UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F32G8.2F32G8.20chrV 10,552,095contains similarity to Pfam domain PF02995 Protein of unknown function (DUF229) contains similarity to Interpro domain IPR004245 (Protein of unknown function DUF229)
2nph-1M28.7n/achrII 10,650,519nph-1 encodes a novel, SH3 domain-containing protein that is orthologous to mammalian nephrocystin-1.
3let-711F57B9.2n/achrIII 6,952,757let-711 encodes the C. elegans ortholog of NOT1, the conserved core component of the multisubunit CCR4/NOT complex that plays a role in regulation of gene expression via various processes including transcriptional control, mRNA deadenylation, and protein ubiquitination; in C. elegans, let-711 activity is essential for embryonic and larval development and in particular, for proper spindle positioning, microtubule length, and centrosome morphology in early embryos; in addition, let-711 is essential for normal germline development and levels of fertility; in embryos, let-711 mutations can suppress the short microtubule phenotype produced by mutations in zyg-9, which encodes the C. elegans XMAP125 homolog, and centrosomoal ZYG-9 levels are increased in let-711 mutants, suggesting that let-711 functions, in part, by negatively regulating ZYG-9 levels or localization; in situ hybridization studies indicate that let-711 mRNA is broadly expressed in the gonad and that its gonadal expression is negatively regulated by lin-35/Rb.
4ZC84.6ZC84.6n/achrIII 9,196,038contains similarity to Pfam domains PF01683 (EB module) (3), PF00014 (Kunitz/Bovine pancreatic trypsin inhibitor domain) (5)contains similarity to Interpro domains IPR002223 (Proteinase inhibitor I2, Kunitz metazoa), IPR006150 (Cysteine-rich repeat), IPR006149 (Nematode-specific EB region)
5W06A11.2W06A11.2n/achrII 4,060,321
6K09F6.2K09F6.2n/achrII 2,268,709contains similarity to Pfam domain PF06869 Protein of unknown function (DUF1258) contains similarity to Interpro domain IPR009667 (Protein of unknown function DUF1258)
7T24D1.2T24D1.2n/achrI 9,954,687contains similarity to Interpro domain IPR001841 (Zinc finger, RING-type)
8srt-17F48G7.6n/achrV 624,474C. elegans SRT-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
9rhr-2B0240.1n/achrV 11,729,008rhr-2 encodes a predicted transmembrane protein with similarity to human Rh blood group antigens proposed to function in inorganic ion transport and metabolism; the role of RHR-2 in C. elegans development or behavior remains unclear, as loss of RHR-2 function via RNA-mediated interference does not result in any abnormalities.
10T05E11.6T05E11.6n/achrIV 11,109,297contains similarity to Pfam domain PF01650 Peptidase C13 family contains similarity to Interpro domain IPR001096 (Peptidase C13, legumain)
11apt-9W04G3.4n/achrX 11,070,152apt-9 gene encodes an ortholog of GGA (Golgi-localizing, gamma-adaptin ear homology, ARF-binding protein), which contains a domain paralogous to the gamma-adaptin subunits of adaptor protein complexes; based on structural similarity, APT-9 may beinvolved in the formation of intracellular transport vesicles.
12F56F10.4F56F10.4n/achrX 867,910contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR000664 (Lethal(2) giant larvae protein)
13C49A9.3C49A9.3n/achrIV 6,223,512contains similarity to Pfam domain PF03312 Protein of unknown function, DUF272 contains similarity to Interpro domains IPR000711 (ATPase, F1 complex, OSCP/delta subunit), IPR004987 (Protein of unknown function DUF272)
14hil-8T05E8.2n/achrI 5,467,787C. elegans HIL-8 protein; contains similarity to Interpro domain IPR005818 (Histone H1/H5)
15C14C6.7C14C6.7n/achrV 549,678contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
16fbxb-5F45C12.14n/achrII 1,721,873This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
17T15D6.11T15D6.11n/achrI 12,397,457contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
18T05E7.4T05E7.4n/achrI 6,193,727
19C18B10.6C18B10.6n/achrV 7,480,150contains similarity to Pfam domains PF02958 (Domain of unknown function (DUF227)) , PF07914 (Protein of unknown function (DUF1679)) contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR012877 (Protein of unknown function DUF1679, Caenorhabditis species), IPR004119 (Protein of unknown function DUF227), IPR015897 (CHK kinase-like)
20srh-170R08H2.3n/achrV 15,387,872C. elegans SRH-170 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21F33H2.8F33H2.8n/achrI 15,032,079contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8IBJ6
22T05D4.3T05D4.3n/achrIII 13,568,545contains similarity to Interpro domain IPR005838 (Type III secretion system inner membrane P protein)
23C02F12.8C02F12.8n/achrX 3,691,690contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
24F28C6.9F28C6.9n/achrII 8,609,707contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein KIAA0562; ENSEMBL:ENSP00000263739
25R13.3R13.3n/achrIV 10,830,875contains similarity to Pfam domain PF01062 Bestrophin contains similarity to Interpro domain IPR000615 (Bestrophin)
26srt-22ZK1037.3n/achrV 15,315,273C. elegans SRT-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
27fbxa-167C31C9.3n/achrII 13,642,551This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
28fbxb-51K05F6.3n/achrII 1,552,094C. elegans FBXB-51 protein; contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
29T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
30sri-73C14C6.10n/achrV 565,238C. elegans SRI-73 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR003544 (Cytochrome c-type biogenesis protein CcmB)
31T28F2.7T28F2.7n/achrI 3,658,340contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domains IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5), IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
32K09F6.5K09F6.5n/achrII 2,272,724contains similarity to Interpro domain IPR000358 (Ribonucleotide reductase)
33H39E20.1H39E20.1n/achrX 1,396,448
34ZC250.2ZC250.2n/achrV 5,793,898contains similarity to Pfam domain PF00535 Glycosyl transferase family 2 contains similarity to Interpro domain IPR001173 (Glycosyl transferase, family 2)
35ZK1055.4ZK1055.4n/achrV 6,586,468contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
36ZK822.1ZK822.1n/achrIV 11,920,082contains similarity to Homo sapiens myosin, heavy polypeptide 7B, cardiac muscle, beta; ENSEMBL:ENSP00000262873
37F36D3.1F36D3.1n/achrV 16,501,082contains similarity to Interpro domain IPR008928 ()
38acr-18F28F8.1n/achrV 15,555,125acr-18 encodes an alpha subunit of nicotinic acetylcholine receptor (nAChR), predicted to be a ligand-gated ion channel regulating fast action of acetylcholine at neuromuscular junctions and in the nervous system; ACR-18 falls into the 'DEG-3' class of nAChR subunits, apparently unique to nematodes, which includes DEG-3, DES-2, ACR-5, ACR-17, ACR-20, and ACR-23.
39K01D12.5K01D12.5n/achrV 12,398,255contains similarity to Interpro domain IPR003980 (Histamine H3 receptor)
40C42D4.2C42D4.2n/achrIV 7,181,781contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
41K07E8.10K07E8.10n/achrII 666,102
42srw-127C33G8.1n/achrV 7,013,646C. elegans SRW-127 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
43F26A1.9F26A1.9n/achrIII 4,825,812
44F55A12.5F55A12.5n/achrI 5,347,791contains similarity to Gallus gallus Nucleolin (Protein C23).; SW:P15771
45F58E1.4F58E1.4n/achrII 1,680,715contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
46K09C4.2K09C4.2n/achrX 3,297,833
47R11D1.7R11D1.7n/achrV 12,721,371contains similarity to Mycoplasma capricolum Hypothetical 37.9 kDa protein in ptsH 3'region (ORF1).; SW:YPH1_MYCCA
48arc-1ZK1320.6n/achrII 9,676,012arc-1 encodes a member of the ARL (ADP-ribosylation factor(ARF)-like) family of proteins which are very similar to ARF proteins but lack the ability to stimulate ADP ribosylation by cholera toxin; arc-1 has a human homolog, MID1, which when mutated leads to Opitz syndrome (OMIM:300000).
49sdz-31T11A5.5n/achrV 9,880,568C. elegans SDZ-31 protein; contains similarity to Interpro domains IPR001376 (Gliadin, alpha/beta), IPR000896 (Hemocyanin, copper-containing)
50lgc-45W10G11.16n/achrII 3,566,681C. elegans LGC-45 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)