UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F42A9.9F42A9.92e-121chrIV 8,638,434
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3E03H4.3E03H4.3n/achrI 12,406,224contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
4B0212.1B0212.1n/achrIV 3,575,057contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domain IPR004878 (Protein of unknown function DUF270)
5clec-243Y68A4B.1n/achrV 17,248,138C. elegans CLEC-243 protein; contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domains IPR002921 (Lipase, class 3), IPR008262 (Lipase, active site)
6T27C5.8T27C5.8n/achrV 17,417,742contains similarity to Pfam domain PF06653 Protein of unknown function (DUF1164) contains similarity to Interpro domain IPR009545 (Protein of unknown function DUF1164)
7W01C9.2W01C9.2n/achrII 8,537,366contains similarity to Chlamydia pneumoniae Probable serine/threonine-protein kinase 1 (EC 2.7.1.37).; SW:PKN1_CHLPN
8sre-13C38C6.4n/achrII 14,635,649C. elegans SRE-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
9srh-62ZK6.9n/achrV 402,409C. elegans SRH-62 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10C50H2.5C50H2.5n/achrV 9,919,252contains similarity to Interpro domains IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
11T11F9.14T11F9.14n/achrV 11,480,742contains similarity to Oryctolagus cuniculus Troponin I, fast skeletal muscle (Troponin I, fast-twitch isoform).; SW:TRIF_RABIT
12F22D6.8F22D6.8n/achrI 7,099,204
13sre-22F36D1.2n/achrI 11,284,373C. elegans SRE-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
14srz-48F20E11.1n/achrV 17,459,315C. elegans SRZ-48 protein ;
15C02E7.8C02E7.8n/achrV 4,920,552
16lgc-48C50B6.11n/achrV 13,341,367C. elegans LGC-48 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
17M01F1.7M01F1.7n/achrIII 3,525,420M01F1.7 encodes a phosphatidylinositol transfer protein, with a C-terminal DDHD domain, that is orthologous to RETINAL DEGENERATION B (RDGB) in D. melanogaster, as well as other orthologs in mammals (NIR1-3); M01F1.7 is expressed in the egg membrane, the germline, the spermatheca and three pairs of head neurons; while M01F1.7 would be expected to mediate PIP(2) signalling in either neuronal function or cytokinesis, it has not yet had a published mutant phenotype, and has no obvious function in mass RNAi assays.
18srz-18F46B3.11n/achrV 20,622,846C. elegans SRZ-18 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001036 (Acriflavin resistance protein)
19srt-30R08F11.2n/achrV 3,799,527C. elegans SRT-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
20C29F9.9C29F9.9n/achrIII 98,659
21fbxa-135T06E6.5n/achrV 15,402,649This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
22igcm-2SSSD1.1n/achrX 6,382,121igcm-2 encodes a protein containing immunoglobulin and fibronectin repeats; igcm-2 promoter::gfp fusions are expressed in the PVT interneuron, in some head neurons, and in the pharynx and intestine.
23srh-127F37B4.1n/achrV 2,894,429C. elegans SRH-127 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24C25E10.11C25E10.11n/achrV 9,057,966
25srb-16F58A6.6n/achrII 5,149,697C. elegans SRB-16 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF03125 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
26K10H10.9K10H10.9n/achrII 14,514,333contains similarity to Vibrio vulnificus Conserved hypothetical protein.; TR:Q8D6Y7
27F23D12.1F23D12.1n/achrX 14,425,936contains similarity to Clostridium perfringens Hypothetical protein CPE1252.; TR:Q8XKZ0
28K04F1.7K04F1.7n/achrV 1,669,148contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
29odr-10C53B7.5n/achrX 6,865,080odr-10 encodes a member of the 7-transmembrane family of odorant receptors which affects chemotaxis to the volatile odorant diacetyl; ODR-10 is strongly expressed in the cilia of the AWA olfactory neurons and, at low levels, in the CEP neurons; expression of odr-10 mRNA and of an odr-10::GFP fusion gene is greatly reduced in odr-7 mutant animals, suggesting that odr-7, which encodes a predicted transcription factor, functions upstream of odr-10 in specifying AWA neuronal cell fate.
30Y38H6C.9Y38H6C.9n/achrV 20,516,299contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
31F55A4.3F55A4.3n/achrX 1,023,626
32ZK353.5ZK353.5n/achrIII 8,394,543
33srz-96Y68A4A.6n/achrV 17,200,545C. elegans SRZ-96 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000418 (Ets)
34F26A1.7F26A1.7n/achrIII 4,819,598
35M03C11.6M03C11.6n/achrIII 10,422,780contains similarity to Brachydanio rerio SI:bZ1G13.2 (ORF1 of novel LINE element with similarities to gagsproteins ).; TR:Q804R5
36hot-7Y48B6A.9n/achrII 14,212,173hot-7 encodes a predicted membrane-associated protein that is a member of the Ly-6 superfamily of glycosylphosphatidylinositol (GPI)-linked signaling proteins and is homologous to ODR-2, a neuronally expressed protein required for olfaction; as loss of hot-7 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of HOT-7 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
37F19B10.1F19B10.1n/achrII 3,683,855contains similarity to Gallus gallus Neurofilament medium polypeptide (NF-M) (Neurofilament triplet Msprotein) (160 kDa neurofilament protein).; SW:P16053
38R05G6.5R05G6.5n/achrIV 7,509,013contains similarity to Pfam domain PF05186 Dpy-30 motif contains similarity to Interpro domains IPR001564 (Nucleoside diphosphate kinase, core), IPR007858 (Dpy-30)
39T22D1.2T22D1.2n/achrIV 6,922,337contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000480 (Glutelin), IPR013286 (Annexin, type VII)
40fbxa-3T08E11.7n/achrII 1,819,483This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
41Y57A10B.6Y57A10B.6n/achrII 12,391,276contains similarity to Pfam domain PF07149 Pes-10 contains similarity to Interpro domain IPR009819 (Pes-10)
42lgc-13T01H10.1n/achrX 12,110,105C. elegans LGC-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
43K10C3.4K10C3.4n/achrI 9,861,391contains similarity to Xenopus laevis Transmembrane protein 98.; SW:Q6INX1
44C46C2.3C46C2.3n/achrIV 9,226,726contains similarity to Tropheryma whipplei DNA repair protein RecN.; TR:Q83NU4
45F47B10.4F47B10.4n/achrX 10,891,428contains similarity to Cyanophage P60 Thioredoxin C3.; TR:Q8W710
46F15A8.1F15A8.1n/achrX 4,441,526
47C24A11.5C24A11.5n/achrI 5,385,191
48srj-33T07C12.1n/achrV 9,936,513C. elegans SRJ-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49tba-5F16D3.1n/achrI 8,355,612tba-5 encodes one of nine C. elegans alpha tubulins; by homology, TBA-5 is predicted to be a component of microtubules; as loss of tba-5 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any obvious abnormalities, TBA-5 likely functions redundantly with other alpha tubulins as a basic component of cellular architecture that may play additional roles in processes such as cell division, cell movement, and intracellular transport.
50F37H8.2F37H8.2n/achrII 11,173,534contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Structural maintenance of chromosomes (SMC) protein; SGD:YOL034W