UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1tag-120F40F9.21e-117chrV 9,708,653tag-120 encodes a predicted transmembrane protein; as loss of tag-120 activity via RNAi does not result in any abnormalities, the precise role of TAG-120 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; however, TAG-120 is homologous to a Drosophila NMDA receptor-associated protein and mammalian transmembrane proteins that function in Fas-mediated cell death, so TAG-120 may play a role in neuronal functions and/or apoptosis; a tag-120 reporter fusion is expressed in the nervous system, pharyngeal muscles, and to a lesser extent in the excretory system.
2srt-4C29G2.4n/achrV 2,578,859C. elegans SRT-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
3Y37E11B.7Y37E11B.7n/achrIV 3,599,789
4srh-208C43D7.6n/achrV 19,317,895This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
5str-92F59A1.3n/achrV 17,675,766C. elegans STR-92 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6F25F8.1F25F8.1n/achrI 4,890,200contains similarity to Interpro domain IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like)
7srw-36F14F8.7n/achrV 16,684,004C. elegans SRW-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300)
8str-2C50C10.7n/achrV 9,823,406C. elegans STR-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
9F21E9.6F21E9.6n/achrX 1,356,015
10K02A2.5K02A2.5n/achrII 7,411,491
11srt-11W01D2.4n/achrII 14,806,938C. elegans SRT-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
12F42F12.3F42F12.3n/achrX 12,351,013contains similarity to Pfam domain PF02544 3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR001104 (3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase, C-terminal), IPR016636 (3-oxo-5-alpha-steroid 4-dehydrogenase)
13srw-86C25F9.7n/achrV 19,400,392C. elegans SRW-86 protein ;
14tag-117C01B7.4n/achrV 8,794,107C. elegans TAG-117 protein; contains similarity to Pfam domains PF00018 (SH3 domain) , PF00625 (Guanylate kinase) , PF07653 (Variant SH3 domain) , PF00595 (PDZ domain (Also known as DHR or GLGF)) contains similarity to Interpro domains IPR011511 (Variant SH3), IPR008144 (Guanylate kinase), IPR008145 (Guanylate kinase/L-type calcium channel region), IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF), IPR001452 (Src homology-3)
15C27A12.4C27A12.4n/achrI 6,037,041
16F54C4.3F54C4.3n/achrIII 78,455contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
17R04E5.7R04E5.7n/achrX 8,797,318
18C41G6.12C41G6.12n/achrV 15,207,410contains similarity to Interpro domain IPR000168 (Nematode 7TM chemoreceptor (probably olfactory))
19clec-27Y102A5B.1n/achrV 16,855,370C. elegans CLEC-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR003990 (Pancreatitis-associated protein), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
20C33C12.7C33C12.7n/achrII 2,174,952
21clec-113F47G4.1n/achrI 14,055,730C. elegans CLEC-113 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
22F55F8.8F55F8.8n/achrI 5,667,995contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
23C33E10.10C33E10.10n/achrX 17,301,563contains similarity to Interpro domains IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
24R03G8.1R03G8.1n/achrX 13,086,031contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domains IPR004245 (Protein of unknown function DUF229), IPR017850 (Alkaline-phosphatase-like, core domain)
25ZK938.6ZK938.6n/achrII 9,844,266contains similarity to Pfam domain PF00704 Glycosyl hydrolases family 18 contains similarity to Interpro domains IPR011583 (Chitinase II), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001223 (Glycoside hydrolase, family 18, catalytic domain), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
26srw-91K04F1.4n/achrV 1,680,088C. elegans SRW-91 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
27C28H8.2C28H8.2n/achrIII 5,923,760
28K09C4.7K09C4.7n/achrX 3,272,932
29K09C4.4K09C4.4n/achrX 3,290,202contains similarity to Pfam domain PF00083 Sugar (and other) transporter contains similarity to Interpro domains IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
30F12A10.6F12A10.6n/achrII 5,494,268
31C17B7.12C17B7.12n/achrV 3,353,590
32sre-52C50E10.5n/achrII 12,336,826C. elegans SRE-52 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR005410 (Potassium channel, two pore-domain, THIK), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
33F54D12.8F54D12.8n/achrII 1,396,527contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR003609 (Apple-like)
34F54C1.6F54C1.6n/achrI 5,015,305contains similarity to Interpro domain IPR001564 (Nucleoside diphosphate kinase, core)
35C17H1.8C17H1.8n/achrI 13,129,308contains similarity to Pyrococcus furiosus DNA double-strand break repair rad50 ATPase.; SW:P58301
36T07D3.5T07D3.5n/achrII 886,263contains similarity to Pfam domain PF06828 Fukutin-related contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR009644 (Fukutin-related)
37C12D8.9C12D8.9n/achrV 10,242,987contains similarity to Oceanobacillus iheyensis Hypothetical protein.; TR:Q8ELE1
38F40D4.12F40D4.12n/achrV 17,161,146contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
39ceh-28K03A11.3n/achrX 13,075,231A homeobox protein of the NK-2 family; it is expressed in a single pharyngeal neuron, M4.
40C53A5.9C53A5.9n/achrV 14,557,956contains similarity to Pfam domains PF01344 (Kelch motif) (5), PF07646 (Kelch motif) (3), PF02984 (Cyclin, C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR011043 (Galactose oxidase/kelch, beta-propeller), IPR004367 (Cyclin, C-terminal), IPR006652 (Kelch repeat type 1), IPR011498 (Kelch repeat type 2), IPR015916 (Galactose oxidase, beta-propeller), IPR013089 (Kelch related), IPR006651 (Kelch), IPR015915 (Kelch-type beta propeller)
41C38C5.1C38C5.1n/achrX 5,560,137
42srbc-83C31A11.3n/achrV 16,297,797C. elegans SRBC-83 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002231 (5-Hydroxytryptamine receptor)
43F58A6.2F58A6.2n/achrII 5,137,627
44F59B10.6F59B10.6n/achrII 10,523,795contains similarity to Prochlorococcus marinus Possible paralytic/GBP/PSP peptide precursor.; TR:Q7TUU1
45T25B6.1T25B6.1n/achrX 9,040,675
46AC8.7AC8.7n/achrX 230,898
47F59D6.2F59D6.2n/achrV 3,028,937contains similarity to Pfam domain PF00026 Eukaryotic aspartyl protease contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001461 (Peptidase A1)
48F32B4.5F32B4.5n/achrI 11,519,244contains similarity to Homo sapiens BTB/POZ domain-containing protein KCTD16; ENSEMBL:ENSP00000329906
49F02C12.2F02C12.2n/achrX 13,398,638contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR002424 (Insect alcohol dehydrogenase family), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR001100 (Pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase, class I)
50F53F4.1F53F4.1n/achrV 13,585,118contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)