UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F36H2.2F36H2.20chrI 9,247,697contains similarity to Pfam domain PF01733 Nucleoside transporter contains similarity to Interpro domains IPR002259 (Delayed-early response protein/equilibrative nucleoside transporter), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
2exos-7F31D4.1n/achrV 20,835,609C. elegans EXOS-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF01138 3' exoribonuclease family, domain 1 contains similarity to Interpro domain IPR001247 (Exoribonuclease, phosphorolytic domain 1)
3str-245F32A7.7n/achrI 14,853,699C. elegans STR-245 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
4C05C8.8C05C8.8n/achrV 7,253,723contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
5T02G6.7T02G6.7n/achrI 11,828,074contains similarity to Pfam domains PF00337 (Galactoside-binding lectin) , PF08277 (PAN-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR001079 (Galectin, galactose-binding lectin), IPR013320 (Concanavalin A-like lectin/glucanase, subgroup), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
6R119.1R119.1n/achrI 360,571contains similarity to Interpro domain IPR009080 (Aminoacyl-tRNA synthetase, class 1a, anticodon-binding)
7glr-7C43H6.9n/achrX 2,415,895glr-7 encodes a protein containing a ligand-gated ion channel domain and is a predicted non-NMDA type ionotropic glutamate receptor; expressed in the pharyngeal nervous system.
8C34B7.1C34B7.1n/achrI 8,331,627The C34B7.1 gene encodes a divergent MYST acetyltransferase that is (apparently) unique to Caenorhabditis; it has no well-characterized orthologs in the complete Drosophila or S. cerevisiae genomes, and no obvious orthologs in the draft human genome sequence either.
9T02E1.2T02E1.2n/achrI 8,221,514contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IJZ2
10ZK1128.1ZK1128.1n/achrIII 10,113,863contains similarity to Pfam domain PF02636 Uncharacterized ACR, COG1565 contains similarity to Interpro domain IPR003788 (Protein of unknown function DUF185)
11mom-5T23D8.1n/achrI 9,967,489mom-5 encodes one of four C. elegans members of the Frizzled (Fz) family of seven transmembrane receptors; during development, MOM-5 activity is required for asymmetric cell division in the early embryo as well as for asymmetric cell division during neuronal development; MOM-5::GFP is enriched at the posterior pole of cells prior to division and during later stages of embryogenesis, is found at the leading edges of epidermal cells during ventral enclosure; in neuroblasts, MOM-5 is required for proper subcellular distribution of DSH-2 to the cortex.
12nhr-231Y17D7B.1n/achrV 18,792,886C. elegans NHR-231 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
13C04F5.8C04F5.8n/achrV 5,112,623contains similarity to Bos taurus Similar to C04F5.8.; TR:Q0IIF4
14T21C9.1T21C9.1n/achrV 10,577,614contains similarity to Pfam domain PF00595 PDZ domain (Also known as DHR or GLGF) contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
15Y102A5C.4Y102A5C.4n/achrV 16,923,224contains similarity to Pfam domain PF05075 Protein of unknown function (DUF684) contains similarity to Interpro domain IPR007767 (Protein of unknown function DUF684)
16F22B5.6F22B5.6n/achrII 8,455,504
17F21D5.2F21D5.2n/achrIV 8,729,166contains similarity to Pfam domain PF02338 OTU-like cysteine protease contains similarity to Interpro domain IPR003323 (Ovarian tumour, otubain)
18T22C1.3T22C1.3n/achrI 7,939,331contains similarity to Pfam domain PF06728 GPI transamidase subunit PIG-U contains similarity to Interpro domain IPR009600 (GPI transamidase subunit PIG-U)
19Y37E11B.3Y37E11B.3n/achrIV 3,581,983contains similarity to Homo sapiens Uncharacterized protein C17orf59; ENSEMBL:ENSP00000350621
20arl-5ZK632.8n/achrIII 9,823,591arl-5 encodes a paralog of the ADP-ribosylation factor-like protein EVL-20; ARL-5 is an ortholog of mammalian ARL5.
21K09E3.4K09E3.4n/achrX 17,119,682
22daf-8R05D11.1n/achrI 8,586,024daf-8 encodes a Smad protein that represses dauer development, perhaps by antagonizing DAF-3 activity, and promotes a commitment to reproductive growth; genetic interactions suggest partial functional redundancy with daf-14 with respect to the TGF-beta signaling pathway that regulates dauer formation.
23Y54G9A.5Y54G9A.5n/achrII 13,723,894
24hcp-3F58A4.3n/achrIII 9,615,787The hcp-3 gene encodes a centromere protein (CENP)-A homolog required for kinetochore function; inactivation of hcp-3 in one-cell embryos by RNAi causes a complete loss of kinetochores, with total failure of chromosomes to segregate properly during mitosis, to recruit components to the kinetochore other than HCP-3, or to assemble a stable mitotic spindle; in addition, HCP-4 fails to localize properly to the kinetochore in hcp-3(RNAi) embryos.
25C33H5.8C33H5.8n/achrIV 7,778,475contains similarity to Pfam domain PF00515 Tetratricopeptide repeat contains similarity to Interpro domains IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR001440 (Tetratricopeptide TPR-1), IPR013026 (Tetratricopeptide region)
26T28F2.1T28F2.1n/achrI 3,640,560contains similarity to Pfam domain PF01531 Glycosyl transferase family 11 contains similarity to Interpro domain IPR002516 (Glycosyl transferase, family 11)
27adbp-1VW02B12L.4n/achrII 11,444,624C. elegans ADBP-1 protein ;
28C47G2.4C47G2.4n/achrII 11,292,129contains similarity to Pfam domain PF04791 LMBR1-like membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR006876 (LMBR1-like conserved region)
29F02H6.4F02H6.4n/achrIV 14,217,678contains similarity to Saccharomyces cerevisiae GTPase, required for general translation initiation by promoting Met-tRNAiMet binding to ribosomes and ribosomal subunit joining; homolog of bacterial IF2; SGD:YAL035W
30F29B9.1F29B9.1n/achrIV 4,666,256contains similarity to Pfam domain PF08242 Methyltransferase domain contains similarity to Interpro domain IPR013217 (Methyltransferase type 12)
31C33H5.6C33H5.6n/achrIV 7,776,604contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR000664 (Lethal(2) giant larvae protein), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
32snx-3W06D4.5n/achrI 9,064,058C. elegans SNX-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00787 PX domain contains similarity to Interpro domain IPR001683 (Phox-like)
33tag-296F49D11.9n/achrI 10,934,755C. elegans TAG-296 protein; contains similarity to Pfam domain PF08718 Glycolipid transfer protein (GLTP) contains similarity to Interpro domain IPR014830 (Glycolipid transfer protein, GLTP)
34F35H10.6F35H10.6n/achrIV 8,300,273contains similarity to Pfam domain PF02996 Prefoldin subunit contains similarity to Interpro domains IPR004127 (Prefoldin alpha-like), IPR009053 (Prefoldin)
35C08A9.9C08A9.9n/achrX 17,107,104contains similarity to Pfam domain PF03353 DUF278 contains similarity to Interpro domain IPR005020 (Protein of unknown function DUF278)
36F46C5.4F46C5.4n/achrII 8,837,535
37srd-19F53F1.11n/achrV 13,428,164C. elegans SRD-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
38skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
39C55C3.5C55C3.5n/achrIV 5,699,611contains similarity to Interpro domain IPR001124 (Lipid-binding serum glycoprotein)
40T15D6.10T15D6.10n/achrI 12,395,188contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
41T02C12.2T02C12.2n/achrIII 4,020,894contains similarity to Danio rerio Zgc:56295.; TR:Q7ZU76
42F26A3.7F26A3.7n/achrI 7,675,432contains similarity to Gallus gallus Putative uncharacterized protein.; TR:Q5ZIQ9
43T05E7.3T05E7.3n/achrI 6,190,389contains similarity to Interpro domain IPR000463 (Cytosolic fatty-acid binding)
44edc-3R05D11.8n/achrI 8,603,637C. elegans EDC-3 protein; contains similarity to Interpro domain IPR010920 (Like-Sm ribonucleoprotein-related, core)
45set-4C32D5.5n/achrII 6,330,534set-4 encodes a putative histone H4 lysine-20 methyltransferase; SET-4 is orthologous to Drosophila SUV4-20, and to human SUV420H1 (OMIM:610881) and SUV420H2; neither set-4(n4600) nor set-4(RNAi) have any obvious phenotypes.
46ZK402.5ZK402.5n/achrX 1,399,783contains similarity to Pfam domain PF04435 Domain of unknown function (DUF545) contains similarity to Interpro domain IPR006570 (SPK)
47W06A11.2W06A11.2n/achrII 4,060,321
48M01E5.1M01E5.1n/achrI 13,275,251contains similarity to Ichthyophthirius multifiliis Immobilization antigen isoform.; TR:Q9BMH3
49dhs-11Y39A1A.11n/achrIII 10,641,861dhs-11 encodes a short-chain dehydrogenase predicted to be mitochondrial.
50Y116A8C.8Y116A8C.8n/achrIV 16,932,518contains similarity to Interpro domain IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)