UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1ifc-1F37B4.20chrV 2,882,485ifc-1 encodes a nonessential intermediate filament protein; IFC-1 is predicted to function as a structural component of the cytoskeleton; IFC-1 has no function in RNAi assays.
2unc-14K10D3.2n/achrI 7,125,516The unc-14 gene encodes an activity required for both axonogenesis and sex myoblast migration.
3F40F4.7F40F4.7n/achrX 3,244,931contains similarity to Pfam domain PF00583 Acetyltransferase (GNAT) family contains similarity to Interpro domains IPR000182 (GCN5-related N-acetyltransferase), IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
4ins-5ZK84.3n/achrII 5,998,628ins-5 encodes an insulin-like peptide of the insulin superfamily of proteins (OMIM:176730, 147440); INS-5 is one of 38 insulin-like peptides in C. elegans and is expressed in the amphid sensory neurons, labial neurons, the nerve ring, other neurons, and the vulva; the precise role of INS-5 in C. elegans development is not yet clear as loss of function does not result in a mutant phenotype.
5abts-1F52B5.1n/achrI 8,302,240abts-1 encodes an anion transporter; when expressed in Xenopus oocytes, ABTS-1 exhibits robust chloride transport, as well as chloride/bicarbonate exchange activity; abts-1 promoter gfp fusions are expressed primarily in neurons and hypodermis, with weak fluorescence also seen in the pharynx and body wall muscle cells.
6nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
7ZK652.8ZK652.8n/achrIII 7,842,935
8clec-149K02F3.5n/achrIII 824,783K02F3.5 encodes a protein with a C-terminal C-type lectin domain that inhibits CEP-1- and HUS-1-dependent germline apoptosis, as do BMK-1, RAD-50, and RAD-51.
9F08D12.1F08D12.1n/achrII 2,790,710contains similarity to Pfam domains PF08492 (SRP72 RNA-binding domain) , PF00515 (Tetratricopeptide repeat) (2), PF07720 (Tetratricopeptide repeat) contains similarity to Interpro domains IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR001440 (Tetratricopeptide TPR-1), IPR013699 (Signal recognition particle, SRP72 subunit, RNA-binding), IPR013026 (Tetratricopeptide region)
10gst-12F37B1.2n/achrII 13,617,244C. elegans GST-12 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
11F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
12folt-1C06H2.4n/achrV 11,142,257folt-1 encodes a folate transporter required for folate uptake; FOLT-1 is orthologous to human SLC19A1 (OMIM:600424), SLC19A2 (OMIM:603941, mutated in thiamine-responsive megaloblastic anemia syndrome), and SLC19A3 (OMIM:606152, mutated in biotin-responsive basal ganglia disease); heterologously expressed FOLT-1 transports folate in vitro; FOLT-1 activity is acid-dependent, is sodium-independent, and is inhibited by folate derivatives, sulfasalazine, or anion transport inhibitors such as 4,4''-diisothio-cyanatostilbene-2,2''-disulphonic acid (DIDS); folt-1(ok1460) and folt-1(RNAi) animals show significantly lowered folate uptake; folt-1 is expressed in several tissues, including (most strongly) pharynx and posterior intestine, as well as head, body wall, and vulva muscles, and gonad sheath cells; FOLT-1's intestinal expression diminishes with age from larvae to adults; both FOLT-1 intestinal expression and whole-animal folate uptake are lowered in folate-supplemented food media; FOLT-1 has no obvious function in mass RNAi assays, perhaps because of genetic redundancy with its paralogs FOLT-2 and FOLT-3; however, folt-1(ok1460) mutants are sluggish and sterile, which might instead indicate that FOLT-1 is required for locomotion and fertility.
13F32H5.4F32H5.4n/achrV 13,362,228contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF00083 (Sugar (and other) transporter) contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR005828 (General substrate transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
14ttll-15K07C5.7n/achrV 10,359,962ttll-15 encodes a putative tubulin polyaminoacid ligase orthologous to Drosophila melanogaster CG4089 and Tetrahymena thermophila TTLL15; TTLL-15 has no obvious function in mass RNAi assays.
15F39H12.3F39H12.3n/achrX 839,898contains similarity to Pfam domains PF00612 (IQ calmodulin-binding motif) (3), PF02197 (Regulatory subunit of type II PKA R-subunit) contains similarity to Interpro domains IPR003117 (cAMP-dependent protein kinase, regulatory subunit, type I/II alpha/beta), IPR000048 (IQ calmodulin-binding region)
16R13D7.2R13D7.2n/achrV 7,410,557contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domain IPR004920 (Protein of unknown function DUF263)
17F16G10.7F16G10.7n/achrII 2,379,927contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
18T28C12.2T28C12.2n/achrV 6,330,074contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
19mec-17F57H12.7n/achrIV 7,985,506mec-17 encodes a protein that has no clearly recognizable motifs yet shares a domain of similarity with an additional C. elegans protein as well as proteins from Drosophila, mouse, and human; MEC-17 activity is required for maintaining the differentiated state of the touch receptors, and hence the animal's touch sensitivity, during later stages of larval development; mec-17 is expressed solely in the touch receptor cells from late embryogenesis through adulthood, and this expression is dependent upon the MEC-3 LIM homeodomain transcription factor; in turn, as MEC-17 is necessary for maintaining differentiated touch receptors, its activity is required for continued expression of MEC-3 and the MEC-7 beta-tubulin.
20T13F2.4T13F2.4n/achrIV 9,790,151contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IIE7
21F53A9.9F53A9.9n/achrX 8,720,477contains similarity to Bacillus subtilis Uncharacterized protein yeeK.; SW:O31510
22math-11C16C4.16n/achrII 1,874,693C. elegans MATH-11 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
23R05D7.4R05D7.4n/achrI 12,182,156contains similarity to Pfam domains PF07819 (PGAP1-like protein) , PF00561 (alpha/beta hydrolase fold) contains similarity to Interpro domains IPR000073 (Alpha/beta hydrolase fold-1), IPR012908 (PGAP1-like), IPR000639 (Epoxide hydrolase-like), IPR008262 (Lipase, active site), IPR003089 (Alpha/beta hydrolase)
24nit-1ZK1058.6n/achrIII 3,923,096C. elegans NIT-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00795 Carbon-nitrogen hydrolase contains similarity to Interpro domains IPR003010 (Nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase), IPR000132 (Nitrilase/cyanide hydratase, conserved site)
25Y17G7B.11Y17G7B.11n/achrII 12,061,387contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
26F55A4.2F55A4.2n/achrX 1,015,147
27cyp-33C7F41B5.2n/achrV 2,251,536C. elegans CYP-33C7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
28ugt-38F10D2.7n/achrV 7,146,544C. elegans UGT-38 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR003567 (Cytochrome c-type biogenesis protein), IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
29F21F8.6F21F8.6n/achrV 8,266,564
30Y37D8A.2Y37D8A.2n/achrIII 12,822,776contains similarity to Pfam domain PF04916 Phospholipase B contains similarity to Interpro domains IPR007000 (Laminin A), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
31ZK742.3ZK742.3n/achrV 7,809,120contains similarity to Pfam domain PF00724 NADH:flavin oxidoreductase / NADH oxidase family contains similarity to Interpro domains IPR013785 (Aldolase-type TIM barrel), IPR001155 (NADH:flavin oxidoreductase/NADH oxidase, N-terminal)
32T10E10.4T10E10.4n/achrX 6,318,637T10E10.4 encodes a large (966-residue) protein, predicted to be secreted, with two N-terminal chitin-binding peritrophin-A domains followed by 14 cysteine-rich domains and one C-terminal EB module; the general organization of T10E10.4 protein resembles that of K04H4.2; T10E10.4 has no obvious function in mass RNAi assays but, like CEJ-1 and CPG-2, might participate in chitin synthesis.
33F09G8.3F09G8.3n/achrIII 8,266,869contains similarity to Pfam domain PF00380 Ribosomal protein S9/S16 contains similarity to Interpro domains IPR000754 (Ribosomal protein S9), IPR014721 (Ribosomal protein S5 domain 2-type fold)
34orai-1C09F5.2n/achrIII 653,677C. elegans ORAI-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF07856 Protein of unknown function (DUF1650) contains similarity to Interpro domain IPR012446 (Protein of unknown function DUF1650)
35ZC190.5ZC190.5n/achrV 8,672,433
36C01B10.7C01B10.7n/achrIV 6,638,773contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
37T07D3.4T07D3.4n/achrII 889,513T07D3.4 is orthologous to the human gene FUKUTIN (FCMD; OMIM:253800), which when mutated leads to disease.
38ZC239.15ZC239.15n/achrII 3,224,089contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
39srh-261K03D7.4n/achrV 17,498,163C. elegans SRH-261 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40F58F9.4F58F9.4n/achrIV 6,231,716contains similarity to Pfam domain PF03312 Protein of unknown function, DUF272 contains similarity to Interpro domain IPR004987 (Protein of unknown function DUF272)
41col-128F12F6.9n/achrIV 11,550,954C. elegans COL-128 protein; contains similarity to Pfam domain PF01391 Collagen triple helix repeat (20 copies) contains similarity to Interpro domains IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
42ugt-42F31F4.7n/achrV 648,465C. elegans UGT-42 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
43F07A11.4F07A11.4n/achrII 11,607,658contains similarity to Pfam domains PF00443 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase) , PF01753 (MYND finger) contains similarity to Interpro domains IPR002893 (Zinc finger, MYND-type), IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2), IPR000694 (Proline-rich region)
44DH11.4DH11.4n/achrII 7,993,221contains similarity to Pfam domain PF00168 C2 domain contains similarity to Interpro domains IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
45abf-4Y38H6C.22n/achrV 20,553,545abf-4 encodes a homolog of the antibacterial factor ASABF from Ascaris suum; ABF-4 may play a role in innate immunity, though at present the only evidence for its having an antimicrobial humoral function is its sequence similarity.
46nhr-74C27C7.3n/achrI 11,430,558C. elegans NHR-74 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
47F32D8.10F32D8.10n/achrV 10,907,944contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
48app-1W03G9.4n/achrI 4,965,983C. elegans APP-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF01321 (Creatinase/Prolidase N-terminal domain) , PF00557 (metallopeptidase family M24) contains similarity to Interpro domains IPR000994 (Peptidase M24, catalytic core), IPR000587 (Creatinase)
49F11E6.6F11E6.6n/achrIV 17,465,196contains similarity to Homo sapiens Damage-regulated autophagy modulator; ENSEMBL:ENSP00000258534
50nspc-13F42F12.6n/achrX 12,357,636C. elegans NSPC-13 protein ;