UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F35G12.7F35G12.72e-61chrIII 4,586,958contains similarity to Pfam domain PF03091 CutA1 divalent ion tolerance protein contains similarity to Interpro domains IPR004323 (Divalent ion tolerance protein, CutA1), IPR011322 (Nitrogen regulatory PII-like, alpha/beta)
2srab-20T20D4.1n/achrV 3,429,701C. elegans SRAB-20 protein; contains similarity to Interpro domain IPR002184 (Serpentine beta receptor)
3F47B7.3F47B7.3n/achrX 3,763,711contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
4M110.3M110.3n/achrII 8,215,496contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR011016 (Zinc finger, variant RING-type)
5F35H10.6F35H10.6n/achrIV 8,300,273contains similarity to Pfam domain PF02996 Prefoldin subunit contains similarity to Interpro domains IPR004127 (Prefoldin alpha-like), IPR009053 (Prefoldin)
62L52.12L52.1n/achrII 3,2652L52.1 encodes a protein with sequence similarity to GLI-family zinc-finger transcription factors; deletion mutations in 2L52.1 are reported to be homozygous viable.
7F42A6.5F42A6.5n/achrIV 3,331,304contains similarity to Interpro domain IPR001357 (BRCT)
8R144.6R144.6n/achrIII 5,003,956contains similarity to Pfam domain PF07857 CEO family (DUF1632) contains similarity to Interpro domain IPR012435 (Protein of unknown function DUF1632)
9mnm-2C10A4.8n/achrX 7,423,795C. elegans MNM-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
10F53F8.5F53F8.5n/achrV 20,697,686contains similarity to Pfam domain PF00536 SAM domain (Sterile alpha motif) contains similarity to Interpro domains IPR010993 (Sterile alpha motif homology), IPR013761 (Sterile alpha motif-type), IPR001660 (Sterile alpha motif SAM)
11F20B6.7F20B6.7n/achrX 4,207,129
12srx-48T26H8.2n/achrV 15,303,024C. elegans SRX-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
13C07B5.6C07B5.6n/achrX 9,520,189contains similarity to Helicobacter pylori Hypothetical protein HP1327.; TR:O25885
14nas-21T11F9.5n/achrV 11,473,207nas-21 encodes an astacin-like metalloprotease.
15F56H6.4F56H6.4n/achrI 12,291,320contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
16srt-73T06C10.2n/achrIV 7,880,158C. elegans SRT-73 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
17W01A11.2W01A11.2n/achrV 6,497,783contains similarity to Pfam domain PF03982 Diacylglycerol acyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR007130 (Diacylglycerol acyltransferase)
18T15D6.10T15D6.10n/achrI 12,395,188contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
19sdz-20F53A2.2n/achrIII 13,335,391C. elegans SDZ-20 protein
20C46A5.8C46A5.8n/achrIV 7,769,193
21W02D7.5W02D7.5n/achrV 8,298,506contains similarity to Interpro domain IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase)
22C46E10.8C46E10.8n/achrII 3,726,646contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR003604 (Zinc finger, U1-type), IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
23JC8.4JC8.4n/achrIV 13,243,908contains similarity to Pfam domain PF00383 Cytidine and deoxycytidylate deaminase zinc-binding region contains similarity to Interpro domains IPR016192 (APOBEC/CMP deaminase, zinc-binding), IPR002125 (CMP/dCMP deaminase, zinc-binding), IPR016193 (Cytidine deaminase-like)
24C34D4.13C34D4.13n/achrIV 7,133,813
25fbxb-34W08F4.2n/achrII 589,015This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
26M01G12.5M01G12.5n/achrI 12,130,715contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
27T24E12.3T24E12.3n/achrII 3,776,733
28mls-1H14A12.4n/achrIII 7,461,052mls-1 encodes a T-box transcription factor orthologous to members of the Tbx1 subfamily of T-box transcription factors (OMIM:602054, mutations in human TBX1 are associated with the developmental disorder DiGeorge syndrome (DGS)/velocardiofacial syndrome (VCFS)); MLS-1 is required for fate specification of the eight nonstriated uterine muscle cells generated during postembryonic development, and ectopic expression of MLS-1 is sufficient for uterine muscle specification in other mesodermal lineages; mls-1 reporter gene expression is detected in uterine progenitors and differentiated uterine muscles, Type 2 vulval muscles, the left and right intestinal muscles, and the anal depressor muscle; mls-1 expression is positively regulated by the basic helix-loop-helix transcription factors HLH-8/Twist and HLH-2/Daughterless.
29M01E11.1M01E11.1n/achrI 5,582,772contains similarity to Pfam domain PF04140 Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (ICMT) family contains similarity to Interpro domain IPR007269 (Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase)
30srw-142H05B21.3n/achrV 2,957,658C. elegans SRW-142 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
31srh-52R08H2.7n/achrV 15,375,587C. elegans SRH-52 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32srbc-7C18B10.4n/achrV 7,486,852C. elegans SRBC-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
33C47F8.4C47F8.4n/achrI 12,317,914contains similarity to Pfam domain PF03360 Glycosyltransferase family 43 contains similarity to Interpro domain IPR005027 (Glycosyl transferase, family 43)
34R107.2R107.2n/achrIII 9,044,850contains similarity to Pfam domain PF01256 Carbohydrate kinase contains similarity to Interpro domain IPR000631 (Carbohydrate kinase)
35C01F6.1C01F6.1n/achrIV 9,098,665C01F6.1 encodes a putative calcium-dependent phospholipid binding protein of the copine family; C01F6.1 is required for sperm to normally migrate towards a PUFA-based signal exuded by oocytes; C01F6.1(RNAi) hermaphrodites are infertile, both through aberrant loss of their own sperm and through failure of males to effectively inseminate them.
36C06E4.5C06E4.5n/achrIV 7,255,611contains similarity to Interpro domain IPR011009 (Protein kinase-like)
37F15D4.4F15D4.4n/achrII 13,241,088contains similarity to Pfam domains PF08246 (Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)) , PF00112 (Papain family cysteine protease) contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site), IPR013201 (Proteinase inhibitor I29, cathepsin propeptide), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
38F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
39srg-4T12A2.12n/achrIII 6,261,094C. elegans SRG-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
40K08E4.3K08E4.3n/achrIV 12,058,560contains similarity to Phytolacca americana Mitogen PL-B.; TR:Q9AVB0
41F53B7.4F53B7.4n/achrV 11,001,724contains similarity to Interpro domains IPR004090 (Chemotaxis methyl-accepting receptor), IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich)
42F14B8.2F14B8.2n/achrX 6,904,852
43W06A11.2W06A11.2n/achrII 4,060,321
44srg-9T12A2.10n/achrIII 6,256,061C. elegans SRG-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
45F14H12.7F14H12.7n/achrX 4,362,080
46str-116F07B10.2n/achrV 11,267,629C. elegans STR-116 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
47srd-21W06G6.3n/achrV 16,630,499C. elegans SRD-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
48srb-3C27D6.8n/achrII 5,166,058C. elegans SRB-3 protein; contains similarity to Pfam domains PF02117 (C.elegans Sra family integral membrane protein) , PF02175 (C.elegans integral membrane protein Srb) contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
49str-220C42D4.9n/achrIV 7,170,609str-220 encodes a seven transmembrane chemoreceptor; microarray analyses indicate that str-220 is expressed at higher levels in the AWB olfactory neurons than the AFD thermosensory neurons; anatomical expression studies confirm expression in the AWB neurons; expression of str-220 in AWB is regulated, in part, by the KIN-29 Ser/Thr kinase.
50C44C10.5C44C10.5n/achrX 11,691,705contains similarity to Homo sapiens Structural maintenance of chromosomes protein 1A; ENSEMBL:ENSP00000323421