UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F35D2.1F35D2.10chrII 7,577,252
2F55A12.8F55A12.8n/achrI 5,351,713contains similarity to Pfam domains PF05127 (Putative ATPase (DUF699)) , PF08351 (Domain of unknown function (DUF1726)) contains similarity to Interpro domains IPR013562 (Region of unknown function DUF1726), IPR007807 (Protein of unknown function DUF699, ATPase putative), IPR016181 (Acyl-CoA N-acyltransferase), IPR013324 (RNA polymerase sigma factor, regions 3 and 4)
3nhr-143F59E11.11n/achrV 8,974,032C. elegans NHR-143 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
4klp-8C15C7.2n/achrX 3,162,174klp-8 encodes an atypical kinesin-like motor protein with the motor domain in the N-terminus; the motor domain of KLP-8 exhibits poor homology to the globular motor domain of the kinesin heavy chain.
5dpy-1M01E10.2n/achrIII 2,041,006dpy-1 encodes a collagen that affects body length and alae formation; site of action localized to the hyp7 syncytium, based on mosaic analysis.
6F54C9.11F54C9.11n/achrII 8,584,206contains similarity to Interpro domain IPR008126 (Outer membrane adhesion, Yersinia)
7Y11D7A.8Y11D7A.8n/achrIV 9,252,608contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
8C25F6.1C25F6.1n/achrX 5,487,263
9T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
10F42G8.7F42G8.7n/achrIV 8,127,262contains similarity to Pfam domain PF00085 Thioredoxin contains similarity to Interpro domains IPR001763 (Rhodanese-like), IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR013766 (Thioredoxin domain)
11ptr-6C54A12.1n/achrII 5,244,628ptr-6 encodes an ortholog of Drosophila and human PTCHD3, which defines one of seven paralogous families of sterol sensing domain (SSD) proteins; PTR-6 is weakly required for normal molting from L4 to adult stages; however, PTR-6 in conjunction with PTR-1 and PTR-10 is strongly required for both molting and viability, with triple ptr-1/-6/-10 RNAi animals showing pronounced molting defects and lethality; PTR-6 is also required for normal growth to full size and locomotion.
12Y45F3A.8Y45F3A.8n/achrIII 10,591,217contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
13dpy-19F22B7.10n/achrIII 8,663,628The dpy-19 gene encodes a novel transmembrane protein whose human homolog is expressed in brain, and that is required for correct polarization and migration of the neuroblasts QL and QR.
14F56D5.6F56D5.6n/achrIV 9,407,298contains similarity to Plasmodium falciparum Putative uncharacterized protein PFD0207c.; TR:Q8I1Y6
15Y57G11C.31Y57G11C.31n/achrIV 14,685,186contains similarity to Pfam domain PF03407 Protein of unknown function (DUF271) contains similarity to Interpro domain IPR005069 (Protein of unknown function DUF271)
16F13D12.8F13D12.8n/achrII 11,731,826contains similarity to White spot syndrome virus WSSV473 (Major virion protein VP19).; TR:Q8QTB2
17C24H10.2C24H10.2n/achrX 5,065,438
18sec-24.2ZC518.2n/achrIV 12,358,176C. elegans SEC-24.2 protein; contains similarity to Pfam domains PF04811 (Sec23/Sec24 trunk domain) , PF04815 (Sec23/Sec24 helical domain) , PF04810 (Sec23/Sec24 zinc finger) , PF00626 (Gelsolin repeat) , PF08033 (Sec23/Sec24 beta-sandwich domain) contains similarity to Interpro domains IPR006900 (Sec23/Sec24 helical region), IPR012990 (Sec23/Sec24 beta-sandwich), IPR000694 (Proline-rich region), IPR006896 (Sec23/Sec24 trunk region), IPR006895 (Zinc finger, Sec23/Sec24-type), IPR007123 (Gelsolin region)
19C38D9.2C38D9.2n/achrV 17,568,988contains similarity to Interpro domain IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)
20F39D8.3F39D8.3n/achrX 15,423,577contains similarity to Homo sapiens Sperm-specific thioredoxin; ENSEMBL:ENSP00000304908
21F13D2.1F13D2.1n/achrX 11,169,479contains similarity to Interpro domain IPR008930 (Terpenoid cylases/protein prenyltransferase alpha-alpha toroid)
22ZK1320.9ZK1320.9n/achrII 9,685,397contains similarity to Pfam domain PF02550 Acetyl-CoA hydrolase/transferase N-terminal domain contains similarity to Interpro domains IPR003702 (Acetyl-CoA hydrolase/transferase), IPR001220 (Legume lectin, beta domain)
23C26D10.4C26D10.4n/achrII 8,331,544contains similarity to Pfam domains PF08544 (GHMP kinases C terminal) , PF00288 (GHMP kinases N terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR006206 (Mevalonate and galactokinase), IPR001174 (Galactokinase/homoserine kinase), IPR006204 (GHMP kinase), IPR014721 (Ribosomal protein S5 domain 2-type fold), IPR013750 (GHMP kinase, C-terminal)
24tag-293C03G6.13n/achrV 7,355,612C. elegans TAG-293 protein; contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
25F41G3.3F41G3.3n/achrII 6,757,638
26nsy-1F59A6.1n/achrII 5,026,357nsy-1 encodes a MAP kinase kinase kinase homolog that affects chemotaxis, egg laying, and pathogen response; NSY-1 activity is activated by the calmodulin kinase UNC-43, and is required for lateral signalling that leads to asymmetric olfactory neuron fates; interacts with SEK-1, and is expressed in the intestine, hypodermis, rectal gland cells, and neurons.
27ugt-61F39G3.1n/achrV 4,743,888C. elegans UGT-61 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
28F55A4.4F55A4.4n/achrX 1,025,409contains similarity to Pfam domain PF00035 Double-stranded RNA binding motif contains similarity to Interpro domains IPR001159 (Double-stranded RNA binding), IPR014720 (Double-stranded RNA-binding-like)
29B0554.2B0554.2n/achrV 435,748contains similarity to Pfam domain PF02795 Domain of unknown function (DUF225) contains similarity to Interpro domain IPR004024 (Protein of unknown function DUF225)
30R173.3R173.3n/achrX 7,033,107contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
31ctg-1H06O01.3n/achrI 7,007,341C. elegans CTG-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF01105 (emp24/gp25L/p24 family/GOLD) , PF00650 (CRAL/TRIO domain) contains similarity to Interpro domains IPR001071 (Cellular retinaldehyde binding/alpha-tocopherol transport), IPR001251 (Cellular retinaldehyde-binding/triple function, C-terminal), IPR009038 (GOLD), IPR011074 (Phosphatidylinositol transfer protein-like, N-terminal), IPR000348 (emp24/gp25L/p24)
32F59F5.1F59F5.1n/achrX 10,530,779contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
33F43C1.1F43C1.1n/achrIII 4,213,606contains similarity to Pfam domains PF00481 (Protein phosphatase 2C) , PF00560 (Leucine Rich Repeat) (11)contains similarity to Interpro domains IPR001932 (Protein phosphatase 2C-related), IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR000694 (Proline-rich region), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype), IPR014045 (Protein phosphatase 2C, N-terminal)
34F13B6.1F13B6.1n/achrIV 7,457,398
35pxn-2K09C8.5n/achrX 10,975,651C. elegans PXN-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00047 (Immunoglobulin domain) (2), PF00560 (Leucine Rich Repeat) (3), PF01462 (Leucine rich repeat N-terminal domain) , PF07679 (Immunoglobulin I-set domain) (2), PF03098 (Animal haem peroxidase) contains similarity to Interpro domains IPR003598 (Immunoglobulin subtype 2), IPR000483 (Cysteine-rich flanking region, C-terminal), IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR013098 (Immunoglobulin I-set), IPR010255 (Haem peroxidase), IPR003596 (Immunoglobulin V-set, subgroup), IPR013783 (Immunoglobulin-like fold), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR002007 (Haem peroxidase, animal), IPR000372 (Leucine-rich repeat, cysteine-rich flanking region, N-terminal), IPR003599 (Immunoglobulin subtype), IPR013151 (Immunoglobulin)
36str-48C34D4.8n/achrIV 7,123,053C. elegans STR-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
37C27C12.4C27C12.4n/achrX 14,855,245contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF05978 (Eukaryotic protein of unknown function (DUF895)) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
38T10D4.1T10D4.1n/achrII 3,151,352contains similarity to Pfam domains PF01579 (Domain of unknown function DUF19) , PF02343 (Domain of unknown function DUF130) contains similarity to Interpro domains IPR003326 (Protein of unknown function DUF130), IPR002542 (Protein of unknown function DUF19)
39gon-1F25H8.3n/achrIV 9,940,393gon-1 encodes a functional metalloprotease that defines a new sub-family of secreted proteases known as MPT (metalloprotease with thrombospondin type 1 repeats); the other two members of this family are the bovine procollagen I N-protease ( PINP ) and the murine enzyme ADAMTS-1; gon-1 is essential for hermaphrodite gonadal morphogenesis; sequence homology with other metalloproteases suggests that it functions by remodelling the extracellular matrix; GON-1 is expressed at high levels within the gonadal distal tip cell during migration.
40D1014.7D1014.7n/achrV 8,119,293contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
41srh-268C54F6.1n/achrV 7,540,084C. elegans SRH-268 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
42mab-10R166.1n/achrII 10,532,058C. elegans MAB-10 protein; contains similarity to Pfam domains PF04905 (NAB conserved region 2 (NCD2)) , PF04904 (NAB conserved region 1 (NCD1)) contains similarity to Interpro domains IPR010993 (Sterile alpha motif homology), IPR006988 (Nab, N-terminal), IPR006989 (Nab, central region)
43srbc-75M01B2.3n/achrV 15,254,293C. elegans SRBC-75 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
44C34C12.6C34C12.6n/achrIII 3,483,701contains similarity to Pfam domains PF01105 (emp24/gp25L/p24 family/GOLD) , PF00650 (CRAL/TRIO domain) contains similarity to Interpro domains IPR001251 (Cellular retinaldehyde-binding/triple function, C-terminal), IPR009038 (GOLD), IPR011074 (Phosphatidylinositol transfer protein-like, N-terminal), IPR000348 (emp24/gp25L/p24)
45T05B11.1T05B11.1n/achrV 7,750,009This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
46sulp-3F41D9.5n/achrX 8,405,893sulp-3 encodes one of eight C. elegans members of the sulfate permease family of anion transporters; by homology, SULP-3 is predicted to function as an anion transporter that regulates cellular pH and volume via transmembrane movement of electrolytes and fluids; a sulp-3::GFP transcriptional fusion is expressed exclusively in the pharyngeal muscles.
47gpr-2C38C10.4n/achrIII 9,392,118gpr-2 encodes a protein containing a GPR (G Protein Regulator)/GoLoco motif characteristic of guanine nucleotide exchange factors specific for G-alpha GTPases; GPR-2 appears to function redundantly during early embryogenesis and germ-line development to regulate chromosome and spindle movements during cell division; GPR-2 likely acts as a positive regulator of G protein signaling and specifically, may regulate GOA-1 signaling in the embryo; GPR-2 forms a protein complex with the nearly identical GPR-1 and with LIN-5, a coiled-coil protein that is required for proper localization of GPR-2 to the cell cortex and spindle asters of the early embryo; in addition, proper GPR-2/GPR-1/LIN-5 localization between the P2 and EMS blastomeres at the four-cell stage, which may contribute to spindle positioning in EMS, requires the MES-1/SRC-1 tyrosine kinase signaling pathway; GPR-2 is believed to act downstream of, or in parallel to, PAR-3, a PDZ domain-containing protein, in mitotic spindle positioning in the early embryo.
48sri-48ZC239.9n/achrII 3,200,257C. elegans SRI-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49T19C3.4T19C3.4n/achrIII 619,226contains similarity to Pfam domain PF03134 TB2/DP1, HVA22 family contains similarity to Interpro domain IPR004345 (TB2/DP1 and HVA22 related protein)
50T19B10.3T19B10.3n/achrV 11,224,368The T19B10.3 gene encodes an ortholog of the human gene GALACTOSIDASE, BETA 1 (GLB1), which when mutated leads to gangliosidosis type I (OMIM:230500).