UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1clec-167F38A1.40chrIV 1,254,535C. elegans CLEC-167 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
2K06A1.3K06A1.3n/achrII 6,442,625contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
3nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
4ZK1010.6ZK1010.6n/achrIII 12,989,808contains similarity to Pfam domain PF01666 DX module contains similarity to Interpro domain IPR002593 (Protein of unknown function DX)
5nhr-266F56H1.2n/achrI 5,738,931C. elegans NHR-266 protein; contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
6T22B7.3T22B7.3n/achrX 5,648,750contains similarity to Pfam domain PF02274 Amidinotransferase contains similarity to Interpro domain IPR003198 (Amidinotransferase)
7clec-241F49H6.2n/achrV 17,012,698C. elegans CLEC-241 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
8F16B4.3F16B4.3n/achrV 1,597,417contains similarity to Pfam domain PF06918 Protein of unknown function (DUF1280) contains similarity to Interpro domain IPR009689 (Protein of unknown function DUF1280)
9Y41C4A.13Y41C4A.13n/achrIII 11,735,378contains similarity to Homo sapiens Rabconnectin; ENSEMBL:ENSP00000251076
10twk-25M04B2.5n/achrIV 11,507,989C. elegans TWK-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
11fbxa-183F44E7.6n/achrV 5,781,921This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
12R07A4.4R07A4.4n/achrX 10,753,200contains similarity to Pfam domain PF00024 PAN domain contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
13C50F7.9C50F7.9n/achrIV 7,731,347
14F41C6.7F41C6.7n/achrX 6,883,839contains similarity to Pfam domain PF01545 Cation efflux family contains similarity to Interpro domain IPR002524 (Cation efflux protein)
15T11B7.2T11B7.2n/achrIV 8,844,038contains similarity to Homo sapiens remodeling and spacing factor 1; ENSEMBL:ENSP00000311513
16F54E2.4F54E2.4n/achrV 2,806,913contains similarity to Pfam domains PF00047 (Immunoglobulin domain) , PF07679 (Immunoglobulin I-set domain) (3)contains similarity to Interpro domains IPR003598 (Immunoglobulin subtype 2), IPR013098 (Immunoglobulin I-set), IPR009134 (Vascular endothelial growth factor receptor, VEGFR, N-terminal), IPR013783 (Immunoglobulin-like fold), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR003599 (Immunoglobulin subtype), IPR013151 (Immunoglobulin)
17C46E10.3C46E10.3n/achrII 3,722,194
18str-96T10H4.2n/achrV 15,293,203C. elegans STR-96 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
19R01B10.3R01B10.3n/achrV 6,044,828
20cyp-34A10B0213.16n/achrV 3,971,866C. elegans CYP-34A10 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
21Y41C4A.8Y41C4A.8n/achrIII 11,707,793contains similarity to Aedes aegypti Hypothetical conserved protein (Putative uncharacterized protein).; TR:Q1HQM0
22W04E12.7W04E12.7n/achrV 19,731,742contains similarity to Pfam domain PF06162 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF976) contains similarity to Interpro domains IPR010381 (Protein of unknown function DUF976, Caenorhabditis species), IPR016125 (Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like)
23K11G9.5K11G9.5n/achrV 6,687,134contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
24C30F12.5C30F12.5n/achrI 6,995,898contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
25sri-18Y22F5A.2n/achrV 10,259,578C. elegans SRI-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26C02D5.1C02D5.1n/achrIII 8,561,987contains similarity to Pfam domains PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
27C12D5.10C12D5.10n/achrV 7,692,770contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
28T19B4.1T19B4.1n/achrI 5,703,857contains similarity to Pfam domains PF03712 (Copper type II ascorbate-dependent monooxygenase, C-terminal domain) , PF01436 (NHL repeat) (4), PF01082 (Copper type II ascorbate-dependent monooxygenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR008977 (PHM/PNGase F-fold), IPR000323 (Copper type II, ascorbate-dependent monooxygenase, N-terminal), IPR000720 (Peptidyl-glycine alpha-amidating monooxygenase), IPR014783 (Copper type II, ascorbate-dependent monooxygenase, C-terminal), IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like), IPR013017 (NHL repeat, subgroup), IPR014784 (Copper type II, ascorbate-dependent monooxygenase-like, C-terminal), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like), IPR001258 (NHL repeat)
29F14H12.2F14H12.2n/achrX 4,351,596
30ZK1320.9ZK1320.9n/achrII 9,685,397contains similarity to Pfam domain PF02550 Acetyl-CoA hydrolase/transferase N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR003702 (Acetyl-CoA hydrolase/transferase), IPR001220 (Legume lectin, beta domain)
31F59A6.4F59A6.4n/achrII 5,006,559contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
32srt-72C36C5.9n/achrV 3,148,851C. elegans SRT-72 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
33F56F11.2F56F11.2n/achrIII 2,883,625
34his-9ZK131.3n/achrII 13,823,762his-9 encodes an H3 histone; by homology, HIS-9 is predicted to function as a nucleosome component required for packaging of DNA into chromatin; his-9 is a replication-dependent histone locus that resides in the HIS3 cluster on chromosome II.
35C24A11.2C24A11.2n/achrI 5,381,597
36T05B11.1T05B11.1n/achrV 7,750,009This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
37F15E11.4F15E11.4n/achrV 2,340,462contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
38kin-29F58H12.1n/achrX 2,848,198kin-29 encodes a serine/threonine kinase with significant homology in the kinase domain to the AMP-activated protein kinase (AMPK) and SNF1 kinases; the AMP-kinase cascade is activated by cellular stresses that deplete ATP; AMP-kinase is believed to protect the mammalian cell by 'switching off' ATP-consuming pathways like fatty acid synthesis, by phosphorylating key regulatory enzymes, and switching on alternative pathways for ATP generation; kin-29 is involved in regulating the expression of chemosensory receptors and entry into the daur pathway; kin-29 also affects body size via interaction with the Sma/Mab pathway and lifespan, with mutants exhibiting a smaller body size and increased life span; a functional KIN-29-GFP fusion protein is expressed in sensory neurons and many other cell types, and localizes to the cytoplasm; under conditions of cellular stress like heat shock and starvation, KIN-29-GFP translocates to the nucleus.
39sri-48ZC239.9n/achrII 3,200,257C. elegans SRI-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40col-89F17C8.2n/achrIII 4,748,632C. elegans COL-89 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
41W04H10.1W04H10.1n/achrII 609,207
42R06A10.1R06A10.1n/achrI 1,087,211contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
43F14B8.6F14B8.6n/achrX 6,930,764
44F21A9.2F21A9.2n/achrI 3,707,420contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
45Y57A10C.9Y57A10C.9n/achrII 12,434,642contains similarity to Nitrosomonas europaea Possible ABC transport permease.; TR:Q82XY6
46col-123W08D2.6n/achrIV 9,822,477col-123 is homologous to the human gene A TYPE IV COLLAGEN (COL6A1; OMIM:303631), which when mutated is sometimes associated with diffuse leiomyomatosis.
47C32B5.12C32B5.12n/achrII 952,421
48F56D5.6F56D5.6n/achrIV 9,407,298contains similarity to Plasmodium falciparum Putative uncharacterized protein PFD0207c.; TR:Q8I1Y6
49T07H6.5T07H6.5n/achrX 6,288,966contains similarity to Pfam domain PF00084 Sushi domain (SCR repeat) contains similarity to Interpro domains IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR016060 (Complement control module)
50Y54E5A.2Y54E5A.2n/achrI 14,694,856contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)