UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1tba-4F44F4.110chrII 10,919,367tba-4 encodes a member of the alpha tubulin family that also includes tba-1, tba-2, and tba-3, and affects embryonic viability.
2ech-6T05G5.6n/achrIII 9,752,184C. elegans ECH-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00378 Enoyl-CoA hydratase/isomerase family contains similarity to Interpro domains IPR014748 (Crontonase, C-terminal), IPR001753 (Crotonase, core)
3F58B4.5F58B4.5n/achrV 10,933,422contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
4T07C4.1T07C4.1n/achrIII 10,356,696T07C4.1 is orthologous to the human gene URIDINE MONOPHOSPHATE SYNTHETASE (OROTATE PHOSPHORIBOSYL TRANSFERASE AND OROTIDINE-5'-DECARBOXYLASE) (UMPS; OMIM:258900), which when mutated leads to disease.
5T02G5.4T02G5.4n/achrII 7,083,184contains similarity to Pfam domains PF02803 (Thiolase, C-terminal domain) , PF00108 (Thiolase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR016038 (Thiolase-like, subgroup), IPR002155 (Thiolase), IPR016039 (Thiolase-like)
6F28A10.6F28A10.6n/achrII 847,752contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
7ugt-8H23N18.3n/achrV 4,904,931C. elegans UGT-8 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
8col-154F55C10.2n/achrV 11,385,847C. elegans COL-154 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
9col-149B0024.1n/achrV 10,292,253C. elegans COL-149 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
10col-157T11F9.9n/achrV 11,484,503C. elegans COL-157 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000381 (Inhibin, beta B subunit), IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
11dct-16Y38H6C.1n/achrV 20,493,883C. elegans DCT-16 protein ;
12T25C12.3T25C12.3n/achrX 11,495,472contains similarity to Pfam domains PF00092 (von Willebrand factor type A domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR011162 (MHC classes I and II-like antigen recognition), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR001304 (C-type lectin), IPR006582 (Region of unknown fuction MD, Caenorhabditis elegans), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
13Y40D12A.2Y40D12A.2n/achrIII 6,613,768contains similarity to Pfam domain PF00450 Serine carboxypeptidase contains similarity to Interpro domain IPR001563 (Peptidase S10, serine carboxypeptidase)
14spl-1Y66H1B.4n/achrIV 381,542C. elegans SPL-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00282 (Pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain) , PF00266 (Aminotransferase class-V) contains similarity to Interpro domains IPR002129 (Pyridoxal phosphate-dependent decarboxylase), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR000192 (Aminotransferase, class V/Cysteine desulphurase), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
15unc-27ZK721.2n/achrX 8,789,978unc-27 encodes a troponin I isoform; unc-27 is required for coordinated motility and normal muscle morphology; structural analyses indicate that unc-27 is required for proper sarcomeric organization; unc-27/troponin I interacts with the body wall and pharynx types of troponin C; expression studies show that unc-27 is expressed in body wall, vulval and anal muscles.
16F47B10.1F47B10.1n/achrX 10,898,993contains similarity to Pfam domains PF08442 (ATP-grasp domain) , PF00549 (CoA-ligase) contains similarity to Interpro domains IPR013650 (ATP-grasp fold, succinyl-CoA synthetase-type), IPR005811 (ATP-citrate lyase/succinyl-CoA ligase), IPR005809 (Succinyl-CoA synthetase, beta subunit), IPR013815 (ATP-grasp fold, subdomain 1), IPR013816 (ATP-grasp fold, subdomain 2), IPR016102 (Succinyl-CoA synthetase-like)
17apy-1F08C6.6n/achrX 7,568,879C. elegans APY-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF06079 Apyrase contains similarity to Interpro domain IPR009283 (Apyrase)
18sur-5K03A1.5n/achrX 7,303,412sur-5 encodes a protein with high similarity to H. sapiens Acetoacetyl-coenzyme A synthetase; sur-5 negatively regulates let-60 during vulval induction, based on genetic analysis, and genetically synergises with lin-45 with respect to larval death, uncoordinated movement and egg-laying defects; sur-5 is strongly expressed in most cells of C. elegans, including the VPCs and is localized primarily to the nucleus.
19pgk-1T03F1.3n/achrI 3,868,329T03F1.3 is orthologous to the human gene PHOSPHOGLYCERETE KINASE 1 (PGK1; OMIM:311800), which when mutated leads to hemolytic anemia and neurologic disturbances.
20T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
21T16G1.6T16G1.6n/achrV 12,936,341contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
22Y48E1B.8Y48E1B.8n/achrII 13,587,287contains similarity to Pfam domain PF03407 Protein of unknown function (DUF271) contains similarity to Interpro domain IPR005069 (Protein of unknown function DUF271)
23fbxa-72F31F4.15n/achrV 675,834C. elegans FBXA-72 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
24F54D5.4F54D5.4n/achrII 11,570,295contains similarity to Haemonchus contortus NIM-2 protein.; TR:Q4QYX5
25F08A8.2F08A8.2n/achrI 12,944,409contains similarity to Pfam domains PF01756 (Acyl-CoA oxidase) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) contains similarity to Interpro domains IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR012258 (Acyl-CoA oxidase), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR002655 (Acyl-CoA oxidase, C-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal)
26pas-4C36B1.4n/achrI 8,727,906pas-4 encodes a proteasome alpha-type seven subunit of the core 20S proteasome subcomplex; loss of pas-4 activity via RNAi results in a wide variety of defects including embryonic and larval lethality, sterility, abnormal locomotion, slow growth, and abnormal transgene expression and subcellular localization; loss of pas-4 activity also results in activation of SKN-1, a transcription factor required in adult worms for the acute response to oxidative stress and maternally for embryonic development.
27R07H5.8R07H5.8n/achrIV 11,210,138contains similarity to Pfam domain PF00294 pfkB family carbohydrate kinase contains similarity to Interpro domains IPR011611 (Carbohydrate/purine kinase), IPR002139 (Ribokinase), IPR001805 (Adenosine kinase), IPR002173 (Carbohydrate/puine kinase, PfkB, conserved site)
28col-150B0024.2n/achrV 10,294,098C. elegans COL-150 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
29ile-1K07A1.8n/achrI 9,610,665ile-1 is orthologous to the human gene human ERGIC-53, which when mutated leads to deficiency of coagulation factors V/VIII (OMIM:227300).
30F57F5.1F57F5.1n/achrV 12,003,793contains similarity to Pfam domain PF00112 Papain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
31col-155F55C10.3n/achrV 11,389,359C. elegans COL-155 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
32lbp-7T22G5.2n/achrV 13,879,814lbp-7 encodes a predicted intracellular fatty acid binding protein (iFABP) that is most similar to the vertebrate muscle and heart FABPs; by homology, LBP-7 is predicted to function as an intracellular transporter for small hydrophobic molecules such as lipids and steroid hormones; as loss of lbp-7 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of LBP-7 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
33F27D4.1F27D4.1n/achrI 7,703,501The F27D4.1 gene encodes an ortholog of the human gene ELECTRON-TRANSFER-FLAVOPROTEIN, ALPHA POLYPEPTIDE (ETFA), which when mutated leads to glutaricaciduria type IIA (OMIM:231680).
34pbs-2C47B2.4n/achrI 12,967,737C. elegans PBS-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00227 Proteasome A-type and B-type contains similarity to Interpro domains IPR001353 (20S proteasome, A and B subunits), IPR016050 (Proteasome, beta-type subunit, conserved site), IPR000243 (Peptidase T1A, proteasome beta-subunit)
35C26B9.5C26B9.5n/achrX 5,330,863contains similarity to Pfam domain PF05577 Serine carboxypeptidase S28 contains similarity to Interpro domain IPR008758 (Peptidase S28)
36ugt-46B0310.5n/achrX 528,055C. elegans UGT-46 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
37cyp-35A1C03G6.14n/achrV 7,360,867C. elegans CYP-35A1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR001756 (ATPase, P-type copper-transporter)
38clec-57F08H9.6n/achrV 14,470,810C. elegans CLEC-57 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) (2), PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
39R13F6.10R13F6.10n/achrIII 6,867,259contains similarity to Interpro domain IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical)
40ZK662.2ZK662.2n/achrX 15,697,316contains similarity to Homo sapiens Metallothionein-IL; ENSEMBL:ENSP00000290704
41nhr-81C47F8.8n/achrI 12,328,787C. elegans NHR-81 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
42ZK1307.8ZK1307.8n/achrII 9,625,448contains similarity to Pfam domains PF07915 (Glucosidase II beta subunit-like protein) , PF00036 (EF hand) contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR001907 (Peptidase S14, ClpP), IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich), IPR009011 (Mannose-6-phosphate receptor, binding), IPR000886 (Endoplasmic reticulum, targeting sequence), IPR012913 (Glucosidase II beta subunit-like)
43T08B1.1T08B1.1n/achrV 1,984,861contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR000817 (Prion protein), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
44F25B4.1F25B4.1n/achrV 5,713,763F25B4.1 is orthologous to the human gene GLYCINE CLEAVAGE SYSTEM T-PROTEIN (AMT; OMIM:238310), which when mutated leads to glycine encephalopathy.
45rpl-4B0041.4n/achrI 4,646,348rpl-4 encodes a large ribosomal subunit L4 protein.
46gfi-1F57F4.3n/achrV 6,396,213gfi-1 encodes a protein that contains 21 ET modules; interacts with unc-68 in yeast two-hybrid assays.
47nhx-2B0495.4n/achrII 7,692,262nhx-2 encodes a sodium/proton exchanger expressed in the apical membranes of intestinal cells; NHX-2 is required for normally high growth rates, and for propagation or maintenance of the germline, NHX-2 is thought to prevent intracellular acidification by catalysing the electroneutral exchange of extracellular sodium for an intracellular proton.
48col-130F08G5.4n/achrIV 12,427,979C. elegans COL-130 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (3)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
49W04G3.5W04G3.5n/achrX 11,074,823contains similarity to Pfam domain PF00156 Phosphoribosyl transferase domain contains similarity to Interpro domains IPR005946 (Phosphoribosyl pyrophosphokinase), IPR000836 (Phosphoribosyltransferase)
50ZK1025.2ZK1025.2n/achrI 11,450,904contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)