UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F40G12.4F40G12.47e-150chrV 14,268,178contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
2D1044.4D1044.4n/achrIII 5,521,831
3srt-61T27C10.1n/achrI 10,905,441C. elegans SRT-61 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
4srg-22Y25C1A.10n/achrII 3,092,472C. elegans SRG-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
5str-18T23D5.6n/achrV 15,741,213C. elegans STR-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6cids-1C02F5.4n/achrIII 8,245,008C. elegans CIDS-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF04818 Protein of unknown function, DUF618 contains similarity to Interpro domains IPR006569 (Regulation of nuclear pre-mRNA protein), IPR006903 (Protein of unknown function DUF618), IPR008942 (ENTH/VHS)
7M01G12.7M01G12.7n/achrI 12,115,167contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein.; TR:Q9LZ50
8srb-8F37C12.15n/achrIII 7,172,652C. elegans SRB-8 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
9K07C11.10K07C11.10n/achrV 8,226,436contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein isoform 1; ENSEMBL:ENSP00000381337
10C47C12.2C47C12.2n/achrX 7,754,107
11srx-93F59B1.3n/achrV 3,620,070C. elegans SRX-93 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
12T26E4.1T26E4.1n/achrV 15,780,361contains similarity to Pfam domain PF01030 (Receptor L domain)
13srx-112T24E12.8n/achrII 3,764,010C. elegans SRX-112 protein ;
14str-63C17B7.1n/achrV 3,352,167C. elegans STR-63 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15tax-2F36F2.5n/achrI 9,023,241tax-2 is orthologous to the human gene ROD PHOTORECEPTOR CNG-CHANNEL BETA SUBUNIT (CNGB1; OMIM:600724), which when mutated leads to disease.
16srh-228C35D6.1n/achrIV 16,340,479C. elegans SRH-228 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
17ZK816.3ZK816.3n/achrX 3,348,370
18C08B11.3C08B11.3n/achrII 8,025,126contains similarity to Pfam domain PF01388 ARID/BRIGHT DNA binding domain contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR016024 (Armadillo-type fold), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type), IPR001606 (AT-rich interaction region)
19nhr-159C17E7.7n/achrV 3,876,286C. elegans NHR-159 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
20srw-48F26D2.9n/achrV 16,421,858C. elegans SRW-48 protein ; contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein MPHOSPH1; ENSEMBL:ENSP00000377830
21T27A10.5T27A10.5n/achrX 3,573,294
22age-1B0334.8n/achrII 11,523,196age-1 encodes the C. elegans ortholog of the phosphoinositide 3-kinase (PI3K) p110 catalytic subunit; AGE-1, supplied maternally and embryonically, is a central component of the C. elegans insulin-like signaling pathway, lying downstream of the DAF-2/insulin receptor and upstream of both the PDK-1 and AKT-1/AKT-2 kinases and the DAF-16 forkhead type transcription factor, whose negative regulation is the key output of the insulin signaling pathway; in accordance with its role in insulin signaling, AGE-1 activity is required for regulation of metabolism, life span, dauer formation, stress resistance, salt chemotaxis learning, fertility, and embryonic development; although the age-1 expression pattern has not yet been reported, ectopic expression studies indicate that pan-neuronal age-1 expression is sufficient to rescue life-span defects, while neuronal, intestinal, or muscle expression can partially rescue dauer formation, and neuronal or muscle expression can rescue metabolic defects.
23C15C6.3C15C6.3n/achrI 12,209,642contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR000694 (Proline-rich region)
24T19D12.7T19D12.7n/achrII 6,648,354contains similarity to Interpro domain IPR007110 (Immunoglobulin-like)
25ugt-6ZC455.4n/achrV 12,796,799C. elegans UGT-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
26fbxb-108F08D12.6n/achrII 2,766,099This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
27F26D2.15F26D2.15n/achrV 16,438,363contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
28C17A2.2C17A2.2n/achrII 3,847,228contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
29F19B10.6F19B10.6n/achrII 3,663,696
30scl-21Y43F8B.5n/achrV 19,495,187C. elegans SCL-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
31C14E2.5C14E2.5n/achrX 1,824,473
32F59D12.3F59D12.3n/achrX 15,649,663contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
33str-207F26G5.4n/achrV 4,952,370C. elegans STR-207 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
34clec-131W10G11.7n/achrII 3,575,385C. elegans CLEC-131 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
35srd-51F15A2.3n/achrX 13,483,631C. elegans SRD-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
36him-14ZK1127.11n/achrII 7,067,448him-14 encodes a germline-specific member of the MutS family of DNA mismatch repair (MMR) proteins that is orthologous to human MSH4 and Saccharomyces cerevisiae Msh4p; during the pachytene stage of meiosis, HIM-14 activity is required for promoting crossing over between homologous chromosomes and thus, for chiasmata formation and proper chromosome segregation; in contrast, HIM-14 activity does not appear to be required for mismatch repair, nor for chromosome pairing or synapsis; him-14 mRNA expression is detected exclusively in the germline.
37F14F9.3F14F9.3n/achrV 5,139,826contains similarity to Interpro domain IPR002867 (Zinc finger, C6HC-type)
38F36F12.8F36F12.8n/achrV 2,091,148contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
39C47F8.4C47F8.4n/achrI 12,317,914contains similarity to Pfam domain PF03360 Glycosyltransferase family 43 contains similarity to Interpro domain IPR005027 (Glycosyl transferase, family 43)
40srw-69F18E3.5n/achrV 7,428,134C. elegans SRW-69 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
41dod-20B0554.6n/achrV 423,333C. elegans DOD-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF03409 Protein of unknown function (DUF274) contains similarity to Interpro domain IPR005071 (Protein of unknown function DUF274)
42srbc-11C18B10.1n/achrV 7,494,565C. elegans SRBC-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
43C01G5.8C01G5.8n/achrIV 6,550,691contains similarity to Pfam domain PF08774 VRR-NUC domain contains similarity to Interpro domain IPR014883 (VRR-NUC)
44ver-1T17A3.1n/achrIII 160,182C. elegans VER-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00047 (Immunoglobulin domain) (2), PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF07679 (Immunoglobulin I-set domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR003598 (Immunoglobulin subtype 2), IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR013098 (Immunoglobulin I-set), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR009134 (Vascular endothelial growth factor receptor, VEGFR, N-terminal), IPR003596 (Immunoglobulin V-set, subgroup), IPR013783 (Immunoglobulin-like fold), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR003599 (Immunoglobulin subtype), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR013151 (Immunoglobulin)
45F19H6.3F19H6.3n/achrX 12,369,640contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000302021
46mdf-1C50F4.11n/achrV 9,542,977mdf-1 encodes a coiled-coil domain-containing protein that is orthologous to the Saccharomyces cerevisiae mitotic spindle checkpoint protein Mad1p; consistent with a role as a checkpoint protein, MDF-1 is required in C. elegans for mitotic genome stability and hence, long-term survival and fertility; in vitro, MDF-1 interacts with MDF-2, the C. elegans Mad2p ortholog.
47F20C5.5F20C5.5n/achrIV 8,768,884contains similarity to Interpro domain IPR001395 (Aldo/keto reductase)
48acr-9C40C9.2n/achrX 13,644,544acr-9 encodes a predicted member of the alpha subunit family of nicotinic acetylcholine receptors.
49nhr-111F44G3.9n/achrV 16,123,891nhr-111 encodes a member of the nuclear receptor superfamily; by homology, NHR-111 is predicted to function as a ligand-dependent transcriptional regulator, but as loss of nhr-111 activity via large-scale RNAi screens does not result in any abnormalities, the precise role of NHR-111 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; an nhr-111 reporter construct is expressed in embryos and early larvae in a pair of neurons in the ventral ganglion of the head and in two cells that may be the somatic gonad precursors.
50tag-52C02F12.4n/achrX 3,676,290C. elegans TAG-52 protein; contains similarity to Pfam domain PF00621 RhoGEF domain contains similarity to Interpro domains IPR000219 (Dbl homology (DH) domain), IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type)