UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F45C12.1F45C12.10chrII 1,740,047contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domains IPR000494 (EGF receptor, L domain), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
2fbxa-223ZC513.10n/achrV 8,064,176fbxa-223 encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; FBXA-223 also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
3Y56A3A.9Y56A3A.9n/achrIII 11,884,269contains similarity to Interpro domains IPR015706 (RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase), related), IPR000694 (Proline-rich region)
4C50D2.6C50D2.6n/achrII 86,096
5F53F4.2F53F4.2n/achrV 13,589,230contains similarity to Hordeum vulgare Glycine-rich cell wall structural protein precursor.; SW:P17816
6Y113G7B.15Y113G7B.15n/achrV 20,226,741contains similarity to Pfam domains PF08246 (Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)) , PF00112 (Papain family cysteine protease) contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site), IPR013201 (Proteinase inhibitor I29, cathepsin propeptide), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
7T06G6.4T06G6.4n/achrI 12,713,797contains similarity to Arabidopsis thaliana Synaptonemal complex protein 1 (Synaptonemal complex central regionsprotein ZYP1a).; SW:Q9LME2
8spe-19Y113G7A.10n/achrV 20,039,581C. elegans SPE-19 protein ;
9C29F5.5C29F5.5n/achrII 6,297,911
10srj-50T03D3.2n/achrV 2,833,942C. elegans SRJ-50 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11R05A10.7R05A10.7n/achrIV 14,161,499contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
12K06A4.6K06A4.6n/achrV 9,480,821contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Synaptojanin-like protein; SGD:YOR109W
13F47C12.7F47C12.7n/achrIV 3,994,654contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
14C34G6.3C34G6.3n/achrI 5,897,020contains similarity to Interpro domain IPR005819 (Histone H5)
15C12D5.9C12D5.9n/achrV 7,689,147contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
16nhr-39F44A2.4n/achrV 9,303,947C. elegans NHR-39 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
17acc-4T27E9.9n/achrIII 13,482,337C. elegans ACC-4 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
18C17H12.6C17H12.6n/achrIV 6,821,899contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
19Y8A9A.2Y8A9A.2n/achrII 3,798,109contains similarity to Pfam domain PF00090 Thrombospondin type 1 domain contains similarity to Interpro domains IPR008085 (Thrombospondin, subtype 1), IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR000694 (Proline-rich region)
20srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21ZC132.2ZC132.2n/achrV 4,311,620
22F47F6.4F47F6.4n/achrII 1,262,570
23clec-55F08H9.9n/achrV 14,480,717C. elegans CLEC-55 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) (2), PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
24K02H11.6K02H11.6n/achrV 1,534,154contains similarity to Pfam domains PF00085 (Thioredoxin) , PF08534 (Redoxin) , PF00578 (AhpC/TSA family) contains similarity to Interpro domains IPR011594 (Thioredoxin-like), IPR013740 (Redoxin), IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR000866 (Alkyl hydroperoxide reductase/ Thiol specific antioxidant/ Mal allergen), IPR013766 (Thioredoxin domain), IPR006662 (Thioredoxin-related)
25Y54E5A.3Y54E5A.3n/achrI 14,698,399contains similarity to Escherichia coli Orf732.; TR:Q46767
26cwp-5F48C11.2n/achrX 13,184,746C. elegans CWP-5 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
27C35A11.2C35A11.2n/achrV 5,387,617
28Y69H2.11Y69H2.11n/achrV 18,644,329contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (6), PF00858 (Amiloride-sensitive sodium channel) contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
29F46B6.10F46B6.10n/achrV 9,801,717contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein; TR:Q96QJ8
30F41D3.6F41D3.6n/achrI 12,265,384contains similarity to Pfam domain PF01531 Glycosyl transferase family 11 contains similarity to Interpro domain IPR002516 (Glycosyl transferase, family 11)
31npr-9ZK455.3n/achrX 11,330,259C. elegans NPR-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR001556 (Bombesin receptor), IPR009144 (Thyrotropin-releasing hormone receptor), IPR000586 (Somatostatin receptor), IPR000405 (Galanin receptor), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
32ZC504.1ZC504.1n/achrX 10,408,560contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
33srz-10ZK1037.11n/achrV 15,308,296C. elegans SRZ-10 protein ;
34sro-1D1022.6n/achrII 7,461,799C. elegans SRO-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
35tbx-33Y66A7A.8n/achrIII 11,635,769C. elegans TBX-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF00907 T-box contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR001699 (Transcription factor, T-box)
36str-39F37B4.12n/achrV 2,878,851C. elegans STR-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002355 (Multicopper oxidase, copper-binding site)
37F26A1.3F26A1.3n/achrIII 4,827,878contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
38F18C5.4F18C5.4n/achrII 6,564,443contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
39C45G9.11C45G9.11n/achrIII 5,066,320
40C43F9.5C43F9.5n/achrIV 10,590,044contains similarity to Interpro domain IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
41cwp-3C37H5.4n/achrV 4,843,326cwp-3 encodes an unfamiliar protein predicted to be secreted and alleged to be coexpressed with polycystins; CWP-3 is dispensable for viability and gross morphology in mass RNAi screens.
42B0524.3B0524.3n/achrIII 1,888,918
43C11E4.4C11E4.4n/achrX 9,594,806contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
44T23G4.4T23G4.4n/achrIV 13,675,781contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
45C08G5.3C08G5.3n/achrII 744,119contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
46C35E7.6C35E7.6n/achrI 10,818,223
47Y18D10A.2Y18D10A.2n/achrI 12,808,033contains similarity to Pfam domain PF03227 Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase (GILT) contains similarity to Interpro domain IPR004911 (Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase GILT)
48clec-3C41H7.7n/achrII 3,018,651C. elegans CLEC-3 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
49Y38H6C.18Y38H6C.18n/achrV 20,542,275contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Chromatin Assembly Complex, subunit 1: largest (p90) subunit of three-subunit protein complex (yeast CAF-I) involved in DNA-replication-linked nucleosome assembly. Homol. to p150 subunit human Chromatin Assembly Factor-I (CAF-I); SGD:YPR018W
50H38K22.4H38K22.4n/achrIII 4,323,189contains similarity to Interpro domain IPR010070 ()