UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1sre-22F36D1.20chrI 11,284,373C. elegans SRE-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
2ZK353.5ZK353.5n/achrIII 8,394,543
3tba-5F16D3.1n/achrI 8,355,612tba-5 encodes one of nine C. elegans alpha tubulins; by homology, TBA-5 is predicted to be a component of microtubules; as loss of tba-5 function via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any obvious abnormalities, TBA-5 likely functions redundantly with other alpha tubulins as a basic component of cellular architecture that may play additional roles in processes such as cell division, cell movement, and intracellular transport.
4fbxa-135T06E6.5n/achrV 15,402,649This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
5T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
6clec-143ZK673.9n/achrII 10,469,224C. elegans CLEC-143 protein; contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
7ifta-1C54G7.4n/achrX 5,549,123C. elegans IFTA-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR017233 (WD repeat protein 35), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
8sra-7AH6.11n/achrII 9,545,368C. elegans SRA-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
9rap-2C25D7.7n/achrV 15,062,961rap-2 encodes a Ras-related GTPase that is most similar to the RAP2 members of the Ras GTPase superfamily; by homology, RAP-2 is predicted to function as a membrane-localized GTPase that likely plays a role in signal transduction; as animals homozygous for a rap-2 deletion mutation show no obvious abnormalities, the precise role of RAP-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
10M01G12.10M01G12.10n/achrI 12,119,338contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0477; ENSEMBL:ENSP00000316434
11C01C4.2C01C4.2n/achrX 3,717,428
12K04A8.2K04A8.2n/achrV 6,563,097contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domain IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species)
13sre-51C50E10.100.00000006chrII 12,312,675C. elegans SRE-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
14B0212.1B0212.1n/achrIV 3,575,057contains similarity to Pfam domain PF03189 Protein of unknown function, DUF270 contains similarity to Interpro domain IPR004878 (Protein of unknown function DUF270)
15str-141F47G9.2n/achrV 11,323,048C. elegans STR-141 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16T02H6.10T02H6.10n/achrII 680,250
17nhr-220T19H12.8n/achrV 4,883,423C. elegans NHR-220 protein; contains similarity to Pfam domain PF00105 Zinc finger, C4 type (two domains) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
18ckr-1T23B3.4n/achrI 6,688,888T23B3.4 encodes a seven transmembrane receptor that is most closely related to the mammalian cholecystokinin receptors; loss of T23B3.4 activity via RNAi, either singly or in combination with another cholecystokinin receptor-encoding gene, Y39A3B.5, has no effect on fat metabolism, however large-scale RNAi screens have reported that T23B3.4(RNAi) results in embryonic lethality and reduced brood sizes; a T23B3.4::GFP reporter is expressed in a subset of nerve ring neurons.
19T05A6.5T05A6.5n/achrII 7,824,034contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
20sre-4T13F2.50.00002chrIV 9,782,834C. elegans SRE-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
21C24A8.5C24A8.5n/achrX 4,328,634
22F20E11.5F20E11.5n/achrV 17,461,590contains similarity to Pfam domain PF03436 Domain of unknown function (DUF281) contains similarity to Interpro domain IPR005098 (Protein of unknown function DUF281)
23clec-243Y68A4B.1n/achrV 17,248,138C. elegans CLEC-243 protein; contains similarity to Pfam domain PF01764 Lipase (class 3) contains similarity to Interpro domains IPR002921 (Lipase, class 3), IPR008262 (Lipase, active site)
24F26A1.7F26A1.7n/achrIII 4,819,598
25C17H1.5C17H1.5n/achrI 13,115,023contains similarity to Mus musculus Inner centromere protein.; SW:Q9WU62
26T28C6.7T28C6.7n/achrIV 8,828,801contains similarity to Interpro domain IPR009055 (UvrB, C-terminal UvrC-binding)
27C49A9.7C49A9.7n/achrIV 6,203,875contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR001681 (Neurokinin receptor), IPR005395 (Neuropeptide FF receptor), IPR005384 (Duffy antigen/chemokine receptor), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
28E03H4.3E03H4.3n/achrI 12,406,224contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
29C46E10.9C46E10.9n/achrII 3,728,602contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
30sre-13C38C6.40.00002chrII 14,635,649C. elegans SRE-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
31F15D3.7F15D3.7n/achrI 11,579,107contains similarity to Pfam domain PF02466 Tim17/Tim22/Tim23 family contains similarity to Interpro domain IPR003397 (Mitochondrial import inner membrane translocase, subunit Tim17/22)
32F37H8.2F37H8.2n/achrII 11,173,534contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Structural maintenance of chromosomes (SMC) protein; SGD:YOL034W
33C46C2.3C46C2.3n/achrIV 9,226,726contains similarity to Tropheryma whipplei DNA repair protein RecN.; TR:Q83NU4
34F53F1.6F53F1.6n/achrV 13,416,842contains similarity to Aeropyrum pernix Elongation factor 1-beta (EF-1-beta) (aEF-1beta).; SW:EF1B_AERPE
35srbc-66T24A6.5n/achrV 3,531,539C. elegans SRBC-66 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
36srt-30R08F11.2n/achrV 3,799,527C. elegans SRT-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
37R119.2R119.2n/achrI 370,004contains similarity to Pfam domain PF00557 metallopeptidase family M24 contains similarity to Interpro domains IPR000994 (Peptidase M24, catalytic core), IPR001714 (Peptidase M24, methionine aminopeptidase)
38C02E7.8C02E7.8n/achrV 4,920,552
39T24D5.4T24D5.4n/achrX 12,597,224contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
40F10A3.12F10A3.12n/achrV 16,164,918contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41W09C3.3W09C3.3n/achrI 4,708,334contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
42W01C9.2W01C9.2n/achrII 8,537,366contains similarity to Chlamydia pneumoniae Probable serine/threonine-protein kinase 1 (EC 2.7.1.37).; SW:PKN1_CHLPN
43srw-4F37B4.8n/achrV 2,887,985C. elegans SRW-4 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
44puf-4M4.2n/achrIV 3,207,566C. elegans PUF-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00806 Pumilio-family RNA binding repeat contains similarity to Interpro domains IPR011989 (Armadillo-like helical), IPR001313 (Pumilio RNA-binding region), IPR016024 (Armadillo-type fold)
45sri-46K07E8.11n/achrII 670,321C. elegans SRI-46 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
46R155.4R155.4n/achrIII 1,978,876contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008967 (p53-like transcription factor, DNA-binding), IPR003125 (Protein of unknown function WSN), IPR005427 (Salmonella/Shigella invasin protein C)
47C50H2.5C50H2.5n/achrV 9,919,252contains similarity to Interpro domains IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
48Y51H1A.7Y51H1A.7n/achrII 13,897,024contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR000783 (RNA polymerase, subunit H/Rpb5 C-terminal)
49srh-204E03D2.3n/achrV 4,239,757C. elegans SRH-204 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50F52D10.6F52D10.6n/achrX 11,583,279contains similarity to Pfam domain PF00169 PH domain contains similarity to Interpro domains IPR000219 (Dbl homology (DH) domain), IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR011993 (Pleckstrin homology-type)