UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1gpa-2F38E1.50chrV 8,372,499gpa-2 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases that is involved in dauer formation and chemotaxis to water-soluble odorants; it is expressed in the phasmid neurons PHA and PHB, three pharyngeal neurons, one interneuron, three pairs of head neurons, and the anal sphincter muscle.
2cyp-33C7F41B5.2n/achrV 2,251,536C. elegans CYP-33C7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
3F41B4.1F41B4.1n/achrX 6,824,820contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein ENSP00000368755 (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000368755
4twk-21T01B4.1n/achrX 16,302,750C. elegans TWK-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
5C39D10.6C39D10.6n/achrX 7,896,965
6nas-25F46C5.3n/achrII 8,827,065nas-25 encodes an astacin-like metalloprotease; large-scale expression studies reveal that a nas-25::GFP promoter fusion is expressed in the pharynx and pharyngeal-intestinal valve.
7F28H7.7F28H7.7n/achrV 10,752,577contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
8C31A11.5C31A11.5n/achrV 16,304,427contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
9C49F8.2C49F8.2n/achrX 13,374,194contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
10C06C3.8C06C3.8n/achrII 9,388,665contains similarity to Pfam domain PF03353 DUF278 contains similarity to Interpro domains IPR005020 (Protein of unknown function DUF278), IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease), IPR006578 (MADF)
11nhr-120C25B8.6n/achrX 6,638,552C. elegans NHR-120 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
12nhr-84T06C12.7n/achrV 15,878,178C. elegans NHR-84 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
13F38B6.3F38B6.3n/achrX 6,693,910
14daf-14F01G10.8n/achrIV 10,254,701daf-14 encodes a Smad-related protein that is unusual in that while its C-terminus is well-conserved with Smad proteins, it lacks the N-terminal DNA binding domain found in all other known Smads; DAF-14 is predicted to function as a transducer of the DAF-7/TGF-beta-mediated signal that promotes reproductive growth and negatively regulates dauer formation; as reduction of daf-14 function enhances the dauer constitutive phenotype of daf-8 mutants, and overexpression of daf-14 can rescue daf-8 mutant animals, it is likely that the DAF-14 and DAF-8 Smad proteins function in parallel to control dauer formation; further genetic analyses suggest that DAF-14 and DAF-8 function to antagonize the activities of the DAF-3 Smad and DAF-5 Sno/Ski oncoprotein, which are required for dauer formation; a DAF-14::GFP reporter is expressed in a dynamic pattern in tissues, such as the hypodermis, intestine, and pharynx, that are remodeled during dauer development.
15pho-4T16D1.2n/achrII 5,237,340C. elegans PHO-4 protein ;
16C28H8.7C28H8.7n/achrIII 5,886,352contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
17K09E4.2K09E4.2n/achrII 14,130,163contains similarity to Pfam domain PF05208 ALG3 protein contains similarity to Interpro domains IPR007873 (ALG3), IPR013838 (Beta tubulin, autoregulation binding site)
18nhr-6C48D5.1n/achrIII 3,576,162nhr-6 encodes a nuclear receptor of the NR4A4 subfamily that is orthologous to the mammalian NGFI-B receptors and the Drosophila HR38 nuclear receptor (DHR38) that has been implicated in molting and metamorphosis; by homology, NHR-6 likely functions as a transcription factor that, based upon RNAi experiments, is required for normal ovulation and/or spermathecal development or function; an nhr-6 reporter fusion is expressed primarily in the anterior and posterior spermatheca during L3 and L4 larval stages, with some weak and variable expression also observed in two chemosensory neurons; nhr-6 mRNA is expressed in an oscillating manner throughout larval development, in a pattern that is slightly irregular with respect to the timing of larval molts and that exhibits consistently lower expression at the times when these molts actually occur.
19F20D6.8F20D6.8n/achrV 8,166,494contains similarity to Pfam domain PF00071 Ras family contains similarity to Interpro domains IPR003577 (Ras small GTPase, Ras type), IPR001806 (Ras GTPase), IPR003579 (Ras small GTPase, Rab type), IPR013753 (Ras)
20CD4.1CD4.1n/achrV 5,608,204
21T28C12.2T28C12.2n/achrV 6,330,074contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
22D2023.3D2023.3n/achrV 11,804,015contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
23F10D7.1F10D7.1n/achrX 17,362,183contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
24F22E5.6F22E5.6n/achrII 2,650,293contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
25C31B8.7C31B8.7n/achrV 2,901,878contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
26del-4T28B8.5n/achrI 8,140,996C. elegans DEL-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
27ubq-2ZK1010.1n/achrIII 12,978,145ubq-2 encodes a bifunctional protein that contains two domains; an N-terminal ubiquitin peptide, and a C-terminal large ribosomal subunit protein L40 peptide.
28lgc-4F18G5.4n/achrX 9,238,639C. elegans LGC-4 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR002394 (Nicotinic acetylcholine receptor, N-terminal), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
29bath-47T07H3.1n/achrII 1,603,204C. elegans BATH-47 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) (2), PF00917 (MATH domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
30C33C12.8C33C12.8n/achrII 2,184,467contains similarity to Pfam domain PF02055 O-Glycosyl hydrolase family 30 contains similarity to Interpro domains IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR001139 (Glycoside hydrolase, family 30), IPR013781 (Glycoside hydrolase, subgroup, catalytic core)
31C03H5.6C03H5.6n/achrII 396,394contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
32ZK354.6ZK354.6n/achrIV 5,296,718contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
33fbxb-65C43D7.2n/achrV 19,330,120This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
34F31B12.2F31B12.2n/achrX 10,822,704contains similarity to Mus musculus Splicing factor, arginine/serine-rich 12 (Serine-arginine-richssplicing regulatory protein 86) (SRrp86).; SW:SFRC_MOUSE
35T13A10.2T13A10.2n/achrIV 6,253,526contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
36F23H11.7F23H11.7n/achrIII 918,259
37srbc-34Y113G7B.9n/achrV 20,202,676C. elegans SRBC-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
38T24D5.2T24D5.2n/achrX 12,585,041contains similarity to Plasmodium falciparum DNA-directed RNA polymerase beta chain (EC 2.7.7.6).; SW:RPOB_PLAFA
39T22D1.12T22D1.12n/achrIV 6,930,087contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
40AC8.3AC8.3n/achrX 228,920
41R01H2.4R01H2.4n/achrIII 7,062,521contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
42C06A5.10C06A5.10n/achrI 5,982,746
43C34F6.9C34F6.9n/achrX 11,220,316contains similarity to Interpro domain IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
44cav-2C56A3.7n/achrV 13,558,462cav-2 encodes one of two C. elegans proteins related to caveolins, integral transmembrane proteins that are believed to function in regulation of signal transduction and that are the major component of caveolae, specialized lipid rafts found in the plasma membrane of most cell types; as loss of cav-2 function via large-scale RNA-mediated interference (RNAi) screens does not result in any obvious abnormalities, the role of cav-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; cav-2 mRNA is expressed in eggs and mixed stage populations.
45F44E7.7F44E7.7n/achrV 5,784,253contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
46Y54E2A.1Y54E2A.1n/achrII 14,736,737contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
47M117.1M117.1n/achrIV 11,816,824contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR001958 (Tetracycline resistance protein, TetA), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
48F45E1.5F45E1.5n/achrX 7,978,560contains similarity to Interpro domain IPR000834 (Peptidase M14, carboxypeptidase A)
49R12C12.3R12C12.3n/achrII 6,030,297contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
50srbc-19C45H4.16n/achrV 2,165,802C. elegans SRBC-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002208 (SecY protein)