UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1clec-138F35D11.94e-127chrII 4,619,352C. elegans CLEC-138 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
2srg-68ZC317.5n/achrV 5,464,597C. elegans SRG-68 protein ;
3R09A8.5R09A8.5n/achrX 12,639,412contains similarity to Varroa destructor NADH dehydrogenase subunit 4L.; TR:Q8HCK4
4T24F1.4T24F1.4n/achrII 11,313,796contains similarity to Danio rerio Delta-like protein A precursor (DeltaA protein).; SW:Q6DI48
5srr-6C13D9.1n/achrV 5,014,011C. elegans SRR-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF03268 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF267 contains similarity to Interpro domain IPR004950 (Protein of unknown function DUF267, Caenorhabditis species)
6mps-3T06A4.2n/achrI 761,378mps-3 encodes a single-pass transmembrane protein that is related to the vertebrate KCNE proteins, also known as MinK-related peptides (MiRPs) that associate with, and regulate, pore-forming ion channels; mps-1 is required for the normal function of several neurons and thus for normal body touch sensation, chemotaxis to select molecules, osmotic avoidance, and nose-touch; when coexpressed in tissue culture cells with C. elegans KVS-1, MPS-3 is able to alter the activity of this potassium-selective channel, suggesting that MPS-3 functions in vivo to regulate KVS-1 activity in neurons in which the two proteins are coexpressed; in addition, activity of MPS-2, MPS-3, and KVS-1 coexpressed in culture suggests that these three proteins can form a functional ternary complex that genetic analyses indicate likely plays a role in regulating responsiveness to sodium; MPS-3 reporter fusions are expressed in the ADF amphid sensory neuron, the PVC and PVN neurons, and two neurons in the anterior bulb of the pharynx.
7pad-1Y18D10A.13n/achrI 12,890,677The pad-1 gene encodes a highly conserved, but unfamiliar, protein that is required for embryonic development.
8F36H2.3F36H2.3n/achrI 9,258,077contains similarity to Pfam domain PF00084 Sushi domain (SCR repeat) contains similarity to Interpro domains IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR016060 (Complement control module)
9W03A5.2W03A5.2n/achrIII 5,407,000W03A5.2 is orthologous to the human gene UNKNOWN (PROTEIN FOR MGC:19580) (GGCX; OMIM:137167), which when mutated leads to disease.
10F14H3.2F14H3.2n/achrV 16,050,616contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
11clec-256Y17D7B.6n/achrV 18,772,129C. elegans CLEC-256 protein; contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
12K03B4.6K03B4.6n/achrV 4,673,573contains similarity to Pfam domain PF03236 Domain of unknown function DUF263 contains similarity to Interpro domains IPR004920 (Protein of unknown function DUF263), IPR000366 (Fungal pheromone mating factor STE2 GPCR)
13str-90F58G4.2n/achrV 8,105,065C. elegans STR-90 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14R05A10.7R05A10.7n/achrIV 14,161,499contains similarity to Pfam domain PF07801 Protein of unknown function (DUF1647) contains similarity to Interpro domain IPR012444 (Protein of unknown function DUF1647)
15W05B10.3W05B10.3n/achrV 12,661,622contains similarity to Melanoplus sanguinipes entomopoxvirus ORF MSV209 putative vaccinia A21L homolog, similar to SW:P20996.; TR:Q9YVN3
16nhr-183F41B5.10n/achrV 2,263,548C. elegans NHR-183 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
17scrt-1C55C2.1n/achrI 2,569,754C. elegans SCRT-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
18F48B9.2F48B9.2n/achrX 2,173,341
19F35B3.1F35B3.1n/achrX 17,016,472contains similarity to Interpro domain IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
20fbxa-110Y102A5C.8n/achrV 16,937,848This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
21sru-27C38C3.2n/achrV 1,500,054C. elegans SRU-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF02688 Domain of unknown function DUF215 contains similarity to Interpro domain IPR003839 (Protein of unknown function DUF215)
22R03G8.3R03G8.3n/achrX 13,092,699contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domain IPR004245 (Protein of unknown function DUF229)
23F35C8.2F35C8.2n/achrX 5,375,578contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
24W03G1.5W03G1.5n/achrIV 505,834contains similarity to Interpro domains IPR002952 (Eggshell protein), IPR000694 (Proline-rich region), IPR002964 (Adhesive plaque protein)
25T14G8.4T14G8.4n/achrX 12,862,943contains similarity to Mus musculus Gamma-tubulin complex component GCP5 homolog.; TR:Q8BKN5
26C03B1.4C03B1.4n/achrX 6,365,064
27F57A8.6F57A8.6n/achrV 10,072,890contains similarity to Pfam domain PF01666 DX module contains similarity to Interpro domain IPR002593 (Protein of unknown function DX)
28sre-42Y57A10B.4n/achrII 12,385,670C. elegans SRE-42 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor), IPR001356 (Homeobox)
29T02E9.3T02E9.3n/achrV 11,364,314T02E9.3 encodes a homolog of human melatonin type 1b receptors, and more generally of mammalian dopamine and serotonin (5-HT) receptors; T02E9.3 is partly required for male tail curling, with T02E9.3(RNAi) animals showing reduced curling in exogenous 5-HT; T02E9.3 is required for full sensitivity to 5-HT, normal brood sizes, and pharyngeal pumping; T02E9.3 is expressed in head and tail neurons.
30C30F12.5C30F12.5n/achrI 6,995,898contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
31elo-7F56H11.3n/achrIV 9,530,584The elo-7 gene encodes a paralog of elo-1 and elo-2, each of which encodes a polyunsaturated fatty acid (PUFA) elongase; ELO-7 has no known function in vivo.
32R12H7.4R12H7.4n/achrX 13,217,956contains similarity to Homo sapiens similar to zinc-finger helicase; ENSEMBL:ENSP00000304137
33str-261W09D6.2n/achrIII 11,075,857C. elegans STR-261 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR011256 (Regulatory factor, effector, bacterial), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
34F15D3.4F15D3.4n/achrI 11,568,010contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
35F18A11.5F18A11.5n/achrII 13,010,794contains similarity to Pfam domains PF02214 (K+ channel tetramerisation domain) , PF03931 (Skp1 family, tetramerisation domain) contains similarity to Interpro domains IPR001232 (SKP1 component), IPR016072 (SKP1 component, dimerisation), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation), IPR016073 (SKP1 component, POZ)
36fbxa-141D1025.3n/achrX 14,512,622This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
37T10E9.3T10E9.3n/achrI 6,536,631contains similarity to Pfam domain PF03351 DOMON domain contains similarity to Interpro domains IPR005018 (DOMON related), IPR013050 (DOMON)
38T24E12.10T24E12.10n/achrII 3,770,931contains similarity to Magnetococcus sp MJ0042 family finger-like protein.; TR:A0LDP7
39F41H10.2F41H10.2n/achrIV 5,381,978
40F41C6.7F41C6.7n/achrX 6,883,839contains similarity to Pfam domain PF01545 Cation efflux family contains similarity to Interpro domain IPR002524 (Cation efflux protein)
41F16B12.1F16B12.1n/achrX 14,087,466contains similarity to Pfam domain PF00431 CUB domain contains similarity to Interpro domain IPR000859 (CUB)
42F13A7.7F13A7.7n/achrV 16,382,944contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Nucleolar protein that binds nuclear localization sequences, required for pre-rRNA processing and ribosome biogenesis; SGD:YGR159C
43F19B2.7F19B2.7n/achrV 20,150,407contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
44srz-12K08G2.7n/achrV 15,862,049C. elegans SRZ-12 protein ;
45fkh-3C29F7.4n/achrX 13,422,576fkh-3 encodes one of 15 C. elegans forkhead transcription factors; loss of fkh-3 activity via RNAi, either singly or in combination with the closely related fkh-4 and fkh-5 genes, results in no obvious abnormalities, suggesting functional redundancy with other genes; an FKH-3 reporter fusion is expressed in most, but not all, cells of the early embryo from the 20- to the 200-cell stage.
46F54C8.6F54C8.6n/achrIII 9,445,388contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IAL7
47ift-74C18H9.8n/achrII 6,681,205C. elegans IFT-74 protein; contains similarity to Interpro domains IPR010989 (t-SNARE), IPR000694 (Proline-rich region)
48snf-10Y32F6A.2n/achrV 10,439,552snf-10 encodes a member of the sodium:neurotransmitter symporter family.
49Y41C4A.8Y41C4A.8n/achrIII 11,707,793contains similarity to Aedes aegypti Hypothetical conserved protein (Putative uncharacterized protein).; TR:Q1HQM0
50C30E1.6C30E1.6n/achrX 16,916,238