UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1tba-6F32H2.90chrI 8,996,289C. elegans TBA-6 protein; contains similarity to Pfam domains PF00091 (Tubulin/FtsZ family, GTPase domain) , PF03953 (Tubulin/FtsZ family, C-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR002454 (Gamma tubulin), IPR002452 (Alpha tubulin), IPR002453 (Beta tubulin), IPR000217 (Tubulin), IPR003008 (Tubulin/FtsZ, GTPase), IPR004057 (Epsilon tubulin), IPR002967 (Delta tubulin), IPR000158 (Cell division protein FtsZ, N-terminal), IPR008280 (Tubulin/FtsZ, C-terminal)
2C17C3.11C17C3.11n/achrII 5,538,392contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core)
3R07C3.4R07C3.4n/achrII 934,987contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
4D2062.6D2062.6n/achrII 2,619,582contains similarity to Interpro domain IPR000104 (Antifreeze protein, type I)
5ech-3F43H9.1n/achrV 8,022,781C. elegans ECH-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00378 Enoyl-CoA hydratase/isomerase family contains similarity to Interpro domain IPR001753 (Crotonase, core)
6srv-12T04B2.4n/achrIV 10,052,440C. elegans SRV-12 protein ;
7C32D5.4C32D5.4n/achrII 6,322,171
8C48B6.4C48B6.4n/achrI 6,890,348contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domain IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type)
9C15H11.1C15H11.1n/achrV 14,394,129contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR002394 (Nicotinic acetylcholine receptor, N-terminal), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
10W06F12.3W06F12.3n/achrIII 13,735,661contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
11F28H1.5F28H1.5n/achrI 3,979,010
12ent-3K02E11.1n/achrV 14,234,164C. elegans ENT-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01733 Nucleoside transporter contains similarity to Interpro domain IPR002259 (Delayed-early response protein/equilibrative nucleoside transporter)
13ZK1225.5ZK1225.5n/achrI 13,217,724
14F26F2.1F26F2.1n/achrV 20,555,875contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG2839-PA;; FLYBASE:CG2839
15W01D2.3W01D2.3n/achrII 14,802,515contains similarity to Haemophilus influenzae Electron transport complex protein rnfD.; SW:RNFD_HAEIN
16skr-9C52D10.7n/achrIV 17,163,837skr-9 encodes a homolog of Skp1 in S. cerevisiae, a component of the SCF (Skp1, Cullin, F-box) ubiquitin-ligase complex that regulates ubiquitin-mediated protein degradation; SKR-9 is required for posterior body morphogenesis, embryonic and larval development, and postembryonic cell proliferation.
17F22B5.5F22B5.5n/achrII 8,453,880contains similarity to Pfam domain PF06852 Protein of unknown function (DUF1248) contains similarity to Interpro domain IPR009658 (Protein of unknown function DUF1248)
18C28C12.1C28C12.1n/achrIV 8,502,192contains similarity to Interpro domain IPR002217 (Lipoprotein LPP20)
19ZK84.5ZK84.5n/achrII 6,016,343
20F58F12.3F58F12.3n/achrII 6,390,234
21K02F6.3K02F6.3n/achrII 2,547,902contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
22K01D12.15K01D12.15n/achrV 12,386,487contains similarity to Interpro domains IPR001859 (Ribosomal protein P2), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
23try-7ZC581.6n/achrI 6,642,054C. elegans TRY-7 protein; contains similarity to Pfam domains PF00089 (Trypsin) , PF03761 (Domain of unknown function (DUF316)) contains similarity to Interpro domains IPR001314 (Peptidase S1A, chymotrypsin), IPR001254 (Peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap), IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
24C09F9.1C09F9.1n/achrII 14,698,971contains similarity to Interpro domain IPR000345 (Cytochrome c heme-binding site)
25T02H6.4T02H6.4n/achrII 690,572contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
26F41G3.5F41G3.5n/achrII 6,748,034contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
27F01D4.3F01D4.3n/achrIV 10,474,640contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00017 (SH2 domain) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR005819 (Histone H5), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR000980 (SH2 motif), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site), IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
28C09B9.4C09B9.4n/achrIV 5,032,484contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
29K02F6.2K02F6.2n/achrII 2,552,853contains similarity to Interpro domains IPR002110 (Ankyrin), IPR001357 (BRCT)
30scrm-8K08D10.7n/achrIV 4,165,432scrm-8 encodes a putative phospholipid scramblase required for normally short lifespan; SCRM-8 is homologous to human PLSCR1-5, and paralogous to other C. elegans SCRMs (e.g., SCRM-1).
31tsp-19D2092.7n/achrI 6,617,424C. elegans TSP-19 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
32C27B7.6C27B7.6n/achrIV 8,904,670contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
33K03H1.9K03H1.9n/achrIII 9,941,014contains similarity to Homo sapiens DAN15 protein; TR:Q99491
34rmd-5T23B3.3n/achrI 6,711,598C. elegans RMD-5 protein ; contains similarity to Xenopus laevis Protein FAM82C.; SW:Q5EAU9
35Y40H4A.2Y40H4A.2n/achrV 14,584,349contains similarity to Pfam domain PF00149 Calcineurin-like phosphoesterase contains similarity to Interpro domains IPR004843 (Metallophosphoesterase), IPR006186 (Serine/threonine-specific protein phosphatase and bis(5-nucleosyl)-tetraphosphatase)
36col-53M01A12.1n/achrI 5,645,857C. elegans COL-53 protein; contains similarity to Pfam domain PF01391 Collagen triple helix repeat (20 copies) contains similarity to Interpro domains IPR008161 (Collagen helix repeat), IPR008160 (Collagen triple helix repeat)
37ZK262.4ZK262.4n/achrV 18,424,010contains similarity to Arabidopsis thaliana Similarity to salt-inducible protein.; TR:Q9LVA2
38C02F5.2C02F5.2n/achrIII 8,249,732
39Y106G6G.1Y106G6G.1n/achrI 10,329,688contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I4Z6
40T10E9.6T10E9.6n/achrI 6,529,637contains similarity to Pfam domain PF03134 TB2/DP1, HVA22 family contains similarity to Interpro domain IPR004345 (TB2/DP1 and HVA22 related protein)
41C26B2.2C26B2.2n/achrIV 8,021,582
42T02H6.7T02H6.7n/achrII 683,000contains similarity to Pfam domain PF03762 Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI) contains similarity to Interpro domain IPR005515 (Vitelline membrane outer layer protein I (VOMI))
43R04B5.1R04B5.1n/achrV 10,078,069contains similarity to Culex nigripalpus baculovirus Putative 33 kDa early protein (CUN014 similar to AcMNPV ORF92).; TR:Q99GP2
44F38A5.8F38A5.8n/achrIV 6,600,170
45R155.2R155.2n/achrIII 1,967,000contains similarity to Pfam domains PF02206 (Domain of unknown function) , PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR013992 (Adenylate cyclase-associated CAP, N-terminal), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
46Y32B12A.4Y32B12A.4n/achrV 16,494,950contains similarity to Pfam domain PF06678 Protein of unknown function (DUF1179) contains similarity to Interpro domain IPR009564 (Protein of unknown function DUF1179)
47C18H7.7C18H7.7n/achrIV 596,081
48F54D1.1F54D1.1n/achrIV 11,262,424contains similarity to Interpro domain IPR004087 (K Homology)
49K09G1.2K09G1.2n/achrV 9,590,914contains similarity to Carnobacterium piscicola Putative ABC transporter PisT.; TR:Q93QC9
50F47B3.4F47B3.4n/achrI 3,961,620contains similarity to Pfam domain PF03057 Protein of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR006077 (Vinculin/alpha-catenin), IPR003267 (Small proline-rich), IPR004296 (Protein of unknown function DUF236), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001399 (VP6 blue-tongue virus inner capsid protein), IPR000079 (High mobility group protein HMG14 and HMG17)