UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F44G4.6F44G4.61.9999999999999998e-100chrII 9,001,316contains similarity to Interpro domain IPR001209 (Ribosomal protein S14)
2F47B10.8F47B10.8n/achrX 10,905,841contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
3cyp-34A7B0213.12n/achrV 3,962,772C. elegans CYP-34A7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
4egl-20W08D2.1n/achrIV 9,813,959egl-20 encodes a member of the WNT family of developmental signaling proteins that affects migration of QL and QR and their descendents; expressed in muscle and epidermal cells at the posterior of the worm.
5F26A1.8F26A1.8n/achrIII 4,821,475contains similarity to Interpro domain IPR000010 (Proteinase inhibitor I25, cystatin)
6ubc-22C06E2.7n/achrX 8,868,414ubc-22 encodes an E2 ubiquitin-conjugating enzyme orthologous to Saccharomyces cerevisiae UBC8 and human UBC1/HIP2 (Huntingtin interacting protein 2, OMIM:602846) which are involved in regulating fructose-1,6-bisphosphatase and huntingtin catabolism, respectively; by homology, UBC-22 is likely required for covalent attachment of ubiquitin to select target proteins to facilitate their degradation; however, as loss of UBC-22 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of UBC-22 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
7ilys-4C55F2.2n/achrIV 7,896,569C. elegans ILYS-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF05497 Destabilase contains similarity to Interpro domain IPR008597 (Destabilase)
8K02F6.5K02F6.5n/achrII 2,535,834contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
9lpr-2T12A7.5n/achrIV 11,783,102C. elegans LPR-2 protein; contains similarity to Interpro domains IPR012674 (Calycin), IPR011038 (Calycin-like), IPR002345 (Lipocalin)
10C55A1.7C55A1.7n/achrV 15,647,283contains similarity to Escherichia coli TolA protein.; SW:TOLA_ECOLI
11F36D4.4F36D4.4n/achrV 9,404,118contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
12F10G2.7F10G2.7n/achrV 7,335,453contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
13mec-9C50H2.3n/achrV 9,911,331mec-9 encodes a predicted extracellular protein containing six EGF-like repeats,five Kunitz-type protease inhibitor domains, and a glutamic acid-rich region possibly involved in protein-protein interactions; mec-9 encodes two proteins, only one of which, MEC-9L, appears to be required for normal mechanosensory response to gentle touch and proper functioning of the touch receptor neurons; mec-9 interacts genetically with mec-5, which encodes a unique C. elegans collagen secreted by the hypodermis; MEC-9L is expressed and secreted by the touch receptor neurons.
14Y37H2C.1Y37H2C.1n/achrV 18,275,256contains similarity to Homo sapiens SIDT1 protein; ENSEMBL:ENSP00000377416
15Y43F8C.5Y43F8C.5n/achrV 19,631,978contains similarity to Dictyostelium discoideum Myb-like protein (Fragment).; SW:MYBH_DICDI
16tig-2F39G3.8n/achrV 4,728,435The tig-2 gene, like dbl-1, daf-7, and unc-129, encodes a TGF-beta-like protein.
17ZK218.5ZK218.5n/achrV 17,101,526contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
18M03E7.1M03E7.1n/achrV 5,624,123contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
19C13A10.2C13A10.2n/achrII 1,357,598
20K03B4.4K03B4.4n/achrV 4,684,430contains similarity to Interpro domain IPR002411 (Cereal allergen/alpha-amylase inhibitor, rice-type)
21C49G7.6C49G7.6n/achrV 4,041,399
22odr-3C34D1.3n/achrV 13,248,189odr-3 encodes a G protein alpha subunit; odr-3 activity is required for normal chemotaxis, odorant avoidance, and nociceptive function as well as cilium morphogenesis in chemosensory neurons; an ODR-3::GFP is expressed in five pairs of sensory neurons AWA, AWB, AWC, ASH, and ADF; the AWC neurons consistently express GFP most strongly, while the AWB neurons express at lower levels and the AWA, ASH, and ADF neurons express only weakly; in AWC neurons, ODR-3::GFP localizes to cilia which have a characteristic wing-shaped morphology.
23F58B4.4F58B4.4n/achrV 10,931,009contains similarity to Plasmodium yoelii Rhoptry protein.; TR:Q26216
24C49G9.1C49G9.1n/achrI 12,565,152contains similarity to Fugu rubripes Wilms tumour gene.; TR:O93433
25Y42A5A.1Y42A5A.1n/achrV 11,093,039contains similarity to Pfam domain PF01433 Peptidase family M1 contains similarity to Interpro domains IPR014782 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase, N-terminal), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001930 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase)
26R10H10.4R10H10.4n/achrIV 10,394,780contains similarity to Arabidopsis thaliana T15B16.1 protein.; TR:Q9ZSH8
27F10F2.4F10F2.4n/achrIII 4,624,572contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR000483 (Cysteine-rich flanking region, C-terminal), IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype)
28sue-1F07A5.5n/achrI 7,365,960C. elegans SUE-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00008 EGF-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
29F35H10.3F35H10.3n/achrIV 8,326,450
30C50C3.5C50C3.5n/achrIII 8,179,701contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR001125 (Recoverin), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin)), IPR000261 (EPS15 homology (EH))
31ZK816.1ZK816.1n/achrX 3,359,733
32H04M03.12H04M03.12n/achrIV 5,900,480
33ZC239.3ZC239.3n/achrII 3,216,335contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
34clec-10C03H5.1n/achrII 403,400C. elegans CLEC-10 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002345 (Lipocalin), IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
35C32B5.11C32B5.11n/achrII 949,051
36ZC15.1ZC15.1n/achrV 20,302,899contains similarity to Interpro domains IPR001878 (Zn-finger, CCHC type), IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
37R04F11.1R04F11.1n/achrV 12,309,572R04F11.1 encodes a claudin homolog that may be required for normal cohesion of apical junctions in epithelia; R04F11.1 is worm-specific, with obvious homologs only in C. elegans; R04F11.1 has no obvious function in mass RNAi assays; claudins are integral membrane proteins with four transmembrane sequences that are found in mammalian tight junctions (TJs), induce TJs when transgenically expressed in cells normally lacking them, and can mediate the specific conductance of of specific ions (e.g., magnesium or calcium) through TJs while blocking the flow of water.
38C30B5.7C30B5.7n/achrII 6,225,999contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR003944 (Protease-activated receptor 4)
39T25B6.4T25B6.4n/achrX 9,016,157
40C24D10.8C24D10.8n/achrIV 5,165,608n/a
41C02B8.7C02B8.7n/achrX 8,137,743
42pqn-97ZK488.10n/achrV 609,465The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
43srj-15Y40B10B.2n/achrV 1,963,860C. elegans SRJ-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002120 (Thyrotrophin-releasing hormone receptor)
44Y47D3B.3Y47D3B.3n/achrIII 11,400,137contains similarity to Homo sapiens Low-density lipoprotein receptor-related protein 2 precursor; ENSEMBL:ENSP00000263816
45glc-3ZC317.3n/achrV 5,451,485The glc-3 gene encodes a fipronil and BIDN-sensitive, but picrotoxinin-insensitive, L-glutamate-gated chloride channel subunit.
46D2062.1D2062.1n/achrII 2,632,264contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
47F10E9.1F10E9.1n/achrIII 8,323,702
48C26F1.6C26F1.6n/achrV 7,772,218C26F1.6 encodes a homolog of the functionally active Fmrf Receptor (FR; CG2114) of D. melanogaster; it is thus possible that C26F1.6 is a receptor for one of the FMRF-like neurotransmitters in C. elegans (e.g., FLP-1 through FLP-12).
49clec-211F19F10.6n/achrV 7,560,915C. elegans CLEC-211 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
50F40G9.8F40G9.8n/achrIII 164,235