UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F35G8.1F35G8.10chrX 9,317,241contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR005395 (Neuropeptide FF receptor), IPR000611 (Neuropeptide Y receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
4C34D1.1C34D1.1n/achrV 13,224,279contains similarity to Pfam domain PF00751 (DM DNA binding domain)
5sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6cyp-34A8B0213.14n/achrV 3,966,310C. elegans CYP-34A8 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR002397 (Cytochrome P450, B-class), IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
7sre-44W07G1.2n/achrII 13,950,633C. elegans SRE-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
8ncr-2F09G8.4n/achrIII 8,261,990ncr-2 encodes a homolog of human NPC1, which when mutated leads to Niemann-Pick disease, type C (OMIM:257220).
9Y12A6A.2Y12A6A.2n/achrX 13,619,323contains similarity to Phaseolus lunatus Double-headed bowman-birk inhibitor (Fragment).; TR:Q941H3
10ceh-17D1007.1n/achrI 4,569,495ceh-17 encodes a phox-2-like homeodomain protein that is a member of the Q50 paired-like class of homeobox proteins and the vertebrate orthologue of Phox2a and Phox2b; that affects ALA and SIA axonal development; ceh-17 affects ALA and SIA antero-posterior axonal growth and navigation, and is expressed in five neurons of the ring ganglia (ALA and the 4 SIAs) with strongest expression in embryos and in L1 stage larvae.
11sri-20AC3.1n/achrV 10,369,184C. elegans SRI-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
12R10A10.1R10A10.1n/achrI 6,418,689
13K10C9.1K10C9.1n/achrV 1,077,400
14str-87F59E11.16n/achrV 8,987,304C. elegans STR-87 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15srh-32Y26G10.2n/achrV 17,702,215C. elegans SRH-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16T25B6.5T25B6.5n/achrX 9,021,091
17C24G7.4C24G7.4n/achrI 4,096,469contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
18Y38H6C.17Y38H6C.17n/achrV 20,537,681Y38H6C.17 encodes a putative amino acid transporter that inhibits CEP-1- and HUS-1-dependent germline apoptosis, as do BMK-1, RAD-50, and RAD-51; Y38H6C.17 has 11 predicted transmembrane alpha-helices; Y38H6C.17 has multiple C. elegans paralogs and non-nematode orthologs, including budding yeast AVT3 and AVT4 and human SLC36A1 (OMIM:606561).
19F45E12.6F45E12.6n/achrII 7,313,979
20srsx-39M01B2.9n/achrV 15,255,926C. elegans SRSX-39 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
21C36B7.3C36B7.3n/achrX 7,101,897
22C03C10.7C03C10.7n/achrIII 4,096,446contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Profilin synthetic lethal protein, has region of coiled-coil structure; subunit of the Exocyst complex--the Exocyst complex contains the gene products encoded by SEC3, SEC5, SEC6, SEC8, SEC10, SEC15 and EXO70 and is required for exocytosis; SGD:YER008C
23srh-109T19C9.4n/achrV 17,219,817C. elegans SRH-109 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24srbc-79B0250.6n/achrV 20,487,016C. elegans SRBC-79 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
25str-140C09H5.3n/achrV 8,066,820C. elegans STR-140 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26Y57A10B.2Y57A10B.2n/achrII 12,376,431contains similarity to Homo sapiens RNA binding protein; ENSEMBL:ENSP00000301740
27F11A5.7F11A5.7n/achrV 16,205,976contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
28C03B1.1C03B1.1n/achrX 6,374,577
29sodh-2K12G11.4n/achrV 11,890,433C. elegans SODH-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00107 (Zinc-binding dehydrogenase) , PF08240 (Alcohol dehydrogenase GroES-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR013149 (Alcohol dehydrogenase, zinc-binding), IPR011032 (GroES-like), IPR013154 (Alcohol dehydrogenase GroES-like), IPR002085 (Alcohol dehydrogenase superfamily, zinc-containing), IPR016040 (NAD(P)-binding), IPR002328 (Alcohol dehydrogenase, zinc-containing, conserved site)
30C14A6.5C14A6.5n/achrV 18,164,125contains similarity to Arabidopsis thaliana Calreticulin 2 precursor.; SW:CRT2_ARATH
31Y26D4A.5Y26D4A.5n/achrI 13,076,809contains similarity to Staphylococcus aureus Hypothetical protein SAV2385 (Hypothetical protein MW2305).; TR:Q99RP4
32uvt-3C42D8.3n/achrX 5,090,152C. elegans UVT-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF03630 Fumble contains similarity to Interpro domains IPR002791 (Protein of unknown function DUF89), IPR015844 (Pantothenate kinase, acetyl-CoA regulated, two-domain type), IPR011602 (Fumble)
33srw-23F49A5.8n/achrV 16,874,669C. elegans SRW-23 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
34C03A7.13C03A7.13n/achrV 5,191,814contains similarity to Interpro domains IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
35F54G2.2F54G2.2n/achrX 2,636,226contains similarity to Pfam domain PF00098 Zinc knuckle contains similarity to Interpro domains IPR009007 (Peptidase aspartic, catalytic), IPR001969 (Peptidase aspartic, active site), IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
36C17B7.8C17B7.8n/achrV 3,322,428C17B7.8 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; C17B7.8 has no clear orthologs in other organisms.
37F40B5.1F40B5.1n/achrX 8,376,670F40B5.1 encodes a neprilysin; neprilysins are thermolysin-like zinc metallopeptidases, found on the outer surface of animal cells, that negatively regulate small signalling peptides (e.g., enkephalin, tachykinin, insulin, and natriuretic peptides) by cleaving them; F40B5.1 has no clear orthologs in other organisms.
38C17B7.3C17B7.3n/achrV 3,343,332contains similarity to Pfam domain PF01579 Domain of unknown function DUF19 contains similarity to Interpro domains IPR016638 (Uncharacterised conserved protein UPF0376), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
39sri-45K07E8.9n/achrII 660,949C. elegans SRI-45 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40fbxa-41F52D2.1n/achrX 1,949,939This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
41F27C1.11F27C1.11n/achrI 5,439,915contains similarity to Pfam domains PF00612 (IQ calmodulin-binding motif) , PF03607 (Doublecortin) , PF01477 (PLAT/LH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR001024 (Lipoxygenase, LH2), IPR008976 (Lipase/lipooxygenase, PLAT/LH2), IPR003533 (Doublecortin), IPR000048 (IQ calmodulin-binding region)
42sre-14C42C1.1n/achrIV 12,260,640C. elegans SRE-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000326 (Phosphatidic acid phosphatase type 2/haloperoxidase), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
43str-131C09H5.6n/achrV 8,081,002C. elegans STR-131 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
44T25E4.2T25E4.2n/achrII 5,581,240
45B0034.2B0034.2n/achrII 5,944,245
46C15H9.2C15H9.2n/achrX 6,119,566contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
47F35E2.1F35E2.1n/achrI 11,739,734contains similarity to Pfam domain PF06681 Protein of unknown function (DUF1182) contains similarity to Interpro domains IPR002091 (Aromatic amino acid permease), IPR010601 (Protein of unknown function DUF1182)
48F54H5.3F54H5.3n/achrII 6,622,759contains similarity to Pfam domain PF00635 MSP (Major sperm protein) domain contains similarity to Interpro domains IPR008962 (PapD-like), IPR000535 (Major sperm protein)
49C31E10.4C31E10.4n/achrX 13,989,751
50B0310.3B0310.3n/achrX 512,692