UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description                                       
1F36D1.7F36D1.73e-45chrI 11,263,396contains similarity to Bacteriophage T5 L-shaped tail fiber protein (LTF protein).; SW:VLTF_BPT5
2F58E10.7F58E10.7n/achrV 13,993,064contains similarity to Xenopus laevis FK506-binding protein.; TR:Q9I8P8
3T24F1.5T24F1.5n/achrII 11,319,376contains similarity to Bombyx mori Lebocin 1/2 precursor.; SW:LEB1_BOMMO
4F14F11.2F14F11.2n/achrII 8,295,048contains similarity to Rhodopirellula baltica Methanol dehydrogenase regulatory protein (EC 1.1.1.244).; TR:Q7UX83
5fbxa-24F54D10.2n/achrII 3,817,370C. elegans FBXA-24 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
6F47B8.2F47B8.2n/achrV 14,316,299contains similarity to Lyngbya lagerheimii CP 43 protein (Fragment).; TR:Q937F7
7Y73F4A.3Y73F4A.3n/achrIV 9,040,014contains similarity to Pfam domain PF03351 DOMON domain contains similarity to Interpro domains IPR005018 (DOMON related), IPR008960 (Carbohydrate-binding family 9/cellobiose dehydrogenase, cytochrome), IPR013050 (DOMON)
8F46A8.7F46A8.7n/achrI 11,238,164contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein MGC35285; ENSEMBL:ENSP00000279688
9ttr-27R90.2n/achrV 12,903,803C. elegans TTR-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
10nlp-12M01D7.5n/achrI 1,843,618nlp-12 encodes two predicted neuropeptide-like proteins; nlp-12 is part of a LQFamide neuropeptide family that has members in at least one other nematode species; nlp-12 is expressed in one tail neuron; as loss of nlp-12 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of nlp-12-encoded peptides in development and/or behavior is not yet known.
11ttr-29R90.4n/achrV 12,906,429C. elegans TTR-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF01060 Transthyretin-like family contains similarity to Interpro domain IPR001534 (Transthyretin-like)
12F12D9.2F12D9.2n/achrX 8,646,792
13sbt-1T03D8.3n/achrV 20,823,688C. elegans SBT-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF05281 Neuroendocrine protein 7B2 precursor (Secretogranin V) contains similarity to Interpro domain IPR007945 (Neuroendocrine 7B2 precursor)
14nlp-8D2005.2n/achrI 7,801,131C. elegans NLP-8 protein ;
15T10G3.1T10G3.1n/achrV 13,471,322contains similarity to Saccharomyces cerevisiae interacts with Sin1p; SGD:YER047C
16lact-6C06A12.5n/achrIV 17,430,817lact-6 encodes a beta-lactamase domain-containing protein that contains a predicted signal sequence in its N terminus.
17nlp-14D1009.4n/achrX 8,918,369C. elegans NLP-14 protein; contains similarity to Interpro domain IPR005829 (Sugar transporter, conserved site)
18F07C3.9F07C3.9n/achrV 9,254,456
19nlp-3F48C11.3n/achrX 13,178,076nlp-3 encodes a neuropeptide-like protein of the GFxGF family with similarity to orcokinins, highly conserved peptides native to crustaceans that enhance hindgut contractions; NLP-3 is expressed in neurons in the head, pharynx, and vulva, and in the intestine; the precise role of NLP-3 in nervous system function and development is not yet clear.
20ins-18T28B8.2n/achrI 8,148,533ins-18 encodes one of 40 C. elegans insulin/IGF-like peptides; INS-18, along with INS-1, are the only two C. elegans insulins that contain a C peptide, characteristic of mammalian insulins, connecting the B and A chains; overexpression of ins-18 induces dauer arrest at 26 degrees C and enhances the dauer arrest seen in a daf-2 mutant at 20 degrees C, suggesting that INS-18 functions to antagonize DAF-2 receptor signaling; ins-18::gfp reporters are expressed in neurons and the intestine.
21flp-21C26F1.10n/achrV 7,793,674flp-21 encodes a single FMRFamide-related neuropeptide (FaRP) that serves as a ligand for NPR-1, a G protein-coupled receptor that regulates social versus solitary feeding behavior in several Caenorhabditis species; genetic analysis suggests that FLP-21 acts through NPR-1 to inhibit social feeding behavior; FLP-21 is expressed in the ADL, ASE and ASH sensory neurons, the URA motor neurons, the MC, M2 and M4 pharyngeal neurons, and the intestine; flp-21 encodes the only FMRFamide-related neuropeptide (FaRP) encoded by the C. elegans genome that activates both the social (215F) and the solitary (215V) forms of NPR-1 in both Xenopus oocytes and pharyngeal assays.
22flp-19M79.4n/achrX 10,605,248C. elegans FLP-19 protein ;
23C08E8.4C08E8.4n/achrV 18,372,276contains similarity to Pfam domain PF08719 Domain of unknown function (DUF1768) contains similarity to Interpro domain IPR012816 (Conserved hypothetical protein CHP02464)
24C03G6.17C03G6.17n/achrV 7,380,393contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
25lys-3Y22F5A.6n/achrV 10,282,795lys-3 encodes one of a family of ten C. elegans lysozyme genes that are homologous to lysozymes in the amoeboid protozoon Entamoeba histolytica.
26C17G10.7C17G10.7n/achrII 5,607,281
27T07D1.3T07D1.3n/achrX 2,443,181contains similarity to Interpro domain IPR016160 (Aldehyde dehydrogenase, conserved site)
28F08G12.8F08G12.8n/achrX 11,317,416contains similarity to Mus musculus Tenascin-R.; TR:Q8BYI9
29nlp-35C33A12.2n/achrIV 9,518,633C. elegans NLP-35 protein ;
30nlp-37F48B9.4n/achrX 2,163,570C. elegans NLP-37 protein ;
31ZK970.7ZK970.7n/achrII 10,312,538contains similarity to Pfam domain PF02520 Domain of unknown function DUF148 contains similarity to Interpro domain IPR003677 (Protein of unknown function DUF148)
32E04F6.9E04F6.9n/achrII 7,211,856
33T26G10.5T26G10.5n/achrIII 9,426,015contains similarity to Streptococcus pyogenes Hypothetical protein SPy0952.; TR:Q9A032
34cal-2C18E9.1n/achrII 8,961,053cal-2 encodes a calmodulin homolog required for embryonic development or viability; CAL-2 is closely similar to its paralogs CAL-1, CAL-3, CAL-4 and CMD-1.
35C34F11.8C34F11.8n/achrII 5,210,353contains similarity to Interpro domain IPR002952 (Eggshell protein)
36F11C1.4F11C1.4n/achrX 12,979,059contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG9186-PA;; FLYBASE:CG9186
37K02A6.2K02A6.2n/achrX 8,224,536
38F53A9.7F53A9.7n/achrX 8,716,682contains similarity to Interpro domain IPR002395 (HMW kininogen)
39pqn-98ZK488.7n/achrV 603,936The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
40K01A2.10K01A2.10n/achrII 322,278contains similarity to Homo sapiens Coiled-coil domain-containing protein 92; ENSEMBL:ENSP00000238156
41nlp-30B0213.5n/achrV 3,982,348nlp-30 encodes five predicted neuropeptide-like proteins; in C. elegans, nlp-30 is part of the YGGWamide neuropeptide family that also contains nlp-24, nlp-25, and nlp-27-32; nlp-30 is expressed in the hypodermis, suggesting that the peptides it encodes may have a non-neuronal function; as loss of nlp-30 activity via large-scale RNAi screens does not result in any obvious abnormalities, the precise role of the nlp-30-encoded peptides in development and/or behavior is not yet known.
42F53A9.1F53A9.1n/achrX 8,711,652contains similarity to Interpro domains IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR002395 (HMW kininogen)
43F53A9.6F53A9.6n/achrX 8,713,583contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR002395 (HMW kininogen)
44C32H11.3C32H11.3n/achrIV 12,919,384contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
45C07A9.8C07A9.8n/achrIII 9,688,522contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
46tag-243T04A8.4n/achrIII 4,686,618C. elegans TAG-243 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding)
47Y51A2B.1Y51A2B.1n/achrV 18,373,264contains similarity to Pfam domain PF08719 Domain of unknown function (DUF1768) contains similarity to Interpro domains IPR012816 (Conserved hypothetical protein CHP02464), IPR016160 (Aldehyde dehydrogenase, conserved site)
48F52E1.8F52E1.8n/achrV 8,393,368contains similarity to Pfam domains PF00300 (Phosphoglycerate mutase family) , PF00328 (Histidine acid phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR000560 (Histidine acid phosphatase), IPR013078 (Phosphoglycerate mutase)
49nlp-7F18E9.2n/achrX 8,593,444C. elegans NLP-7 protein ;
50flp-24C24A1.1n/achrIII 725,550C. elegans FLP-24 protein ;