UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F35E2.9F35E2.90chrI 11,724,844contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3ZK550.5ZK550.5n/achrIV 17,258,404contains similarity to Pfam domain PF05721 Phytanoyl-CoA dioxygenase (PhyH) contains similarity to Interpro domain IPR008775 (Phytanoyl-CoA dioxygenase)
4C14C6.8C14C6.8n/achrV 552,129contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
5cyp-33C4F44C8.1n/achrV 2,237,058C. elegans CYP-33C4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
6F23C8.11F23C8.11n/achrI 2,450,235contains similarity to Interpro domain IPR008880 (Trigger factor, C-terminal, bacterial)
7ptr-16T21H3.2n/achrV 1,172,902ptr-16 encodes a nematode-specific member of the sterol sensing domain (SSD) proteins, distantly paralogous to Drosophila PATCHED (PTC) and human PTCH (OMIM:601309, mutated in basal cell nevus syndrome); PTR-16 is partially required for normal molting from L2 to L3 larval stages; however, PTR-16 and PTR-1 together are strongly required for both molting and viability, with double ptr-1/-16 RNAi animals showing pronounced molting defects and lethality; PTR-16 is also required for normal growth to full size and locomotion.
8fbxb-7Y20C6A.2n/achrV 17,378,293C. elegans FBXB-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF07735 (F-box associated) , PF00646 (F-box domain) contains similarity to Interpro domains IPR001810 (Cyclin-like F-box), IPR012885 (F-box associated type 2)
9sra-37T21H8.2n/achrX 13,892,086C. elegans SRA-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
10Y52B11B.1Y52B11B.1n/achrI 11,123,920contains similarity to Lactococcus lactis FhuD-like protein.; TR:Q8VU74
11F46H5.5F46H5.5n/achrX 7,256,401
12srx-56C03G6.2n/achrV 7,374,979C. elegans SRX-56 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
13srd-26T02B5.4n/achrV 14,162,174C. elegans SRD-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14srd-4ZK863.5n/achrV 12,185,574C. elegans SRD-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
15ncx-8C13D9.7n/achrV 4,985,459ncx-8 encodes a putative Na[+]/Ca[2+] exchanger of uncertain stoichiometry and affinity, orthologous to human SLC24A6 and paralogous to NCX-6/-7 and NCX-9/-10; NCX-8 may function intracellularly; NCX-8 has tandem Calx-alpha domains predicted to carry out ion transport; NCX-8 is required for normally high levels of body fat.
16T09E11.4T09E11.4n/achrI 12,361,669contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
17C04E6.4C04E6.4n/achrV 5,908,497
18col-89F17C8.2n/achrIII 4,748,632C. elegans COL-89 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
19F35C11.2F35C11.2n/achrII 8,245,233contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
20snf-10Y32F6A.2n/achrV 10,439,552snf-10 encodes a member of the sodium:neurotransmitter symporter family.
21C13A2.1C13A2.1n/achrV 7,290,625contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
22T05C12.1T05C12.1n/achrII 8,174,196contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
23C06E1.8C06E1.8n/achrIII 8,596,527contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
24hdl-1ZK829.2n/achrIV 11,947,905C. elegans HDL-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00282 Pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain contains similarity to Interpro domains IPR002129 (Pyridoxal phosphate-dependent decarboxylase), IPR010977 (Aromatic-L-amino-acid decarboxylase), IPR015422 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 2), IPR015424 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region), IPR015421 (Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major region, subdomain 1)
25F40F9.3F40F9.3n/achrV 9,715,769contains similarity to Interpro domain IPR001478 (PDZ/DHR/GLGF)
26C09B9.3C09B9.3n/achrIV 5,025,066contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
27T14G8.4T14G8.4n/achrX 12,862,943contains similarity to Mus musculus Gamma-tubulin complex component GCP5 homolog.; TR:Q8BKN5
28C04G2.10C04G2.10n/achrIV 10,116,708contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
29C32B5.12C32B5.12n/achrII 952,421
30F32D8.3F32D8.3n/achrV 10,887,380F32D8.3 encodes a putative secreted TIL-domain protease inhibitor paralogous to SWM-1, ISL-1, and the products of 11 other C. elegans genes; F32D8.3 and its relatives are collectively similar to other TIL-domain protease inhibitors from nematodes, insects, and vertebrates; F32D8.3 has no obvious function in mass RNAi assays.
31F56H6.1F56H6.1n/achrI 12,281,908contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
32F32D8.4F32D8.4n/achrV 10,892,425F32D8.4 is homologous to Yip1p, an essential Golgi membrane protein in S. cerevisiae that specifically binds the transport GTPases Ypt1p and Ypt31p, as well as Yop1p (the yeast homolog of human ADENOMATOUS POLYPOSIS COLI 1); F32D8.4 is also homologous to the Golgi membrane protein SB140 of H. sapiens, and contains a glutamine/asparagine-rich domain.
33K12B6.8K12B6.8n/achrV 6,310,389contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding)
34col-174F46C8.2n/achrX 7,547,524C. elegans COL-174 protein; contains similarity to Pfam domains PF01484 (Nematode cuticle collagen N-terminal domain) , PF01391 (Collagen triple helix repeat (20 copies)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR002486 (Nematode cuticle collagen, N-terminal), IPR000694 (Proline-rich region), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
35W01B6.6W01B6.6n/achrIV 10,081,890contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
36T28F4.4T28F4.4n/achrI 7,488,371contains similarity to Brugia malayi Putative uncharacterized protein BMBAC01P19.05a.; TR:Q8IHI4
37T22C1.11T22C1.11n/achrI 7,967,828contains similarity to Oryctolagus cuniculus Trichohyalin.; SW:P37709
38ech-5F56B3.5n/achrIV 798,439C. elegans ECH-5 protein; contains similarity to Pfam domain PF00378 Enoyl-CoA hydratase/isomerase family contains similarity to Interpro domain IPR001753 (Crotonase, core)
39pld-1C04G6.3n/achrII 5,087,755C. elegans PLD-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00169 (PH domain) , PF00614 (Phospholipase D Active site motif) (2), PF00787 (PX domain) contains similarity to Interpro domains IPR016555 (Phospholipase D, eukaryota), IPR001683 (Phox-like), IPR001849 (Pleckstrin-like), IPR001736 (Phospholipase D/Transphosphatidylase), IPR015679 (Phospholipase D)
40C09B9.2C09B9.2n/achrIV 5,030,143
41cpr-3T10H4.12n/achrV 15,297,739C. elegans CPR-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00112 Papain family cysteine protease contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
42F59A1.12F59A1.12n/achrV 17,666,234contains similarity to Vibrio parahaemolyticus Putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter.; TR:Q87I14
43F29B9.8F29B9.8n/achrIV 4,648,582
44tag-256ZK637.3n/achrIII 8,892,125C. elegans TAG-256 protein ; contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG7739-PA;; FLYBASE:CG7739
45srz-100T25E12.11n/achrV 16,732,494C. elegans SRZ-100 protein ;
46F45E4.6F45E4.6n/achrIV 7,631,176contains similarity to Interpro domain IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
47lact-2ZK945.1n/achrII 10,096,751lact-2 encodes a beta-lactamase domain-containing protein that contains a predicted transmembrane domain in its N terminus.
48F14H12.8F14H12.8n/achrX 4,363,765
49K12D9.12K12D9.12n/achrV 3,021,212contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
50F21D9.3F21D9.3n/achrV 19,257,632contains similarity to Hepatitis B virus Large S protein (Major surface antigen).; TR:Q8JXA0