UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F35C5.4F35C5.43e-39chrII 12,891,236contains similarity to Homo sapiens Mucin-2 precursor; ENSEMBL:ENSP00000351956
2cwp-2C37H5.11n/achrV 4,842,261cwp-2 encodes a nematode-specific protein that is coexpressed with lov-1 and pkd-2.
3sri-37D2062.2n/achrII 2,630,401C. elegans SRI-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4clec-158R13F6.8n/achrIII 6,859,120C. elegans CLEC-158 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
5srj-8T28A11.9n/achrV 3,248,476C. elegans SRJ-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6F28A10.4F28A10.4n/achrII 844,685contains similarity to Interpro domain IPR009061 (Putative DNA binding)
7R02F2.6R02F2.6n/achrIII 5,478,761
8T09A12.1T09A12.1n/achrIV 8,245,495contains similarity to Xenopus laevis DNA topoisomerase 1 (EC 5.99.1.2) (DNA topoisomerase I).; SW:P41512
9F32B6.4F32B6.4n/achrIV 9,891,311contains similarity to Dictyostelium discoideum Similar to Mus musculus (Mouse). 13 days embryo male testis cDNA,sRIKEN full-length enriched library, clone:6030407P11 product:NIMAs(Never in mitosis gene a)-related expressed kinase 1, full insertssequence.; TR:Q86I06
10W01B6.8W01B6.8n/achrIV 10,083,904contains similarity to Xenopus laevis Nuclear/mitotic apparatus protein.; TR:P70012
11clec-124C17F4.1n/achrII 3,250,580C. elegans CLEC-124 protein; contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
12F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
13nas-24F20G2.4n/achrV 13,770,454nas-24 encodes an astacin-like metalloprotease.
14clec-110F17B5.5n/achrI 13,204,938C. elegans CLEC-110 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
15W02B3.5W02B3.5n/achrIII 686,655contains similarity to Pfam domain PF06828 Fukutin-related contains similarity to Interpro domain IPR009644 (Fukutin-related)
16T15H9.5T15H9.5n/achrII 9,610,953contains similarity to Dictyostelium discoideum Putative uncharacterized protein.; TR:Q55FI4
17srw-141H27D07.2n/achrV 2,937,953C. elegans SRW-141 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
18F36A4.1F36A4.1n/achrIV 4,272,674contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
19D1037.5D1037.5n/achrI 3,692,099contains similarity to Pfam domains PF01734 (Patatin-like phospholipase) , PF00023 (Ankyrin repeat) (2)contains similarity to Interpro domains IPR016035 (Acyl transferase/acyl hydrolase/lysophospholipase), IPR002641 (Patatin), IPR002110 (Ankyrin)
20T05A6.4T05A6.4n/achrII 7,821,360contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
21srt-48Y41E3.15n/achrIV 15,067,356C. elegans SRT-48 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
22F41D3.7F41D3.7n/achrI 12,267,272contains similarity to Autographa californica nuclear polyhedrosis virus ORF 5 (Fragment).; TR:O71053
23Y62H9A.8Y62H9A.8n/achrX 11,891,763contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IEC0
24B0524.4B0524.4n/achrIII 1,884,901contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
25ferl-1T05E8.1n/achrI 5,457,629C. elegans FERL-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF00168 (C2 domain) , PF08165 (FerA (NUC095) domain) , PF08150 (FerB (NUC096) domain) contains similarity to Interpro domains IPR012561 (FerB), IPR006614 (Dysferlin, C-terminal), IPR008973 (C2 calcium/lipid-binding region, CaLB), IPR012560 (FerA), IPR006613 (Dysferlin, N-terminal), IPR000008 (C2 calcium-dependent membrane targeting)
26T05C12.9T05C12.9n/achrII 8,192,426contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF02149 (Kinase associated domain 1) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR001772 (Kinase-associated KA1), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR015940 (Ubiquitin-associated/translation elongation factor EF1B, N-terminal, eukaryote)
27ZK354.9ZK354.9n/achrIV 5,307,602contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
28clec-99ZK39.8n/achrI 11,157,780C. elegans CLEC-99 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
29C32B5.15C32B5.15n/achrII 971,803This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
30E02H9.9E02H9.9n/achrIII 2,467,742
31W03D8.2W03D8.2n/achrI 2,799,577contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
32fbxa-99F36G9.14n/achrV 15,982,244This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
33str-162E03H12.1n/achrIV 4,993,123C. elegans STR-162 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
34Y54E5A.3Y54E5A.3n/achrI 14,698,399contains similarity to Escherichia coli Orf732.; TR:Q46767
35W07G4.2W07G4.2n/achrV 13,035,710contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
36R107.2R107.2n/achrIII 9,044,850contains similarity to Pfam domain PF01256 Carbohydrate kinase contains similarity to Interpro domain IPR000631 (Carbohydrate kinase)
37srh-166Y38H6C.12n/achrV 20,520,671C. elegans SRH-166 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38tag-272C34B2.1n/achrI 10,689,540C. elegans TAG-272 protein ;
39C14E2.4C14E2.4n/achrX 1,819,435contains similarity to Pfam domain PF03171 2OG-Fe(II) oxygenase superfamily contains similarity to Interpro domains IPR006620 (Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit), IPR005123 (2OG-Fe(II) oxygenase)
40aqp-3Y69E1A.7n/achrIV 10,962,555aqp-3 encodes an aquaglyceroporin whose expression in Xenopus oocytes increases water or glycerol permeability five- to seven-fold; loss of AQP-3 activity via mutation or RNAi results in no obvious defects; however, AQP-3, in conjunction with AQP-2, AQP-4, and AQP-8, is weakly required for recovery from hypotonic stress; AQP-3 is expressed in the intestine, excretory cell, seminal vesicle, and vas deferens.
41exp-1H35N03.1n/achrII 6,159,051exp-1 encodes an excitatory, cation-selective GABA receptor; EXP-1 activity is essential for the enteric muscle contractions that are the third in a series of three independent muscle contractions controlling defecation, and when expressed in Xenopus oocytes, EXP-1 is capable of forming a cation-selective GABA receptor; a rescuing EXP-1::GFP reporter fusion is expressed in the intestinal and anal depressor muscles, where it localizes to regions consistent with the positions of neuromuscular junctions; expression is also observed in neurons, including PDA, RID, ADE, and SABD.
42ZK697.3ZK697.3n/achrV 1,729,883contains similarity to Interpro domain IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
43cyp-29A4B0331.1n/achrV 9,656,299C. elegans CYP-29A4 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR002397 (Cytochrome P450, B-class), IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
44C05B5.1C05B5.1n/achrIII 9,987,900contains similarity to Clostridium acetobutylicum Membrane associated chemotaxis sensory transducer protein (MSPsdomain and HAMP domain).; TR:Q97JD4
45C50H2.7C50H2.7n/achrV 9,923,573contains similarity to Interpro domain IPR011009 (Protein kinase-like)
46F47C12.6F47C12.6n/achrIV 3,991,939contains similarity to Pfam domain PF05912 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF870) contains similarity to Interpro domain IPR008588 (Protein of unknown function DUF870, Caenorhabditis species)
47T10D4.7T10D4.7n/achrII 3,118,051contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
48F25H5.2F25H5.2n/achrI 9,180,480
49M28.9M28.9n/achrII 10,641,581contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; VG:OTTHUMP00000024599
50srz-10ZK1037.11n/achrV 15,308,296C. elegans SRZ-10 protein ;