UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1hst-3.1F40H3.52.0000000000000002e-163chrII 6,168,467C. elegans HST-3.1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00685 Sulfotransferase domain contains similarity to Interpro domain IPR000863 (Sulphotransferase)
2bbs-2F20D12.3n/achrIV 7,935,876bbs-2 is orthologous to human BBS2 (OMIM:606151, mutated in Bardet-Biedl syndrome 2); while the function of BBS-2 is unknown, it shares conserved domains with its human paralogs BBS1 and BBS7, which also are mutated in other Bardet-Biedl syndromes.
3C31A11.7C31A11.7n/achrV 16,312,313contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
4T21B4.3T21B4.3n/achrII 12,495,897contains similarity to Pfam domain PF01681 C6 domain contains similarity to Interpro domain IPR002601 (Protein of unknown function C6)
5nhr-84T06C12.7n/achrV 15,878,178C. elegans NHR-84 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
6F53A2.1F53A2.1n/achrIII 13,321,932contains similarity to Pfam domain PF06542 Protein of unknown function (DUF1114) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR009497 (Protein of unknown function DUF1114), IPR009010 (Aspartate decarboxylase-like fold)
7acr-11D2092.3n/achrI 6,623,291A homolog of an alpha type nicotinic acetylcholine receptor subunit involved in the mediation of fast synaptic transmission at neuromuscular junctions.
8lgc-40T24D8.1n/achrX 2,362,451C. elegans LGC-40 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
9Y69H2.2Y69H2.2n/achrV 18,632,391contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (5), PF00858 (Amiloride-sensitive sodium channel) , PF07974 (EGF-like domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
10glr-1C06E1.4n/achrIII 8,586,335glr-1 encodes an AMPA (non-NMDA)-type ionotropic glutamate receptor subunit; GLR-1 activity is required for mediating the behavioral response to light nose touch and the frequency with which animals change locomotory direction in response to sensory cues such as food; GLR-1 and GLR-2, a second AMPA-type ionotropic glutatmate receptor, can interact to form functional heteromeric channels; GLR-1 is expressed in motorneurons and interneurons, including four of the five pairs of command interneurons that are required for locomotory control; in the ventral nerve cord and nerve ring, GLR-1 localizes to perinuclear structures in cell bodies and to punctate structures that appear to be glutamatergic postsynaptic specializations; proper GLR-1 localization in the anterior ventral nerve cord of older larvae and adults requires activity of the class I PDZ protein LIN-10; GLR-1 is ubiquitinated in vivo and its abundance at postsynaptic elements, which may influence postsynaptic strength, is regulated by ubiquitination.
11F53G2.8F53G2.8n/achrII 2,483,639
12gst-12F37B1.2n/achrII 13,617,244C. elegans GST-12 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
13bath-39F25H9.4n/achrV 13,460,604C. elegans BATH-39 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
14C46C11.3C46C11.3n/achrX 4,630,409
15ceh-37C37E2.5n/achrX 14,203,216ceh-37 encodes one of three C. elegans proteins with an OTX-like homeodomain; however, CEH-37 lacks other domains found in OTX proteins, and the CEH-37 homeodomain is predicted to resemble the Myb domain of telomere-binding proteins; CEH-37 binds the telomeric sequence 'TTAGGC' if it is repeated at least 1.5 times, and is mainly localized to the telomere in vivo; ceh-37 mutants have a weak increase in chromosomal nondisjunction; CEH-37 is involved in specifying some aspects of the AWB olfactory neuron fate, such as expression of an AWB-specific odorant receptor and a LIM-class homeodomain protein, LIM-4; CEH-37 is expressed broadly in the early embryo, while in larvae and adults it is expressed solely in the excretory cell.
16R08C7.4R08C7.4n/achrIV 4,436,206contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
17F16D3.6F16D3.6n/achrI 8,376,505contains similarity to Pfam domain PF06681 Protein of unknown function (DUF1182) contains similarity to Interpro domains IPR002091 (Aromatic amino acid permease), IPR010601 (Protein of unknown function DUF1182)
18srw-117C44C3.6n/achrV 2,982,800C. elegans SRW-117 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
19K03B8.8K03B8.8n/achrV 11,410,221contains similarity to Interpro domains IPR006030 (Molluscan rhodopsin C-terminal tail), IPR000694 (Proline-rich region)
20ZK757.2ZK757.2n/achrIII 9,875,718contains similarity to Pfam domain PF00782 Dual specificity phosphatase, catalytic domain contains similarity to Interpro domains IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR000340 (Protein-tyrosine phosphatase, dual specificity)
21fbxb-100Y63D3A.2n/achrI 14,093,529This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
22ZK250.2ZK250.2n/achrII 1,949,294contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
23pqn-25D1044.3n/achrIII 5,510,853The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
24F57E7.1F57E7.1n/achrV 16,481,775contains similarity to Bos taurus Enoyl-CoA hydratase precursor (EC 4.2.1.17) (Fragment).; TR:Q95KZ6
25F47G4.5F47G4.5n/achrI 14,061,493F47G4.5 encodes a paralog of MEI-2 that, like MEI-2, binds MEI-1 in vitro; F47G4.5 might thus be an alternative ligand of MEI-1 in vivo.
26F22B3.5F22B3.5n/achrIV 11,416,056contains similarity to Interpro domains IPR001304 (C-type lectin), IPR006583 (CW)
27T14G12.6T14G12.6n/achrX 3,758,129contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
28C41D11.6C41D11.6n/achrI 4,461,426
29ncs-1C44C1.3n/achrX 961,929The ncs-1 gene encodes a neuronal calcium sensor protein that, along with calcium, is essential for thermotaxis along isothermal paths in thermal gradients.
30srt-27C24B9.6n/achrV 2,720,278C. elegans SRT-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
31jmjd-2Y48B6A.11n/achrII 14,239,185C. elegans JMJD-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF02375 (jmjN domain) , PF02373 (JmjC domain) contains similarity to Interpro domains IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR013129 (Transcription factor jumonji), IPR003347 (Transcription factor jumonji/aspartyl beta-hydroxylase), IPR003349 (Transcription factor jumonji, JmjN), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type), IPR002999 (Tudor)
32F38B6.3F38B6.3n/achrX 6,693,910
33R03H10.6R03H10.6n/achrII 4,172,578contains similarity to Pfam domain PF01336 OB-fold nucleic acid binding domain contains similarity to Interpro domains IPR016027 (Nucleic acid-binding, OB-fold-like), IPR012340 (Nucleic acid-binding, OB-fold), IPR004365 (Nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type)
34srx-97F19B10.7n/achrII 3,667,915C. elegans SRX-97 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
35F49E8.6F49E8.6n/achrIV 7,553,994contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
36M176.4M176.4n/achrII 9,421,150contains similarity to Pfam domain PF07947 YhhN-like protein contains similarity to Interpro domains IPR012506 (YhhN-like), IPR003492 (Batten's disease protein Cln3)
37R12G8.1R12G8.1n/achrV 17,748,619contains similarity to Pfam domain PF00130 Phorbol esters/diacylglycerol binding domain (C1 domain) contains similarity to Interpro domains IPR015727 (Protein kinase C mu-related), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
38C01B10.7C01B10.7n/achrIV 6,638,773contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
39F28G4.4F28G4.4n/achrV 16,284,328contains similarity to Pfam domain PF03407 Protein of unknown function (DUF271) contains similarity to Interpro domains IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR005069 (Protein of unknown function DUF271)
40F59B10.3F59B10.3n/achrII 10,511,687contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
41K10H10.6K10H10.6n/achrII 14,504,011contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
42K04G11.4K04G11.4n/achrX 14,351,065contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001680 (WD40 repeat), IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like), IPR001632 (G-protein, beta subunit), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
43unc-24F57H12.2n/achrIV 7,980,963unc-24 encodes a protein that contains a stomatin-like domain and a lipid transfer domain; unc-24 activity is essential for normal locomotion and for wild-type sensitivity to lipid-soluble volatile anesthetics; unc-24 is genetically epistatic to unc-79 and to unc-1, which encodes an additional stomatin whose stability and localization to the nerve ring are dependent upon UNC-24; unc-24 is expressed in the touch receptor neurons as well as neurons in the ventral cord.
44T07F12.2T07F12.2n/achrX 4,891,246contains similarity to Pfam domain PF02225 PA domain contains similarity to Interpro domain IPR003137 (Protease-associated PA)
45Y7A5A.2Y7A5A.2n/achrX 15,772,148contains similarity to Aquifex aeolicus Hypothetical protein AQ_372.; SW:Y372_AQUAE
46mec-6W02D3.3n/achrI 6,726,624mec-6 is homologous to the human PARAOXONASE 1 gene (PON1, OMIM:168820), which in some allelic forms is associated with susceptibility to coronary artery disease; MEC-6 protein interacts physically with the MEC-4 degenerin ion channel, is colocalized with it in vivo, and is required for MEC-4 punctate expression along touch-receptor neural processes.
47ZC518.4ZC518.4n/achrIV 12,367,373contains similarity to Neurospora crassa Hypothetical protein B8B8.120.; TR:Q872S5
48C03H5.6C03H5.6n/achrII 396,394contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
49gpa-6F48C11.1n/achrX 13,192,522gpa-6 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases that affects response to water-soluble odorants; it is expressed in AWA amphid neurons, the PHB sensory cell, and (at low levels) in ASI amphid neurons.
50ugt-56T04H1.8n/achrV 12,260,070C. elegans UGT-56 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)