenorhabditis serpentine receptor-like protein) contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
18C33C12.9C33C12.9n/achrII 2,188,303contains similarity to Pfam domain PF05175 Methyltransferase small domain contains similarity to Interpro domains IPR007848 (Methyltransferase small), IPR004557 (Putative methylase), IPR002296 (N6 adenine-specific DNA methyltransferase, N12 class), IPR002052 (N-6 adenine-specific DNA methylase, conserved site)
19srv-34F13A7.3n/achrV 16,373,569C. elegans SRV-34 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000355 (Chemokine receptor)
20C53A5.11C53A5.11n/achrV 14,563,580contains similarity to Pfam domains PF01344 (Kelch motif) (5), PF07646 (Kelch motif) (3)contains similarity to Interpro domains IPR011043 (Galactose oxidase/kelch, beta-propeller), IPR000209 (Peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin), IPR006652 (Kelch repeat type 1), IPR011498 (Kelch repeat type 2), IPR015916 (Galactose oxidase, beta-propeller), IPR013089 (Kelch related), IPR006651 (Kelch), IPR015915 (Kelch-type beta propeller)
21T21D11.1T21D11.1n/achrIII 7,246,672contains similarity to Pfam domain PF00413 Matrixin contains similarity to Interpro domains IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR001818 (Peptidase M10A and M12B, matrixin and adamalysin)
22ing-3Y51H1A.4n/achrII 13,879,211Y51H1A.4 is orthologous to the human gene P33ING1B (ING1; OMIM:601566), which when mutated leads to disease.
23H03G16.1H03G16.1n/achrX 15,054,187contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
24K06A4.4K06A4.4n/achrV 9,502,894contains similarity to Pfam domain PF03083 MtN3/saliva family contains similarity to Interpro domain IPR004316 (MtN3 and saliva related transmembrane protein)
25F52D1.2F52D1.2n/achrX 447,631
26T06G6.5T06G6.5n/achrI 12,716,111contains similarity to Interpro domain IPR007087 (Zn-finger, C2H2 type)
27nhr-227T27B7.5n/achrV 2,286,399C. elegans NHR-227 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
28T01B10.5T01B10.5n/achrX 8,496,580
29F36D1.8F36D1.8n/achrI 11,257,879contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
30Y116A8C.22Y116A8C.22n/achrIV 17,047,371contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR000116 (High mobility group proteins HMG-I and HMG-Y), IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
31math-39T08E11.2n/achrII 1,832,929C. elegans MATH-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
32T10E9.8T10E9.8n/achrI 6,540,502
33F09G8.5F09G8.5n/achrIII 8,256,200contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR003603 (U2A'/phosphoprotein 32 family A, C-terminal), IPR010916 (TonB box, conserved site)
34W03A5.6W03A5.6n/achrIII 5,440,330
35ZK470.4ZK470.4n/achrX 4,139,617
36srw-73T03E6.6n/achrV 16,587,756C. elegans SRW-73 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
37ptc-2F21H12.4n/achrII 6,084,701ptc-2 encodes an ortholog of Drosophila PATCHED (PTC) and human PTCH (OMIM:601309, mutated in basal cell nevus syndrome), which defines one of seven paralogous families of sterol sensing domain (SSD) proteins; PTC-2 is required for normal fat storage; PTC-2 is also required for normal egg osmotic integrity, locomotion, egg laying, and viability in mass RNAi assays.
38ZK892.3ZK892.3n/achrII 10,002,830contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005829 (Sugar transporter, conserved site), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
39Y54E2A.6Y54E2A.6n/achrII 14,768,030contains similarity to Pfam domains PF00270 (DEAD/DEAH box helicase) (2), PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) (2), PF02889 (Sec63 Brl domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR011545 (DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal), IPR004179 (Sec63), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
40clec-178T19E7.1n/achrIV 5,654,480C. elegans CLEC-178 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
41fbxb-76H02I12.2n/achrIV 11,378,732This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
42C10E2.4C10E2.4n/achrX 16,750,349
43K08B5.2K08B5.2n/achrX 16,552,470
44C39B10.4C39B10.4n/achrX 10,445,432contains similarity to Brachydanio rerio Similar to synaptonemal complex protein 1 (Fragment).; TR:Q7ZVL0
45Y47H9C.7Y47H9C.7n/achrI 11,892,653Y47H9C.7 is orthologous to the human gene EUKARYOTIC TRANSLATION INITIATION FACTOR 2B, SUBUNIT 2 (BETA, 39KD) (EIF2B2; OMIM:606454), which when mutated leads to disease.
46F58F6.3F58F6.3n/achrIV 1,375,965
47srh-118K03D7.6n/achrV 17,495,205C. elegans SRH-118 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48rod-1F55G1.4n/achrIV 7,481,969C. elegans ROD-1 protein ; contains similarity to Caenorhabditis remanei Putative RoughDeal (Fragment).; TR:Q4TTM7
49srt-65C03A7.10n/achrV 5,171,907C. elegans SRT-65 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
50nas-1F45G2.1n/achrIII 13,407,525nas-1 encodes an astacin-like metalloprotease.