UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1nhr-182F41B5.90chrV 2,258,611C. elegans NHR-182 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
2cyp-25A5F42A6.4n/achrIV 3,328,559C. elegans CYP-25A5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
3Y106G6H.4Y106G6H.4n/achrI 10,437,301contains similarity to Interpro domain IPR006578 (MADF)
4M03C11.6M03C11.6n/achrIII 10,422,780contains similarity to Brachydanio rerio SI:bZ1G13.2 (ORF1 of novel LINE element with similarities to gagsproteins ).; TR:Q804R5
5B0212.1B0212.1n/achrIV 3,575,057contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domain IPR004878 (Protein of unknown function DUF270)
6T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
7str-2C50C10.7n/achrV 9,823,406C. elegans STR-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8clec-243Y68A4B.1n/achrV 17,248,138C. elegans CLEC-243 protein; contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domains IPR002921 (Lipase, class 3), IPR008262 (Lipase, active site)
9C12D8.9C12D8.9n/achrV 10,242,987contains similarity to Oceanobacillus iheyensis Hypothetical protein.; TR:Q8ELE1
10K02A2.5K02A2.5n/achrII 7,411,491
11sru-40R07B5.3n/achrV 9,833,347C. elegans SRU-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
12osm-10T20H4.1n/achrIII 7,244,451osm-10 encodes a novel protein conserved amongst several Caenorhabditis species; osm-10 activity is required for normal osmosensory signaling in the ASH sensory neuron; in regulating ASH-mediated osmosensation, osm-10 interacts genetically with eos-1 and eos-2; OSM-10 is expressed in the ASH, ASI, PHA, and PHB sensory neurons beginning just prior to hatching and continuing through larval and adult stages; OSM-10 localizes to cell bodies, sensory processes, and axons.
13R07A4.2R07A4.2n/achrX 10,745,349contains similarity to Rhodopirellula baltica Probable serine/threonine-protein kinase pknB (EC 2.7.1.-).; TR:Q7UFE6
14cdk-2K03E5.3n/achrI 3,411,552C. elegans CDK-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
15lgc-48C50B6.11n/achrV 13,341,367C. elegans LGC-48 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
16tag-224B0496.8n/achrIV 7,450,248tag-224 encodes an ortholog of Drosophila CG6522-PA and of human LMCD1 and TESTIN; TAG-224 is dispensable for Wnt-directed planar cell polarity and the fully asymmetrical division of B.a versus B.p cells.
17R04E5.7R04E5.7n/achrX 8,797,318
18clec-182C33D9.2n/achrIV 8,797,600C. elegans CLEC-182 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
19B0495.6B0495.6n/achrII 7,698,778contains similarity to Pfam domain PF07189 Splicing factor 3B subunit 10 (SF3b10) contains similarity to Interpro domain IPR009846 (Splicing factor 3B subunit 5/RDS3 complex subunit 10)
20F14H8.2F14H8.2n/achrV 15,019,750contains similarity to Sulfolobus solfataricus Heterodisulfite reductase, subunit B (hdrB-1).; TR:Q97Z15
21srw-79T11F1.5n/achrII 2,947,802C. elegans SRW-79 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
22cyp-33C2C45H4.17n/achrV 2,185,028C. elegans CYP-33C2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
23F42G8.5F42G8.5n/achrIV 8,137,753
24nhr-176F14H3.11n/achrV 16,072,040C. elegans NHR-176 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
25F22F1.3F22F1.3n/achrX 8,162,399contains similarity to Pfam domain PF02172 KIX domain contains similarity to Interpro domain IPR003101 (Coactivator CBP, KIX)
26srw-36F14F8.7n/achrV 16,684,004C. elegans SRW-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300)
27clec-113F47G4.1n/achrI 14,055,730C. elegans CLEC-113 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
28W01C9.2W01C9.2n/achrII 8,537,366contains similarity to Chlamydia pneumoniae Probable serine/threonine-protein kinase 1 (EC 2.7.1.37).; SW:PKN1_CHLPN
29tsp-20B0198.1n/achrX 12,032,731C. elegans TSP-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF00335 Tetraspanin family contains similarity to Interpro domains IPR000301 (CD9/CD37/CD63 antigen), IPR008952 (Tetraspanin)
30his-25ZK131.2n/achrII 13,824,963his-25 encodes an H3 histone.
31lact-7C40H5.4n/achrX 11,762,779lact-7 encodes a beta-lactamase domain-containing protein.
32K07D4.4K07D4.4n/achrII 4,032,008
33R05H10.5R05H10.5n/achrII 14,868,296contains similarity to Pfam domain PF00255 Glutathione peroxidase contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR000889 (Glutathione peroxidase)
34sre-52C50E10.5n/achrII 12,336,826C. elegans SRE-52 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR005410 (Potassium channel, two pore-domain, THIK), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
35nhr-220T19H12.83e-49chrV 4,883,423C. elegans NHR-220 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
36T11F9.14T11F9.14n/achrV 11,480,742contains similarity to Oryctolagus cuniculus Troponin I, fast skeletal muscle (Troponin I, fast-twitch isoform).; SW:TRIF_RABIT
37fbxa-135T06E6.5n/achrV 15,402,649This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
38C04F5.2C04F5.2n/achrV 5,094,981
39K02D3.2K02D3.2n/achrX 13,710,264contains similarity to Pfam domain PF01852 START domain contains similarity to Interpro domain IPR002913 (Lipid-binding START)
40T22D1.2T22D1.2n/achrIV 6,922,337contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000480 (Glutelin), IPR013286 (Annexin, type VII)
41M6.4M6.4n/achrX 631,028
42nhr-251ZK488.4n/achrV 601,466C. elegans NHR-251 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
43C50H2.5C50H2.5n/achrV 9,919,252contains similarity to Interpro domains IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
44F19B10.1F19B10.1n/achrII 3,683,855contains similarity to Gallus gallus Neurofilament medium polypeptide (NF-M) (Neurofilament triplet Msprotein) (160 kDa neurofilament protein).; SW:P16053
45F23B2.7F23B2.7n/achrIV 9,151,248contains similarity to Homo sapiens similar to Cylicin I (Multiple-band polypeptide I); ENSEMBL:ENSP00000331556
46Y49E10.25Y49E10.25n/achrIII 12,490,261contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domain IPR002921 (Lipase, class 3)
47str-92F59A1.3n/achrV 17,675,766C. elegans STR-92 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48srbc-83C31A11.3n/achrV 16,297,797C. elegans SRBC-83 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002231 (5-Hydroxytryptamine receptor)
49srz-6T21B4.1n/achrII 12,492,894C. elegans SRZ-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
50C29F9.1C29F9.1n/achrIII 133,396