UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1F38A1.9F38A1.96e-82chrIV 1,244,866
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3C06A12.3C06A12.3n/achrIV 17,428,622contains similarity to Pfam domain PF05303 Protein of unknown function (DUF727) contains similarity to Interpro domain IPR007967 (Protein of unknown function DUF727)
4F14D7.7F14D7.7n/achrV 14,306,660contains similarity to Chlorobium tepidum Peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, PpiC-type.; TR:Q8KFW7
5R07B7.5R07B7.5n/achrV 12,069,626contains similarity to Pfam domain PF01494 FAD binding domain contains similarity to Interpro domains IPR003042 (Aromatic-ring hydroxylase), IPR002938 (Monooxygenase, FAD-binding)
6Y40B1B.5Y40B1B.5n/achrI 13,436,717contains similarity to Homo sapiens Retinoblastoma binding protein 6 isoform 1; ENSEMBL:ENSP00000317872
7skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
8cyp-33E1C49C8.4n/achrIV 8,646,858C. elegans CYP-33E1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
9acl-3ZK809.2n/achrIV 11,651,359acl-3 encodes a phosphate acyltransferase that is orthologous to human tafazzin (TAZ; OMIM:300394, mutated in Barth syndrome); by homology, ACL-3 is predicted to be a mitochondrial protein that plays a role in phospholipid metabolism, although loss of acl-3 activity via large-scale RNAi screens results in no obvious defects.
10F56F10.3F56F10.3n/achrX 863,092F56F10.3 encodes the C. elegans cysteine dioxygenase ortholog; by homology to mammalian enzymes, the product of F56F10.3 is predicted to function in cysteine catabolism by catalyzing the oxidation of cysteine to cysteine sulfanate.
11Y12A6A.1Y12A6A.1n/achrX 13,620,760
12sri-42T10D4.9n/achrII 3,141,931C. elegans SRI-42 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
13C12D12.5C12D12.5n/achrX 3,505,953contains similarity to Pfam domain PF00505 HMG (high mobility group) box contains similarity to Interpro domains IPR000910 (High mobility group box, HMG1/HMG2), IPR009071 (High mobility group box, HMG)
14srx-86F38B7.7n/achrV 11,563,703C. elegans SRX-86 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
15F47C12.1F47C12.1n/achrIV 4,001,937contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (4), PF00754 (F5/8 type C domain) , PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF07699 (GCC2 and GCC3) (3), PF00431 (CUB domain) , PF07974 (EGF-like domain) , PF02494 (HYR domain) (2), PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) (6)contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR003410 (Hyalin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR008979 (Galactose-binding like), IPR000859 (CUB), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR016060 (Complement control module), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR000421 (Coagulation factor 5/8 type, C-terminal), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013091 (EGF calcium-binding)
16F19C7.6F19C7.6n/achrIV 4,595,282
17F54D5.2F54D5.2n/achrII 11,573,977contains similarity to Interpro domain IPR000194 (ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, nucleotide-binding)
18B0244.7B0244.7n/achrIII 5,732,127contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
19F35F10.4F35F10.4n/achrV 3,292,977contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
20B0222.9B0222.9n/achrV 9,170,672contains similarity to Pfam domains PF00941 (FAD binding domain in molybdopterin dehydrogenase) , PF02738 (Aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding domain) , PF00111 (2Fe-2S iron-sulfur cluster binding domain) , PF01799 ([2Fe-2S] binding domain) , PF01315 (Aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, a/b hammerhead domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR001041 (Ferredoxin), IPR002346 (Molybdopterin dehydrogenase, FAD-binding), IPR012675 (Beta-grasp fold, ferredoxin-type), IPR002888 ([2Fe-2S]-binding), IPR016166 (FAD-binding, type 2), IPR006058 (2Fe-2S ferredoxin, iron-sulphur binding site), IPR016169 (CO dehydrogenase flavoprotein-like, FAD-binding, subdomain 2), IPR000674 (Aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, a/b hammerhead), IPR008274 (Aldehyde oxidase and xanthine dehydrogenase, molybdopterin binding)
21F35H8.2F35H8.2n/achrII 9,556,425contains similarity to Pfam domain PF02485 Core-2/I-Branching enzyme contains similarity to Interpro domain IPR003406 (Glycosyl transferase, family 14)
22C44C8.2C44C8.2n/achrIV 900,230
23fbxa-60T12B5.10n/achrIII 945,562This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
24C44H9.4C44H9.4n/achrV 12,837,723contains similarity to Interpro domain IPR000839 (Porin, Oms28 type)
25W01A11.1W01A11.1n/achrV 6,500,809contains similarity to Pfam domains PF06441 (Epoxide hydrolase N terminus) , PF00561 (alpha/beta hydrolase fold) contains similarity to Interpro domains IPR016292 (Epoxide hydrolase), IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1), IPR000639 (Epoxide hydrolase-like), IPR010497 (Epoxide hydrolase, N-terminal)
26T21F4.1T21F4.1n/achrX 5,631,021T21F4.1 is orthologous to the human gene ARGINASE TYPE I ERYTHROID VARIANT (ARG1; OMIM:207800), which when mutated leads to argininemia.
27D2096.11D2096.11n/achrIV 8,390,987contains similarity to Pfam domains PF00307 (Calponin homology (CH) domain) (2), PF02187 (Growth-Arrest-Specific Protein 2 Domain) contains similarity to Interpro domains IPR003108 (Growth-arrest-specific protein 2), IPR002017 (Spectrin repeat), IPR016146 (Calponin-homology), IPR001715 (Calponin-like actin-binding)
28ocam-1T02B5.2n/achrV 14,167,452T02B5.2 encodes a protein with an OCAM domain, a nematode-specific motif conserved between T02B5.2 and two other nematode ONECUT homeobox proteins (CEH-21 and CEH-41); this gene is probably derived from a ONECUT gene that lost both tit cut domain and its homeodomain; T02B5.2 has no obvious function in mass RNAi assays.
29F44E7.3F44E7.3n/achrV 5,772,314
30F22H10.6F22H10.6n/achrX 16,690,126
31C31G12.3C31G12.3n/achrV 18,185,300contains similarity to Rhodopirellula baltica Probable polysaccharide export protein.; TR:Q7UYB3
32M02F4.2M02F4.2n/achrX 3,033,806
33fbxa-59T12B5.8n/achrIII 942,155This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
34math-23C46F9.2n/achrII 1,903,365The C46F9.2 gene encodes a protein closely similar to C46F9.3, which has a meprin-associated Traf homology (MATH) domain and may be involved in apoptosis.
35C49A9.2C49A9.2n/achrIV 6,226,732contains similarity to Pfam domain PF03312 Protein of unknown function, DUF272 contains similarity to Interpro domain IPR004987 (Protein of unknown function DUF272)
36R10H1.1R10H1.1n/achrII 7,495,254contains similarity to Interpro domain IPR008374 (SF-assemblin)
37C29H12.5C29H12.5n/achrII 6,111,947contains similarity to Pfam domain PF00385 'chromo' (CHRromatin Organisation MOdifier) domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR000953 (Chromo domain), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR016197 (Chromo domain-like)
38B0280.2B0280.2n/achrIII 7,126,452contains similarity to Interpro domain IPR000697 (EVH1)
39Y38F1A.8Y38F1A.8n/achrII 12,999,329contains similarity to Homo sapiens Isoform 2 of Post-GPI attachment to proteins factor 2; ENSEMBL:ENSP00000300730
40gtl-2F54D1.5n/achrIV 11,277,712gtl-2 encodes a predicted receptor-activated calcium channel and represents a family of calcium channels, the other two family members being gtl-1 and gon-2.
41T19D12.6T19D12.6n/achrII 6,640,052contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) , PF02210 (Laminin G domain) (3), PF00054 (Laminin G domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR001791 (Laminin G), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR012680 (Laminin G, subdomain 2), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase), IPR012679 (Laminin G, subdomain 1)
42C49A9.6C49A9.6n/achrIV 6,212,029contains similarity to Pfam domain PF03312 Protein of unknown function, DUF272 contains similarity to Interpro domain IPR004987 (Protein of unknown function DUF272)
43ZK1193.2ZK1193.2n/achrX 411,499contains similarity to Pfam domains PF00092 (von Willebrand factor type A domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR001304 (C-type lectin), IPR006582 (Region of unknown fuction MD, Caenorhabditis elegans), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
44K08D8.2K08D8.2n/achrIV 12,903,408contains similarity to Arabidopsis thaliana Hypothetical protein.; TR:Q8GYZ7
45F43H9.3F43H9.3n/achrV 8,024,072contains similarity to Homo sapiens PAP associated domain containing 4; ENSEMBL:ENSP00000296783
46unc-31ZK897.1n/achrIV 12,780,334unc-31 encodes a pleckstrin homology (PH) domain-containing protein that is the C. elegans ortholog of human CADPS/CAPS (calcium-dependent activator protein for secretion OMIM:604667); UNC-31 functions in post-docking calcium-regulated dense-core vesicle fusion that is required for egg laying, locomotion, pharyngeal pumping, and recovery from the dauer larval stage; in addition, UNC-31 functions in the insulin receptor signaling pathway that regulates adult life span where it may control Ca[2+]-regulated secretion of an insulin-like ligand; UNC-31 is not required for synaptic vesicle exocytosis; unc-31::gfp transcriptional reporters are expressed in most, if not all, neurons, vulval muscles, vulval cells, the spermatheca, and secretory cells such as the uterine UV1 cells; UNC-31::GFP translational fusions localize to neuronal cell bodies, axonal projections and to sites of synaptic contact, consistent with other dense-core vesicle proteins.
47fbxa-57C29F9.10n/achrIII 106,751C. elegans FBXA-57 protein; contains similarity to Pfam domains PF01827 (FTH domain) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001986 (3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase, core), IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species), IPR001810 (Cyclin-like F-box)
48Y49E10.16Y49E10.16n/achrIII 12,432,047contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domains IPR002921 (Lipase, class 3), IPR008262 (Lipase, active site)
49clec-7F10G2.3n/achrV 7,329,181C. elegans CLEC-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF00431 (CUB domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
50ptr-8F44F4.4n/achrII 10,891,194ptr-8 encodes a nematode-specific member of the sterol sensing domain (SSD) proteins, distantly paralogous to Drosophila PATCHED (PTC) and human PTCH (OMIM:601309, mutated in basal cell nevus syndrome); PTR-8 is weakly required for normal molting from L4 to adult stages; PTR-8 is also required for normal growth to full size and locomotion; PTR-8 is expressed in hypodermis.