UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F34D6.2F34D6.25e-92chrII 2,683,818contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR000047 (Helix-turn-helix motif, lambda-like repressor), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
2ZK669.2ZK669.2n/achrII 7,937,580contains similarity to Pfam domain PF03227 Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase (GILT) contains similarity to Interpro domain IPR004911 (Gamma interferon inducible lysosomal thiol reductase GILT)
3C17B7.7C17B7.7n/achrV 3,326,895contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domain IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258)
4srj-9T20C4.1n/achrV 3,432,956C. elegans SRJ-9 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
5fbxa-160C08E3.12n/achrII 1,624,293C. elegans FBXA-160 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
6F08C6.5F08C6.5n/achrX 7,560,915contains similarity to Interpro domain IPR003016 (2-oxo acid dehydrogenase, lipoyl-binding site)
7mel-26ZK858.4n/achrI 9,134,137mel-26 encodes a MATH and BTB/POZ domain-containing protein that functions as a novel substrate-specific adaptor of the CUL-3-containing E3 ubiquitin ligase; MEL-26 is required maternally for formation of mitotic spindles in the early embryo, and as a component of a ubiquitin ligase complex, for degradation of the microtubule-severing protein MEI-1 at the meiosis to mitosis transition; MEL-26 is also required maternally for embryonic morphogenesis; since MEL-26 contains a meprin-associated Traf homology (MATH) domain, it might be involved in apoptosis.
8scl-18T12A7.3n/achrIV 11,754,015C. elegans SCL-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related), IPR002052 (N-6 adenine-specific DNA methylase, conserved site)
9F15E6.5F15E6.5n/achrIV 4,289,807contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
10M01G5.3M01G5.3n/achrIII 1,513,690contains similarity to Pfam domain PF07851 TMPIT-like protein contains similarity to Interpro domain IPR012926 (TMPIT-like)
11R119.5R119.5n/achrI 391,462contains similarity to Pfam domain PF01135 Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase (PCMT) contains similarity to Interpro domain IPR000682 (Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase)
12nhr-60F57A10.5n/achrV 15,771,767C. elegans NHR-60 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
13nhr-118F13A2.8n/achrV 4,408,904C. elegans NHR-118 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core), IPR000003 ()
14srx-122F35F10.8n/achrV 3,296,984C. elegans SRX-122 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
15C04G6.4C04G6.4n/achrII 5,082,452contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
16C01G5.7C01G5.7n/achrIV 6,518,588
17T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
18C34D4.1C34D4.1n/achrIV 7,158,487contains similarity to Interpro domain IPR000956 (Stathmin)
19K04H8.2K04H8.2n/achrI 14,254,220contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domains IPR006583 (CW), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
20C18H7.1C18H7.1n/achrIV 618,237contains similarity to Pfam domain PF00092 von Willebrand factor type A domain contains similarity to Interpro domain IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
21ncx-6C07A9.4n/achrIII 9,712,021ncx-6 encodes a putative Na[+]/Ca[2+] exchanger of uncertain stoichiometry and affinity, orthologous to human SLC24A6 and paralogous to NCX-7/-10; NCX-6 may function intracellularly; NCX-6 has tandem Calx-alpha domains predicted to carry out ion transport; NCX-6 has no obvious function in mass RNAi assays.
22Y63D3A.4Y63D3A.4n/achrI 14,099,306contains similarity to Pfam domain PF03372 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family contains similarity to Interpro domains IPR005637 (TAP, C-terminal), IPR009060 (UBA-like), IPR005135 (Endonuclease/exonuclease/phosphatase)
23ZK218.1ZK218.1n/achrV 17,092,954contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
24C32A9.1C32A9.1n/achrX 10,259,366contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein, conserved.; TR:Q8IEA2
25C46H11.3C46H11.3n/achrI 5,041,773contains similarity to Pfam domain PF04699 ARP2/3 complex 16 kDa subunit (p16-Arc) contains similarity to Interpro domains IPR006789 (ARP2/3 complex 16 kDa subunit (p16-Arc)), IPR002052 (N-6 adenine-specific DNA methylase, conserved site)
26clec-121Y25C1A.4n/achrII 3,103,522C. elegans CLEC-121 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
27Y51H1A.7Y51H1A.7n/achrII 13,897,024contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR000783 (RNA polymerase, subunit H/Rpb5 C-terminal)
28srz-74K03D3.1n/achrIV 16,330,219C. elegans SRZ-74 protein ;
29str-205C02E7.9n/achrV 4,929,096C. elegans STR-205 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
30K06H6.4K06H6.4n/achrV 580,280contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
31R05A10.5R05A10.5n/achrIV 14,169,839contains similarity to Interpro domain IPR000884 (Thrombospondin, type I)
32K10B4.4K10B4.4n/achrII 124,170contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR005390 (Neuromedin U receptor), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
33srj-55Y45G12A.1n/achrV 2,857,011C. elegans SRJ-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
34Y39F10A.2Y39F10A.2n/achrII 780,543contains similarity to Pfam domain PF06079 Apyrase contains similarity to Interpro domain IPR009283 (Apyrase)
35clec-165F38A1.10n/achrIV 1,246,135C. elegans CLEC-165 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001680 (WD40 repeat), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
36ZK512.2ZK512.2n/achrIII 9,143,217contains similarity to Pfam domains PF00270 (DEAD/DEAH box helicase) , PF00271 (Helicase conserved C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR011545 (DNA/RNA helicase, DEAD/DEAH box type, N-terminal), IPR000629 (RNA helicase, ATP-dependent, DEAD-box, conserved site), IPR014021 (Helicase, superfamily 1 and 2, ATP-binding), IPR014001 (DEAD-like helicase, N-terminal), IPR001650 (DNA/RNA helicase, C-terminal)
37T10E9.8T10E9.8n/achrI 6,540,502
38F43B10.1F43B10.1n/achrX 16,662,035
39srt-7C50H11.4n/achrV 3,082,398C. elegans SRT-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000408 (Regulator of chromosome condensation, RCC1)
40K05G3.2K05G3.2n/achrX 16,497,319
41Y43F8B.13Y43F8B.13n/achrV 19,459,852contains similarity to Puumala virus Nucleocapsid protein (Fragment).; TR:Q8B3A4
42Y7A5A.7Y7A5A.7n/achrX 15,802,663contains similarity to Murine herpesvirus 72 Membrane virion glycoprotein 150.; TR:Q9DYE3
43srw-96K04F1.2n/achrV 1,674,580C. elegans SRW-96 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR006069 (ATPase, P-type cation exchange, alpha subunit)
44D2023.6D2023.6n/achrV 11,828,318D2023.6 is orthologous to a set of uncharacterized putative protein kinases from eukaryotes and from prokaryotes (e.g., UbiB from E. coli), and paralogous to COQ-8 from C. elegans and ABC1 (COQ8) from S. cerevisiae; like COQ-8, D2023.6 may be involved in ubiquinone (coenzyme Q9) biosynthesis.
45Y48E1B.7Y48E1B.7n/achrII 13,580,236Y48E1B.7 encodes a C2H2-type zinc-finger protein required for embryonic development and fertility; Y48E1B.7 transcript levels are diminished by ERI-1, RDE-3, and RRF-2, perhaps through endogenous RNAi; Y48E1B.7 is paralogous to MCD-1, but has no obvious non-nematode orthologs; Y48E1B.7 contains a single central zinc-finger and a C-terminal low-complexity region, but no other recognizable protein domains.
46srb-18C54F6.7n/achrV 7,516,266C. elegans SRB-18 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR002184 (Serpentine beta receptor), IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
47C07A4.3C07A4.3n/achrX 10,175,118contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
48his-68T23D8.6n/achrI 9,989,347his-68 encodes an H2A histone.
49EEED8.6EEED8.6n/achrII 5,385,733EEED8.6 encodes an ATP/ADP-activated metallocarboxypeptidase, orthologous to mammalian AGBL4 proteins, that may function in vivo as an alpha-tubulin C-terminal tyrosine carboxypeptidase; recombinant EEED8.6 is active in vitro on several different C-terminal amino acids of synthetic peptide substrates (with carboxypeptidase A- and B-like, but not O-like specificity); unlike most carboxypeptidases, but like tubulin carboxypeptidase, EEED8.6 is inhibited by high salt or by Z-Glu-Tyr dipeptide; EEED8.6 and its mammalian AGBL4 orthologs, along with other proteins such as mammalian AGBL5, comprise a M14D2 peptidase subfamily; by homolog-based structural modelling, EEED8.6 is predicted to have an unusually open active site.
50nas-8C34D4.9n/achrIV 7,117,415nas-8 encodes an astacin-like metalloprotease.