UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F36G9.12F36G9.120chrV 15,980,154contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR001356 (Homeobox), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
2T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
3fbxb-5F45C12.14n/achrII 1,721,873This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
4srj-49T03D3.12n/achrV 2,847,294C. elegans SRJ-49 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5his-10ZK131.4n/achrII 13,823,128his-10 encodes an H4 histone.
6F59A7.8F59A7.8n/achrV 2,010,108contains similarity to Pfam domains PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) , PF00176 (SNF2 family N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR000330 (SNF2-related), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
7Y52B11B.1Y52B11B.1n/achrI 11,123,920contains similarity to Lactococcus lactis FhuD-like protein.; TR:Q8VU74
8R13.3R13.3n/achrIV 10,830,875contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
9gly-16T15D6.2n/achrI 12,380,173gly-16 encodes a protein similar to 2/I N-acetylglucosaminyltransferase; gly-16 is expressed in the seam cells during embryonic stages.
10K02E7.10K02E7.10n/achrII 1,066,288contains similarity to Pfam domain PF00112 Papain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
11his-11ZK131.5n/achrII 13,821,955his-11 encodes an H2B histone; by homology, HIS-11 is predicted to function as a nucleosome component required for packaging of DNA into chromatin; his-11 is a replication-dependent histone locus that resides in the HIS3 cluster on chromosome II.
12T10B10.3T10B10.3n/achrX 15,179,981contains similarity to Pfam domain PF00169 PH domain contains similarity to Interpro domains IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type), IPR004012 (RUN)
13ZK1010.6ZK1010.6n/achrIII 12,989,808contains similarity to Pfam domain PF01666 DX module contains similarity to Interpro domain IPR002593 (Protein of unknown function DX)
14C31H5.1C31H5.1n/achrI 9,028,536contains similarity to Pfam domain PF06342 Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1057) contains similarity to Interpro domains IPR008262 (Lipase, active site), IPR010463 (Protein of unknown function DUF1057, lipase putative)
15Y70D2A.1Y70D2A.1n/achrX 14,922,327contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR008365 (Prostanoid receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
16H39E20.1H39E20.1n/achrX 1,396,448
17sri-1F36G9.8n/achrV 15,966,916C. elegans SRI-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002208 (SecY protein)
18srv-29T13A10.6n/achrIV 6,265,730C. elegans SRV-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
19D1022.4D1022.4n/achrII 7,456,724contains similarity to Pfam domain PF01738 Dienelactone hydrolase family contains similarity to Interpro domain IPR002925 (Dienelactone hydrolase)
20R07A4.4R07A4.4n/achrX 10,753,200contains similarity to Pfam domain PF00024 PAN domain contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR003609 (Apple-like), IPR003014 (N/apple PAN), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site)
21R13D11.1R13D11.1n/achrV 818,109
22R07C3.3R07C3.3n/achrII 939,772contains similarity to Pfam domain PF02485 Core-2/I-Branching enzyme contains similarity to Interpro domain IPR003406 (Glycosyl transferase, family 14)
23srh-182ZK228.5n/achrV 18,472,715C. elegans SRH-182 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24his-15ZK131.9n/achrII 13,818,464his-15 encodes an H2B histone.
25ugt-49AC3.2n/achrV 10,373,259C. elegans UGT-49 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
26F47H4.2F47H4.2n/achrV 17,356,736This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
27twk-23F19D8.1n/achrX 13,819,543twk-23 encodes one of 44 C. elegans TWK (two-P domain K+) potassium channel subunits that contain two pore-forming domains and four transmembrane domains; the precise role of TWK-23 in C. elegans development and/or behavior is not yet known, however TWK-23 may function redundantly with other TWK channels; TWK-23 is expressed in neurons, muscle, the posterior intestine, and diffusely in many other tissues.
28C32B5.12C32B5.12n/achrII 952,421
29C44H9.4C44H9.4n/achrV 12,837,723contains similarity to Interpro domain IPR000839 (Porin, Oms28 type)
30ugt-7C13D9.9n/achrV 4,998,788C. elegans UGT-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF04101 (Glycosyltransferase family 28 C-terminal domain) , PF00201 (UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase) contains similarity to Interpro domains IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase), IPR007235 (Glycosyl transferase, family 28, C-terminal)
31sri-24C41G6.11n/achrV 15,212,913C. elegans SRI-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32srj-57T03D3.14n/achrV 2,854,982C. elegans SRJ-57 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
33fbxb-40M01D1.9n/achrII 1,049,413This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
34T14C1.2T14C1.2n/achrX 14,400,452contains similarity to Homo sapiens MHC class I molecule; ENSEMBL:ENSP00000252229
35T22B7.3T22B7.3n/achrX 5,648,750contains similarity to Pfam domain PF02274 Amidinotransferase contains similarity to Interpro domain IPR003198 (Amidinotransferase)
36T25D10.4T25D10.4n/achrII 6,408,988
37C14A6.8C14A6.8n/achrV 18,170,317contains similarity to Gallus gallus Cellular tumor antigen p53 (Tumor suppressor p53).; SW:P53_CHICK
38C14C6.8C14C6.8n/achrV 552,129contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
39tag-81T14G12.2n/achrX 3,730,613C. elegans TAG-81 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000727 (Target SNARE coiled-coil region)
40R03G8.4R03G8.4n/achrX 13,102,677contains similarity to Pfam domain PF01433 Peptidase family M1 contains similarity to Interpro domains IPR014782 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase, N-terminal), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR001930 (Peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase)
41nac-2R107.1n/achrIII 9,040,048nac-2 encodes a high affinity sodium-coupled citrate transporter that is orthologous to the mammalian citrate transporter NaCT and is one of four C. elegans proteins related to Drosophila Indy; when expressed in a heterologous system, NAC-2 exhibits high affinity sodium/citrate and sodium/succinate cotransporter activity, although the transport rate for citrate is much higher than that for succinate; nac-2::gfp reporter fusions are expressed in the intestine, from early larval stages through adulthood; the effects of nac-2(RNAi) are variable, with reports of a 19% increase in lifespan accompanied by decreased body size and fat content in affected animals and reports of no apparent decrease in average lifespan.
42srt-9C50H11.5n/achrV 3,078,685C. elegans SRT-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
43glb-22R11H6.3n/achrV 14,605,162glb-22 encodes a globin with no obvious function in mass RNAi assays.
44K07E8.10K07E8.10n/achrII 666,102
45H23N18.5H23N18.5n/achrV 4,912,068contains similarity to Interpro domains IPR016090 (Phospholipase A2), IPR013090 (Phospholipase A2, active site)
46fbxa-167C31C9.3n/achrII 13,642,551This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
47F22F1.2F22F1.2n/achrX 8,150,103contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
48R03D7.2R03D7.2n/achrII 10,933,886contains similarity to Rhodopirellula baltica DNA-binding protein SMUBP-2.; TR:Q7UWP1
49F09B12.5F09B12.5n/achrX 15,086,421contains similarity to Pfam domain PF00057 Low-density lipoprotein receptor domain class A contains similarity to Interpro domain IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich)
50cyp-34A6B0213.11n/achrV 3,959,699C. elegans CYP-34A6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)