UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F36H12.5F36H12.56e-30chrIV 5,267,206contains similarity to Interpro domain IPR005819 (Histone H5)
2F20H11.4F20H11.4n/achrIII 6,609,417contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
3F35H8.4F35H8.4n/achrII 9,559,658contains similarity to Streptococcus pyogenes Hypothetical protein.; TR:Q8P0S2
4ZK546.7ZK546.7n/achrII 4,931,532contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
5ssq-3ZC477.1n/achrIV 7,112,230C. elegans SSQ-3 protein; contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR006206 (Mevalonate and galactokinase), IPR001553 (RecA bacterial DNA recombination), IPR013286 (Annexin, type VII)
6C05D2.3C05D2.3n/achrIII 5,616,047C05D2.3 generally resembles aromatic-L-amino-acid/L-histidine decarboxylases; however, its predicted protein sequence lacks six residues critical for AADC function; C05D2.3 is dispensable in mass RNAi assays.
7C50F4.10C50F4.10n/achrV 9,530,766contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
8C05B5.2C05B5.2n/achrIII 9,999,425contains similarity to Agrobacterium tumefaciens Peptide synthetase.; TR:Q8UBE4
9C37A2.3C37A2.3n/achrI 6,785,976contains similarity to Pfam domains PF08028 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02770 (Acyl-CoA dehydrogenase, middle domain) , PF00441 (Acyl-CoA dehydrogenase, C-terminal domain) , PF02771 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR013107 (Acyl-CoA dehydrogenase, type 2, C-terminal), IPR006090 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type 1), IPR013786 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, N-terminal), IPR006091 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, central region), IPR006089 (Acyl-CoA dehydrogenase, conserved site), IPR013764 (Acyl-CoA oxidase/dehydrogenase, type1/2, C-terminal), IPR009100 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase, middle and N-terminal), IPR009075 (Acyl-CoA dehydrogenase/oxidase C-terminal), IPR006092 (Acyl-CoA dehydrogenase, N-terminal)
10C38C3.8C38C3.8n/achrV 1,505,005contains similarity to Ascaris suum MFP2b.; TR:Q7YXJ9
11F26D2.10F26D2.10n/achrV 16,427,124contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00023 (Ankyrin repeat) , PF00533 (BRCA1 C Terminus (BRCT) domain) contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR001357 (BRCT)
12C16A11.7C16A11.7n/achrII 4,256,423
13T10H9.3T10H9.3n/achrV 6,654,528contains similarity to Interpro domains IPR010989 (t-SNARE), IPR000727 (Target SNARE coiled-coil region)
14W06D4.3W06D4.3n/achrI 9,059,663contains similarity to Pfam domain PF03114 BAR domain contains similarity to Interpro domain IPR004148 (BAR)
15F38A5.6F38A5.6n/achrIV 6,596,738contains similarity to Pfam domain PF03114 BAR domain contains similarity to Interpro domain IPR004148 (BAR)
16C10G8.2C10G8.2n/achrV 5,314,980contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domain IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa)
17C05C12.5C05C12.5n/achrIV 11,260,772contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ10106 fis, clone HEMBA1002569, highly similar to Homo sapiens protein associated with Myc mRNA (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000353197
18C38C3.3C38C3.3n/achrV 1,497,058
19K02F6.3K02F6.3n/achrII 2,547,902contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
20clec-153F10F2.8n/achrIII 4,636,376C. elegans CLEC-153 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
21F26F4.2F26F4.2n/achrIII 4,911,567F26F4.2 encodes a novel protein with high similarity to C. elegans F37A8.1 and C. briggsae CBG18186.
22C53B4.2C53B4.2n/achrIV 8,966,964contains similarity to Plasmodium vivax Sperm-specific protein Don juan, putative.; TR:A5K197
23ZK1307.3ZK1307.3n/achrII 9,652,584contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
24ZK84.5ZK84.5n/achrII 6,016,343
25C34D4.3C34D4.3n/achrIV 7,153,905contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
26C47A4.3C47A4.3n/achrIV 13,741,621contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
27T27E4.6T27E4.6n/achrV 9,071,672contains similarity to Interpro domain IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
28ZK262.4ZK262.4n/achrV 18,424,010contains similarity to Arabidopsis thaliana Similarity to salt-inducible protein.; TR:Q9LVA2
29C47A4.5C47A4.5n/achrIV 13,745,790contains similarity to Saccharomyces cerevisiae N-terminal domain appears to be involved in cellular responsiveness to RAS.; SGD:YNL138W
30T16G12.7T16G12.7n/achrIII 10,039,210contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
31F44F4.10F44F4.10n/achrII 10,916,498F44F4.1 encodes a nematode-specific sperm protein probably required for a normally high ovulation rate; F44F4.1 has no obvious non-nematode homologs, but does have a putative central coiled-coil domain, and is is paralogous to four other C. elegans proteins (B0207.11, F42G4.6, T08G11.2, and Y81G3A.1); F44F4.1(tm332) hermaphrodites show abnormal egg-laying, retaining significantly fewer eggs than wild-type (perhaps due to a lowered ovulation rate) while retaining late-stage embryos; F44F4.1 has no obvious phenotype in mass RNAi experiments, possibly because of genetic redundancy with its paralogs; F44F4.1 expression is enriched in spermatogenesis.
32F42A9.3F42A9.3n/achrIV 8,617,701
33Y57G7A.5Y57G7A.5n/achrII 1,274,377
34Y106G6D.4Y106G6D.4n/achrI 10,115,663contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
35Y106G6G.4Y106G6G.4n/achrI 10,322,489contains similarity to Equine herpesvirus 1 Glycoprotein X precursor.; SW:P28968
36clec-117B0432.12n/achrII 296,649C. elegans CLEC-117 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR000538 (Link)
37C52E4.7C52E4.7n/achrV 11,995,047C52E4.7 encodes a member of the histidine phosphatase superfamily orthologous to Bombyx mori ecdysteroid phosphate phosphatase (EPP), human STS1 (OMIM:609201) and human UBASH3A (OMIM:605736); C52E4.7 is also paralogous to C. elegans F09C12.8, F53B6.7, F55A11.11, and T07F12.1; while no explicit prediction has been made for C52E4.7's activity, it might be catalytically inactive; as loss of C52E4.7 activity results in no obvious defects, the precise role of C52E4.7 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
38F54C1.8F54C1.8n/achrI 5,005,486
39kin-5T13H10.1n/achrIV 9,968,114kin-5 encodes a predicted protein tyrosine kinase that is most closely related to the non-receptor tyrosine kinases Fes/Fps and Fer that contain an SH2 domain and a tyrosine kinase domain (OMIM:190030, murine Fes appears to be required for hemopoietic homeostasis); as loss of kin-5 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of kin-5 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
40T13F2.12T13F2.12n/achrIV 9,765,986contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
41Y37D8A.8Y37D8A.8n/achrIII 12,867,161contains similarity to Interpro domain IPR006629 (LPS-induced tumor necrosis factor alpha factor)
42C07G1.6C07G1.6n/achrIV 8,209,489
43C54D10.4C54D10.4n/achrV 12,420,859contains similarity to Interpro domain IPR008952 (Tetraspanin)
44C43G2.3C43G2.3n/achrIV 6,578,783
45ZK84.2ZK84.2n/achrII 6,015,055
46F44G4.5F44G4.5n/achrII 8,999,996contains similarity to Anabaena sp Endopeptidase Clp ATP-binding chain B.; TR:Q8YM56
47F11G11.5F11G11.5n/achrII 4,858,520contains similarity to Interpro domains IPR003267 (Small proline-rich), IPR000694 (Proline-rich region)
48Y38H8A.4Y38H8A.4n/achrIV 13,471,382contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
49K11H3.2K11H3.2n/achrIII 9,846,887contains similarity to Homo sapiens Uveal autoantigen; ENSEMBL:ENSP00000314556
50C45G9.9C45G9.9n/achrIII 5,055,142contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5)