UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F34D10.2F34D10.20chrIII 3,732,549contains similarity to Pfam domain PF02724 CDC45-like protein contains similarity to Interpro domain IPR003874 (CDC45-like protein)
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3ugt-32F47C10.6n/achrV 3,842,918C. elegans UGT-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
4K06A1.3K06A1.3n/achrII 6,442,625contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
5R06A10.1R06A10.1n/achrI 1,087,211contains similarity to Interpro domain IPR016196 (MFS general substrate transporter)
6rsr-1F28D9.1n/achrI 11,179,945C. elegans RSR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01480 PWI domain contains similarity to Interpro domains IPR002483 (Splicing factor PWI), IPR000694 (Proline-rich region), IPR005819 (Histone H5), IPR002185 (Dopamine D4 receptor)
7skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
8F45E1.3F45E1.3n/achrX 7,987,677contains similarity to Pfam domain PF00702 haloacid dehalogenase-like hydrolase contains similarity to Interpro domain IPR005834 (Haloacid dehalogenase-like hydrolase)
9W02D9.2W02D9.2n/achrI 12,533,503contains similarity to Pfam domain PF04893 Yip1 domain contains similarity to Interpro domain IPR006977 (Yip1 domain)
10F35A5.5F35A5.5n/achrX 3,794,638contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
11C10G8.2C10G8.2n/achrV 5,314,980contains similarity to Pfam domain PF00014 Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain contains similarity to Interpro domain IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa)
12H41C03.1H41C03.1n/achrII 5,855,713contains similarity to Pfam domains PF01105 (emp24/gp25L/p24 family/GOLD) , PF00650 (CRAL/TRIO domain) contains similarity to Interpro domains IPR001251 (Cellular retinaldehyde-binding/triple function, C-terminal), IPR011074 (Phosphatidylinositol transfer protein-like, N-terminal), IPR000348 (emp24/gp25L/p24)
13nhr-211T01G6.5n/achrV 488,034C. elegans NHR-211 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
14C33F10.1C33F10.1n/achrII 4,835,359
15ctl-1Y54G11A.6n/achrII 14,304,828ctl-1 encodes one of three C. elegans catalases; CTL-1 exhibits catalase activity in vitro, and thus likely functions in vivo as an antioxidant enzyme that protects cells from reactive oxygen species; ctl-1 activity contributes to the extended lifespan seen in daf-2 mutant animals; in addition, ctl-1 expression is negatively regulated by DAF-2-mediated insulin signaling; as CTL-1 does not possess a C-terminal peroxisomal targeting signal (PTS), it is predicted to be a cytosolic catalase.
16tag-196F41E6.6n/achrV 8,596,111C. elegans TAG-196 protein; contains similarity to Pfam domains PF08246 (Cathepsin propeptide inhibitor domain (I29)) , PF00112 (Papain family cysteine protease) , PF00031 (Cystatin domain) contains similarity to Interpro domains IPR013128 (Peptidase C1A, papain), IPR000010 (Proteinase inhibitor I25, cystatin), IPR000169 (Peptidase, cysteine peptidase active site), IPR013201 (Proteinase inhibitor I29, cathepsin propeptide), IPR000668 (Peptidase C1A, papain C-terminal)
17F49E11.2F49E11.2n/achrIV 13,037,470contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
18F38B6.2F38B6.2n/achrX 6,699,255contains similarity to Interpro domain IPR006150 (Cysteine-rich repeat)
19F23C8.11F23C8.11n/achrI 2,450,235contains similarity to Interpro domain IPR008880 (Trigger factor, C-terminal, bacterial)
20srw-107R11G11.13n/achrV 520,735C. elegans SRW-107 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
21Y43F8C.5Y43F8C.5n/achrV 19,631,978contains similarity to Dictyostelium discoideum Myb-like protein (Fragment).; SW:MYBH_DICDI
22C10C6.3C10C6.3n/achrIV 11,464,370contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Putative glycosidase of the cell wall, may have a role in cell wall architecture; SGD:YGR189C
23lips-4K12B6.3n/achrV 6,279,558C. elegans LIPS-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01674 Lipase (class 2) contains similarity to Interpro domain IPR002918 (Lipase, class 2)
24F28F9.2F28F9.2n/achrIV 3,840,668
25T21B4.3T21B4.3n/achrII 12,495,897contains similarity to Pfam domain PF01681 C6 domain contains similarity to Interpro domain IPR002601 (Protein of unknown function C6)
26srv-32T13A10.12n/achrIV 6,281,179C. elegans SRV-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000366 (Fungal pheromone mating factor STE2 GPCR)
27srg-31T07H8.5n/achrV 6,952,348C. elegans SRG-31 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like), IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
28ZK1010.6ZK1010.6n/achrIII 12,989,808contains similarity to Pfam domain PF01666 DX module contains similarity to Interpro domain IPR002593 (Protein of unknown function DX)
29R01B10.3R01B10.3n/achrV 6,044,828
30nhr-130T01G6.8n/achrV 482,090C. elegans NHR-130 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
31srsx-18C04E6.2n/achrV 5,923,404C. elegans SRSX-18 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
32F26E4.2F26E4.2n/achrI 9,759,327contains similarity to Pasteurella haemolytica HSDR.; TR:P95512
33sri-1F36G9.8n/achrV 15,966,916C. elegans SRI-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR002208 (SecY protein)
34C31H5.1C31H5.1n/achrI 9,028,536contains similarity to Pfam domain PF06342 Alpha/beta hydrolase of unknown function (DUF1057) contains similarity to Interpro domains IPR008262 (Lipase, active site), IPR010463 (Protein of unknown function DUF1057, lipase putative)
35F46H5.5F46H5.5n/achrX 7,256,401
36duo-2F29C4.5n/achrIV 113,683C. elegans DUO-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF00443 (Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase) , PF02338 (OTU-like cysteine protease) contains similarity to Interpro domains IPR003323 (Ovarian tumour, otubain), IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2)
37W04E12.7W04E12.7n/achrV 19,731,742contains similarity to Pfam domain PF06162 Caenorhabditis elegans protein of unknown function (DUF976) contains similarity to Interpro domains IPR010381 (Protein of unknown function DUF976, Caenorhabditis species), IPR016125 (Peptidase C15, pyroglutamyl peptidase I-like)
38C34C6.3C34C6.3n/achrII 8,692,922contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) , PF07974 (EGF-like domain) contains similarity to Interpro domains IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR000585 (Hemopexin), IPR006209 (EGF-like), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR005018 (DOMON related), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR013111 (EGF, extracellular)
39T26G10.4T26G10.4n/achrIII 9,420,953contains similarity to Forficula auricularia Reverse transcriptase (Fragment).; TR:O44323
40C02F4.4C02F4.4n/achrIV 10,514,479contains similarity to Listeria monocytogenes Hypothetical protein lmo1466.; TR:Q8Y746
41F47C12.1F47C12.1n/achrIV 4,001,937contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (4), PF00754 (F5/8 type C domain) , PF07645 (Calcium binding EGF domain) (2), PF07699 (GCC2 and GCC3) (3), PF00431 (CUB domain) , PF07974 (EGF-like domain) , PF02494 (HYR domain) (2), PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) (6)contains similarity to Interpro domains IPR001438 (EGF-like, type 2), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR003410 (Hyalin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR008979 (Galactose-binding like), IPR000859 (CUB), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR016060 (Complement control module), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR000421 (Coagulation factor 5/8 type, C-terminal), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013091 (EGF calcium-binding)
42srt-72C36C5.9n/achrV 3,148,851C. elegans SRT-72 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
43F59A1.12F59A1.12n/achrV 17,666,234contains similarity to Vibrio parahaemolyticus Putative ATP-binding/permease fusion ABC transporter.; TR:Q87I14
44T22D1.8T22D1.8n/achrIV 6,901,959
45Y43F8B.6Y43F8B.6n/achrV 19,493,363contains similarity to Yersinia pestis Putative insecticial toxin.; TR:Q8ZAV3
46D1022.5D1022.5n/achrII 7,458,058
47clec-167F38A1.4n/achrIV 1,254,535C. elegans CLEC-167 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
48srv-29T13A10.6n/achrIV 6,265,730C. elegans SRV-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
49sma-2ZK370.2n/achrIII 8,753,327sma-2 encodes, along with sma-3 and sma-4, one of three C. elegans Smad proteins, with SMA-2 and SMA-3 most closely related to receptor-regulated Smads (R-Smads) and SMA-4 more closely related to co-mediator Smads (CoSmads); during development, SMA-2 functions in a TGF-beta signaling pathway to regulate body size and specification of sensory structures in the male tail; a sma-2::gfp reporter is expressed in the pharynx, intestine, and hypodermis.
50T14G8.4T14G8.4n/achrX 12,862,943contains similarity to Mus musculus Gamma-tubulin complex component GCP5 homolog.; TR:Q8BKN5