UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1nhr-37F44C4.20chrV 6,623,464C. elegans NHR-37 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
2F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
3T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
4srd-4ZK863.5n/achrV 12,185,574C. elegans SRD-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
5srz-100T25E12.11n/achrV 16,732,494C. elegans SRZ-100 protein ;
6ref-1T01E8.2n/achrII 10,219,169ref-1 encodes a protein with two basic helix-loop-helix (bHLH) domains that is distantly related to the hairy/Enhancer of split subfamily of bHLH transcription factors; REF-1 is required in hermaphrodites during early larval development for regulating the pattern of posterior Pn.p hypodermal cell fusions, primarily through regulation of MAB-5 homeodomain protein activity; REF-1 is also required for head morphogenesis and specification of the V6 lateral seam cell fate; in males, ref-1 is a target of MAB-3 transcriptional repression which in turn, promotes expression of LIN-32, a proneural bHLH transcription factor.
7C31H5.6C31H5.6n/achrI 9,045,096contains similarity to Pfam domains PF08840 (BAAT / Acyl-CoA thioester hydrolase C terminal) , PF04775 (Acyl-CoA thioester hydrolase / Bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase) contains similarity to Interpro domains IPR006862 (Acyl-CoA thioester hydrolase/bile acid-CoA amino acid N-acetyltransferase), IPR014940 (BAAT/Acyl-CoA thioester hydrolase C-terminal), IPR016662 (Acyl-CoA thioesterase, long chain)
8C01G6.4C01G6.4n/achrII 9,272,092contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
9T28F4.4T28F4.4n/achrI 7,488,371contains similarity to Brugia malayi Putative uncharacterized protein BMBAC01P19.05a.; TR:Q8IHI4
10T09D3.3T09D3.3n/achrV 5,348,079contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
11srh-291Y94A7B.3n/achrV 17,807,015C. elegans SRH-291 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
12E03H4.5E03H4.5n/achrI 12,414,766contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
13acl-1F59F4.4n/achrX 15,850,758acl-1 encodes a 1-acyl-sn-glycerol-3-phosphate acyltransferase; ACL-1 is predicted to be a membrane protein that plays a role in phospholipid biosynthesis, but as loss of acl-1 activity via large-scale RNAi experiments results in no obvious defects, the precise role of ACL-1 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
14tag-199F45E4.4n/achrIV 7,612,783C. elegans TAG-199 protein ; contains similarity to Trypanosoma brucei Putative uncharacterized protein.; TR:Q4GZ45
15srp-1C05E4.3n/achrV 754,193srp-1 encodes an ovalbumin-like serpin (ov-serpin) member of the serine protease inhibitor superfamily; by homology, SRP-1 is predicted to function as a suicide substrate that inhibits the proteolytic activity of serine proteases; however, as loss of srp-1 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any obvious abnormalities, the precise role of SRP-1 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
16B0281.6B0281.6n/achrII 2,301,816contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation), IPR000210 (BTB/POZ-like)
17sdz-2C08A9.7n/achrX 17,099,848C. elegans SDZ-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF03353 DUF278 contains similarity to Interpro domain IPR005020 (Protein of unknown function DUF278)
18C31B8.4C31B8.4n/achrV 2,897,526contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ77065, highly similar to Homo sapiens golgi autoantigen, golgin subfamily a, 4 (GOLGA4), mRNA; ENSEMBL:ENSP00000349305
19clec-249Y51A2A.7n/achrV 18,304,784C. elegans CLEC-249 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
20str-171T01G5.5n/achrV 15,131,482C. elegans STR-171 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21C03B1.2C03B1.2n/achrX 6,370,343
22F17E9.2F17E9.2n/achrIV 8,356,187
23ZK673.4ZK673.4n/achrII 10,453,965ZK673.4 encodes a protein with a THAP or THAP-like domain; other proteins with such domains include LIN-15A, LIN-15B, LIN-36, and HIM-17 (which all interact with LIN-35/Rb), as well as CDC-14B, CTB-1, GON-14, and ~100 other proteins such as Drosophila P element transposase and human nuclear proapoptotic factor THAP1.
24K09D9.9K09D9.9n/achrV 3,993,382
25T05F1.7T05F1.7n/achrI 9,640,961contains similarity to Paramecium tetraurelia Chromosome undetermined scaffold_33, whole genome shotgun sequence.; TR:A0D056
26srx-56C03G6.2n/achrV 7,374,979C. elegans SRX-56 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
27T15D6.7T15D6.7n/achrI 12,387,268contains similarity to Pfam domain PF03360 Glycosyltransferase family 43 contains similarity to Interpro domain IPR005027 (Glycosyl transferase, family 43)
28F33H2.8F33H2.8n/achrI 15,032,079contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IBJ6
29F43G6.8F43G6.8n/achrII 11,813,118contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
30inx-16R12E2.5n/achrI 4,163,537inx-16 encodes an innexin, an integral transmembrane channel protein that is a structural component of invertebrate gap junctions; as loss of INX-16 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of INX-16 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; the INX-16 expression pattern has not been determined.
31pqn-16C24B5.5n/achrV 9,174,643The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
32F52E1.3F52E1.3n/achrV 8,395,551
33F15D4.2F15D4.2n/achrII 13,216,307contains similarity to Strongylocentrotus purpuratus Protein ENDO16 (Fragment).; SW:P13665
34pap-1Y32F6A.3n/achrV 10,444,197pap-1 encodes a poly (A) polymerase; large-scale RNAi screens indicate that PAP-1 activity is essential for reproduction, embryonic and larval development, proper body morphology, normal rates of growth, and coordinated locomotion.
35K08D9.6K08D9.6n/achrV 3,233,173contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
36C16C4.1C16C4.1n/achrII 1,894,512
37H12D21.3H12D21.3n/achrV 14,886,000contains similarity to Plasmodium cynomolgi Circumsporozoite protein precursor (CS).; SW:P08675
38T05C3.2T05C3.2n/achrV 5,498,362The T05C3.2 gene encodes a protein that may be involved in apoptosis.
39grl-20C23H5.9n/achrIV 2,127,497grl-20 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central low-complexity region, and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
40ZC196.6ZC196.6n/achrV 8,727,690contains similarity to Mycoplasma genitalium Protein P200.; SW:Q49429
41C50B6.1C50B6.1n/achrV 13,308,835contains similarity to Synechocystis sp Hypothetical protein slr1813.; TR:P73698
42F46B3.7F46B3.7n/achrV 20,613,776contains similarity to Pfam domain PF03380 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF282 contains similarity to Interpro domain IPR005044 (Protein of unknown function DUF282, Caenorhabditis species)
43sra-14F35C5.2n/achrII 12,886,826C. elegans SRA-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
44C42C1.2C42C1.2n/achrIV 12,266,886contains similarity to Pfam domain PF00481 Protein phosphatase 2C contains similarity to Interpro domains IPR001932 (Protein phosphatase 2C-related), IPR000222 (), IPR014045 (Protein phosphatase 2C, N-terminal), IPR015655 (Protein phosphatase 2C)
45lgc-9C04C3.2n/achrIV 3,417,455C. elegans LGC-9 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
46T25D1.1T25D1.1n/achrX 16,520,133
47F35E8.10F35E8.10n/achrV 15,919,877contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
48R08H2.8R08H2.8n/achrV 15,371,455contains similarity to Mycoplasma penetrans Conserved hypothetical protein.; TR:Q8EV71
49F56H6.1F56H6.1n/achrI 12,281,908contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
50F19B10.5F19B10.5n/achrII 3,656,709