UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F37C4.8F37C4.89.999999999999999e-169chrIV 3,880,246
2ZC443.4ZC443.4n/achrV 12,818,211contains similarity to Homo sapiens Isoform 4 of AT-rich interactive domain-containing protein 4B; ENSEMBL:ENSP00000375729
3srr-9T05B11.2n/achrV 7,738,784C. elegans SRR-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF03268 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF267 contains similarity to Interpro domain IPR004950 (Protein of unknown function DUF267, Caenorhabditis species)
4F25E5.4F25E5.4n/achrV 7,450,232contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR001254 (Peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap), IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
5C07E3.3C07E3.3n/achrII 10,355,550contains similarity to Ambrosia artemisiifolia Pollen allergen Amb a 1.2 precursor (Antigen E) (Antigen Amb a I).; SW:MP12_AMBAR
6F47D12.3F47D12.3n/achrIII 6,298,853contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
7bath-26T07H3.6n/achrII 1,600,097C. elegans BATH-26 protein; contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF00917 (MATH domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
8W02D9.10W02D9.10n/achrI 12,551,930
9clec-216F26D11.5n/achrV 7,952,270C. elegans CLEC-216 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
10F35H10.3F35H10.3n/achrIV 8,326,450
11F47D12.6F47D12.6n/achrIII 6,286,908
12C34B2.3C34B2.3n/achrI 10,673,805contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase)
13clec-211F19F10.6n/achrV 7,560,915C. elegans CLEC-211 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
14des-2T26H10.1n/achrV 11,417,794des-2 encodes an alpha subunit of nicotinic acetylcholine receptor (nAChR), predicted to be a ligand-gated ion channel regulating the fast action of acetylcholine at neuromuscular junctions and in the nervous system; DES-2 is coexpressed with and genetically interacts with DEG-3, which which it probably forms heteromultimers, and DES-2 falls into the 'DEG-3' class of nAChR subunits, probably unique to nematodes, which includes DEG-3, ACR-5, ACR-17, ACR-18 ACR-20, and ACR-23.
15rcn-1F54E7.7n/achrIII 5,683,173rcn-1 encodes a calcipressin, which binds and inhibits calcineurin; RCN-1's orthologs include yeast Rcn1p and human DSCR1 (OMIM:602917; overexpressed in Down syndrome and Alzheimer disease); rcn-1 is expressed in hypodermal seam cells, various neurons, vulval epithelial and muscle cells, marginal pharyngeal cells, and in the male tail; rcn-1 transcription is regulated by TAX-6, and RCN-1 binds TAX-6 protein if free Ca[2+] is present; RCN-1 overexpression, like calcineurin deficiency, causes defects in body size, cuticle thickness, fertility, growth rate, and serotonin-resistance in egg-laying.
16C50F7.3C50F7.3n/achrIV 7,733,257contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
17F21D12.5F21D12.5n/achrII 7,329,535contains similarity to Pfam domain PF00292 'Paired box' domain contains similarity to Interpro domains IPR001523 (Paired box protein, N-terminal), IPR011991 (Winged helix repressor DNA-binding), IPR009057 (Homeodomain-like)
18prx-2ZK809.7n/achrIV 11,645,165prx-2 is orthologous to the human gene PEROXISOMAL MEMBRANE PROTEIN 3 (PXMP3; OMIM:170993), which when mutated leads to Zellweger syndrome 3 or infantile Refsum disease.
19ptr-19Y39A1B.2n/achrIII 10,786,410ptr-19 encodes an ortholog of Drosophila and human PTCHD3, which defines one of seven paralogous families of sterol sensing domain (SSD) proteins; PTR-19 is required for normal development in mass RNAi assays; PTR-19 is expressed in pharynx, hypodermis, nervous system (including head neurons), and other cells.
20C24D10.8C24D10.8n/achrIV 5,165,608n/a
21W07A12.4W07A12.4n/achrII 9,150,253contains similarity to Pfam domains PF00651 (BTB/POZ domain) , PF07707 (BTB And C-terminal Kelch) contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ), IPR011705 (BTB/Kelch-associated), IPR013089 (Kelch related)
22C46E1.1C46E1.1n/achrX 15,469,830contains similarity to Staphylococcus aureus Surface protein SasB (Fragment).; TR:Q84GB4
23T18D3.8T18D3.8n/achrX 12,437,812
24ZK1240.1ZK1240.1n/achrII 2,330,574contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000315 (Zinc finger, B-box)
25B0507.2B0507.2n/achrV 8,775,382contains similarity to Interpro domain IPR004328 (BRO1)
26T21H3.4T21H3.4n/achrV 1,144,046contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
27cal-1C13C12.1n/achrV 12,515,481cal-1 encodes one of five predicted C. elegans calcium-binding calmodulin homologs (the others being CAL-2, CAL-3, CAL-4, and CMD-1); as loss of cal-1 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any abnormalities, the precise role of CAL-1 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
28srab-12C47A10.6n/achrV 17,782,010C. elegans SRAB-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
29C55H1.1C55H1.1n/achrV 6,851,202contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
30W03B1.9W03B1.9n/achrIV 4,354,761contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
31str-3M7.13n/achrIV 11,099,437str-3 encodes a seven transmembrane chemosensory receptor; STR-3 is expressed in the ASI chemosensory neurons; STR-3 expression in ASI is repressed in the presence of dauer pheromone at concentrations lower than that which induces dauer formation.
32pah-1K08F8.4n/achrII 8,763,866pah-1 encodes a biochemically active phenylalanine-4-hydroxylase orthologous to human PAH (OMIM:261600, mutated in phenylketonuria); recombinant PAH-1 has hydroxylase activity on phenylalanine and tryptophan substrates in vitro; pah-1 is expressed in seam cells, tail hypodermal cells, and ventral hypodermis, with stronger posterior than anterior expression; PAH-1 might help provide tyrosine for cross-linking in the cuticle, and is partially required for the tyrosinemic phenotype of K10C2.4(RNAi) animals.
33F22E5.7F22E5.7n/achrII 2,642,443
34F23D12.3F23D12.3n/achrX 14,442,916
35H32K16.1H32K16.1n/achrI 9,151,388contains similarity to Pfam domain PF01490 Transmembrane amino acid transporter protein contains similarity to Interpro domain IPR013057 (Amino acid transporter, transmembrane)
36C17B7.2C17B7.2n/achrV 3,349,796contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domain IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
37F07E5.8F07E5.8n/achrII 2,074,096contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
38F15E11.11F15E11.11n/achrV 2,332,801contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
39nhr-282F54B8.2n/achrV 15,812,667C. elegans NHR-282 protein; contains similarity to Pfam domain PF00104 Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
40C24A11.6C24A11.6n/achrI 5,396,389
41B0524.5B0524.5n/achrIII 1,892,549contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
42K09D9.11K09D9.11n/achrV 3,999,279contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
43col-64F52F12.2n/achrI 9,894,637C. elegans COL-64 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
44nhr-132R11G11.1n/achrV 535,310C. elegans NHR-132 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
45ZC204.1ZC204.1n/achrII 1,666,906contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
46K11G9.5K11G9.5n/achrV 6,687,134contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
47F59D6.7F59D6.7n/achrV 3,038,633contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR008080 (Parvalbumin), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin))
48K02F2.5K02F2.5n/achrI 6,807,588
49T27A10.2T27A10.2n/achrX 3,586,399
50Y76A2B.5Y76A2B.5n/achrIII 13,547,827contains similarity to Danio rerio Zgc:91819 protein.; TR:Q6GMH4