UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F40G9.5F40G9.59.000000000000001e-153chrIII 184,128
2tbx-41T26C11.1n/achrX 1,865,937C. elegans TBX-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF00907 T-box contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR001699 (Transcription factor, T-box)
3Y116A8C.19Y116A8C.19n/achrIV 17,039,245Y116A8C.19 encodes a CCCH tandem zinc finger (TZF) protein; based upon its sequence similarity to C. elegans POS-1, the product of Y116A8C.19 is predicted to function as an RNA-binding protein.
4R10F2.4R10F2.4n/achrIII 2,921,110contains similarity to Interpro domain IPR001778 (Pollen allergen Poa pIX/Phl pVI, C-terminal)
5scl-23B0545.3n/achrIV 88,065C. elegans SCL-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related), IPR014044 (SCP-like extracellular)
6D2005.6D2005.6n/achrI 7,790,102contains similarity to Homo sapiens Fusion protein SYT-SSX1; ENSEMBL:ENSP00000269138
7M163.7M163.7n/achrX 14,466,135contains similarity to Reclinomonas americana Ribosomal protein L31.; TR:O21296
8srx-96T01D3.4n/achrV 13,712,245C. elegans SRX-96 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
9nhr-10B0280.8n/achrIII 7,113,797nhr-10 encodes a predicted nuclear hormone receptor diverged from nuclear hormone receptors in other phyla; its mRNA is expressed throughout development with possibly lower expression from the L4 larval to adult stages, and the protein is expressed in neuronal processes.
10F21A9.1F21A9.1n/achrI 3,712,645
11tbx-11F40H6.4n/achrIII 6,046,285tbx-11 encodes a T-box transcription factor that is orthologous to members of the Tbx2 subfamily of T-box transcription factors; by homology, TBX-11 is predicted to function in transcriptional regulation during cellular differentiation, potentially as both an activator and a repressor; however, as loss of tbx-11 function via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of tbx-11 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
12C49A1.1C49A1.1n/achrI 14,214,978contains similarity to Homo sapiens Plasminogen-related protein B precursor; ENSEMBL:ENSP00000245705
13C26E6.12C26E6.12n/achrIII 4,931,357contains similarity to Pfam domains PF01018 (GTP1/OBG) , PF01926 (GTPase of unknown function) contains similarity to Interpro domains IPR000795 (Protein synthesis factor, GTP-binding), IPR014100 (GTP-binding protein Obg/CgtA), IPR006169 (GTP1/OBG subdomain), IPR002917 (GTP-binding protein, HSR1-related), IPR006073 (GTP1/OBG)
14ZK1290.10ZK1290.10n/achrII 7,552,859contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
15col-132C39E9.9n/achrIV 13,090,324C. elegans COL-132 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
16srbc-12K09C6.4n/achrV 850,574C. elegans SRBC-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR003492 (Batten's disease protein Cln3)
17acr-21F27B3.2n/achrIII 6,584,504acr-21 encodes an alpha subunit of nicotinic acetylcholine receptor (nAChR); ACR-21 is a highly divergent member of the 'ACR-16' class of nAChR subunits, which includes ACR-7, ACR-9, ACR-10, ACR-11, ACR-14, ACR-15, ACR-16, and ACR-19, and is most closely related to the alpha-7 subunits of vertebrate nAChRs.
18T05C1.2T05C1.2n/achrII 4,482,363
19F38H4.5F38H4.5n/achrIV 11,852,639contains similarity to Pfam domain PF02274 Amidinotransferase contains similarity to Interpro domain IPR003198 (Amidinotransferase)
20Y116A8C.23Y116A8C.23n/achrIV 17,054,490contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
21F31B9.2F31B9.2n/achrX 15,919,200contains similarity to Mus musculus Radixin (ESP10).; SW:RADI_MOUSE
22M70.4M70.4n/achrIV 2,258,333M70.4 is orthologous to human O-MANNOSE BETA-1,2-N-ACETYLGLUCOSAMINYLTRANSFERASE (FLJ20277; OMIM:606822), which when mutated leads to muscle-eye-brain disease.
23C56C10.12C56C10.12n/achrII 6,606,347contains similarity to Interpro domain IPR016024 (Armadillo-type fold)
24F18A12.4F18A12.4n/achrII 3,405,348F18A12.4 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F18A12.4 has no clear orthologs in other organisms.
25F25B3.2F25B3.2n/achrV 9,578,510contains similarity to Lactococcus lactis Oligopeptide transport system permease protein oppC.; SW:OPPC_LACLA
26Y43F8C.9Y43F8C.9n/achrV 19,646,679contains similarity to Dictyostelium discoideum Myb-like protein.; SW:P34127
27F02D10.3F02D10.3n/achrX 13,461,339contains similarity to Escherichia coli;Escherichia coli O6;Escherichia coli O157:H7 Hypothetical protein yeaG.; SW:YEAG_ECOLI
28W02B8.2W02B8.2n/achrII 13,911,962contains similarity to Pfam domains PF00169 (PH domain) , PF00780 (CNH domain) , PF00130 (Phorbol esters/diacylglycerol binding domain (C1 domain)) contains similarity to Interpro domains IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR000533 (Tropomyosin), IPR001180 (Citron-like), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
29Y56A3A.2Y56A3A.2n/achrIII 11,856,255contains similarity to Pfam domain PF02163 Peptidase family M50 contains similarity to Interpro domains IPR008915 (Peptidase M50), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001193 (Peptidase M50, mammalian sterol-regulatory element binding protein)
30ZK1053.4ZK1053.4n/achrI 13,243,185contains similarity to Schizosaccharomyces pombe Nucleoporin nup124 (Nuclear pore protein nup124).; SW:N124_SCHPO
31F19B10.4F19B10.4n/achrII 3,661,345contains similarity to Interpro domain IPR015425 (Actin-binding FH2)
32F26F4.8F26F4.8n/achrIII 4,904,678contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
33F40F11.4F40F11.4n/achrIV 11,590,249contains similarity to Interpro domains IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
34K09E4.2K09E4.2n/achrII 14,130,163contains similarity to Pfam domain PF05208 ALG3 protein contains similarity to Interpro domains IPR007873 (ALG3), IPR013838 (Beta tubulin, autoregulation binding site)
35srsx-30C51E3.5n/achrV 10,159,536C. elegans SRSX-30 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
36T02H6.8T02H6.8n/achrII 681,180
37K09D9.3K09D9.3n/achrV 4,020,029
38W04A4.2W04A4.2n/achrI 13,683,368contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein FLJ90033; TR:Q8N2R3
39Y56A3A.6Y56A3A.6n/achrIII 11,874,979contains similarity to Interpro domains IPR003072 (Orphan nuclear receptor, NOR1 type), IPR000694 (Proline-rich region), IPR002951 (Atrophin)
40C44B11.1C44B11.1n/achrIII 3,156,820contains similarity to Pfam domain PF06905 Fas apoptotic inhibitory molecule (FAIM1) contains similarity to Interpro domain IPR010695 (Fas apoptotic inhibitory molecule)
41F15G9.3F15G9.3n/achrX 9,710,815contains similarity to Plasmodium falciparum Prolyl-t-RNA synthase, putative (EC 6.1.1.15).; TR:Q8I2Q5
42Y17G7B.19Y17G7B.19n/achrII 12,110,327contains similarity to Pfam domain PF01666 (DX module)
43H40L08.3H40L08.3n/achrX 15,073,031contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Viral A-type inclusion protein, putative.; TR:A2EJ43
44str-33C24B9.1n/achrV 2,729,388C. elegans STR-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45R02F11.2R02F11.2n/achrV 4,795,145
46srr-2T26H2.8n/achrV 19,215,331C. elegans SRR-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF03268 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF267 contains similarity to Interpro domains IPR004950 (Protein of unknown function DUF267, Caenorhabditis species), IPR002455 (GPCR, family 3, gamma-aminobutyric acid receptor, type B)
47K02F6.1K02F6.1n/achrII 2,555,138contains similarity to Pfam domain PF00098 Zinc knuckle contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR013084 (Zinc finger, CCHC retroviral-type), IPR001969 (Peptidase aspartic, active site), IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
48T21G5.2T21G5.2n/achrI 6,870,894
49F10G8.2F10G8.2n/achrI 10,022,221contains similarity to Interpro domain IPR011009 (Protein kinase-like)
50F16C3.2F16C3.2n/achrI 10,152,680contains similarity to Clostridium acetobutylicum DNA repair protein recN, ATPase.; TR:Q97HD9