UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F36G9.13F36G9.130chrV 15,984,973contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
2T20D4.6T20D4.6n/achrV 3,411,676contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR014752 (Arrestin, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
3Y51B9A.4Y51B9A.4n/achrII 9,408,334contains similarity to Pfam domains PF00339 (Arrestin (or S-antigen), N-terminal domain) , PF02752 (Arrestin (or S-antigen), C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR014756 (Immunoglobulin E-set), IPR011022 (Arrestin-like, C-terminal), IPR011021 (Arrestin-like, N-terminal)
4nhr-72C17A2.8n/achrII 3,849,882C. elegans NHR-72 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
5T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
6C31E10.8C31E10.8n/achrX 14,007,275contains similarity to Pfam domain PF00566 TBC domain contains similarity to Interpro domains IPR000195 (RabGAP/TBC), IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR002011 (Receptor tyrosine kinase, class II, conserved site)
7ttr-40E02C12.4n/achrV 9,354,969C. elegans TTR-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
8twk-36R12G8.2n/achrV 17,745,322C. elegans TWK-36 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
9gcy-14ZC412.2n/achrV 14,865,514gcy-14 encodes a predicted transmembrane guanylyl cyclase; the precise role of GCY-14 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; however, by sequence similarity GCY-14 can be predicted to function in chemosensory signal transduction.
10srt-34F54E2.6n/achrV 2,817,549C. elegans SRT-34 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
11rsp-2W02B12.2n/achrII 11,452,115C. elegans RSP-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00076 RNA recognition motif. (a.k.a. RRM, RBD, or RNP domain) contains similarity to Interpro domains IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1)
12F56H1.5F56H1.5n/achrI 5,757,572F56H1.5 encodes a putative ATP/ADP-activated metallocarboxypeptidase that may function in vivo as an alpha-tubulin C-terminal tyrosine carboxypeptidase; F56H1.5 is orthologous to murine AGTPBP-1/Nna1/pcd (upregulated in damaged mouse spinal cord and mutated in Purkinje cell degeneration) and human AGTPBP1 (OMIM:606830); murine AGTPBP-1 is genetically required for tubulin carboxypeptidase activity in vivo, and F56H1.5's nearest paralog EEED8.6 has biochemical traits consistent with tubulin carboxypeptidase activity; F56H1.5 and its mammalian AGTPBP1 orthologs, along with other proteins, comprise a M14D3 peptidase subfamily.
13F01G10.5F01G10.5n/achrIV 10,229,551contains similarity to Interpro domain IPR011072 (HR1 rho-binding repeat)
14nhr-164C41G6.5n/achrV 15,234,803C. elegans NHR-164 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
15srh-25C54D10.6n/achrV 12,433,068C. elegans SRH-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16R12E2.8R12E2.8n/achrI 4,157,147contains similarity to Galaxea fascicularis Galaxin.; TR:Q8I6S1
17F41E6.9F41E6.9n/achrV 8,605,583contains similarity to Pfam domain PF03357 Snf7 contains similarity to Interpro domain IPR005024 (Snf7)
18T10B11.4T10B11.4n/achrI 6,938,560
19F39B2.7F39B2.7n/achrI 14,772,840contains similarity to Pfam domain PF01926 GTPase of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR005289 (GTP-binding), IPR005225 (Small GTP-binding protein), IPR001806 (Ras GTPase), IPR002917 (GTP-binding protein, HSR1-related), IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR006073 (GTP1/OBG), IPR004520 (tRNA modification GTPase TrmE)
20K07E8.5K07E8.5n/achrII 652,962K07E8.5 encodes a homolog of the functionally active Fmrf Receptor (FR; CG2114) of D. melanogaster; it is thus possible that K07E8.5 is a receptor for one of the FMRF-like neurotransmitters in C. elegans (e.g., FLP-1 through FLP-12).
21srh-252T19C9.3n/achrV 17,222,863C. elegans SRH-252 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
22C25F9.2C25F9.2n/achrV 19,424,086contains similarity to Pfam domain PF03175 DNA polymerase type B, organellar and viral contains similarity to Interpro domains IPR006172 (DNA-directed DNA polymerase, family B), IPR004868 (DNA-directed DNA polymerase, family B, mitochondria/virus), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
23pqn-8C05B5.3n/achrIII 9,996,987The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
24str-73F26D2.1n/achrV 16,431,023C. elegans STR-73 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25fbxa-186F47H4.6n/achrV 17,337,347This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
26F28F9.2F28F9.2n/achrIV 3,840,668
27clec-188M199.3n/achrIV 15,117,866C. elegans CLEC-188 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
28C17B7.5C17B7.5n/achrV 3,336,321contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domains IPR002345 (Lipocalin), IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
29F32H2.8F32H2.8n/achrI 8,992,131contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domains IPR004988 (Protein of unknown function DUF273), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
30sra-18F28C12.2n/achrI 12,692,935C. elegans SRA-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
31F26D11.4F26D11.4n/achrV 7,947,903
32T20D4.9T20D4.9n/achrV 3,404,051T20D4.9 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; T20D4.9 has no clear orthologs in other organisms.
33W04A4.5W04A4.5n/achrI 13,669,210contains similarity to Pfam domain PF02985 HEAT repeat contains similarity to Interpro domains IPR011989 (Armadillo-like helical), IPR000357 (HEAT), IPR016024 (Armadillo-type fold)
34K06H6.2K06H6.2n/achrV 586,550contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
35sra-4AH6.8n/achrII 9,542,193C. elegans SRA-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
36F54F3.4F54F3.4n/achrV 12,923,361contains similarity to Pfam domain PF00106 short chain dehydrogenase contains similarity to Interpro domains IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
37E02H4.2E02H4.2n/achrX 14,279,950contains similarity to Homo sapiens Type-1 protein phosphatase skeletal muscle glycogen targeting subunit; ENSEMBL:ENSP00000284601
38F29G6.2F29G6.2n/achrX 11,510,328contains similarity to Homo sapiens cDNA FLJ43363 fis, clone NT2RP7017474; ENSEMBL:ENSP00000374260
39srh-46T03F7.3n/achrV 11,302,223C. elegans SRH-46 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40T10B11.5T10B11.5n/achrI 6,941,098contains similarity to Pfam domain PF05705 Eukaryotic protein of unknown function (DUF829) contains similarity to Interpro domain IPR008547 (Protein of unknown function DUF829, eukaryotic)
41clec-254F11D11.5n/achrV 18,753,929C. elegans CLEC-254 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
42T09F5.1T09F5.1n/achrV 15,149,875contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
43Y20C6A.3Y20C6A.3n/achrV 17,382,699contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Myo1 is a type II myosin, is localized to the actomyosin ring and is important for cytokinesis.; SGD:YHR023W
44tax-4ZC84.2n/achrIII 9,183,509tax-4 is orthologous to the human gene ROD PHOTORECEPTOR CGMP-GATED CHANNEL (CNGA1; OMIM:123825), which when mutated leads to disease.
45Y59C2A.2Y59C2A.2n/achrII 2,201,637contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
46F36D4.2F36D4.2n/achrV 9,401,020contains similarity to Pfam domain PF04099 Sybindin-like family contains similarity to Interpro domains IPR011012 (Longin-like), IPR007233 (Sybindin-like protein)
47M02B7.5M02B7.5n/achrIV 3,813,489contains similarity to Pfam domains PF00612 (IQ calmodulin-binding motif) , PF01369 (Sec7 domain) contains similarity to Interpro domains IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR000904 (SEC7-like)
48T09E11.8T09E11.8n/achrI 12,351,698contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
49acc-3F55D10.5n/achrX 4,725,216C. elegans ACC-3 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR001390 (Gamma-aminobutyric-acid A receptor, alpha subunit), IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
50ZK488.5ZK488.5n/achrV 594,476contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)