UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F32D1.3F32D1.30chrV 4,355,654contains similarity to Pfam domains PF07719 (Tetratricopeptide repeat) (3), PF08409 (Domain of unknown function (DUF1736)) , PF00515 (Tetratricopeptide repeat) (6)contains similarity to Interpro domains IPR011990 (Tetratricopeptide-like helical), IPR013618 (Region of unknown function DUF1736), IPR008940 (Protein prenyltransferase), IPR001440 (Tetratricopeptide TPR-1), IPR013105 (Tetratricopeptide TPR2), IPR013026 (Tetratricopeptide region)
2F46F5.14F46F5.14n/achrII 800,774contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domain IPR004988 (Protein of unknown function DUF273)
3php-3Y75B8A.1n/achrIII 12,075,804C. elegans PHP-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR000047 (Helix-turn-helix motif, lambda-like repressor), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
4rab-14K09A9.2n/achrX 15,605,871rab-14 encodes a member of the Rab GTPase family.
5C04E7.1C04E7.1n/achrX 359,435
6R13A1.1R13A1.1n/achrIV 7,220,097
7str-143C09H5.4n/achrV 8,068,920C. elegans STR-143 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
8F57C12.2F57C12.2n/achrX 548,426contains similarity to Pfam domain PF04670 Gtr1/RagA G protein conserved region contains similarity to Interpro domains IPR009053 (Prefoldin), IPR006762 (Gtr1/RagA G protein)
9tkr-1C38C10.1n/achrIII 9,386,535tkr-1 encodes a G protein-coupled receptor that is the C. elegans tachykinin-like neuropeptide receptor homolog; by homology, TKR-1 is predicted to function in modulation of excitatory neurotransmission; as loss of tkr-1 activity via RNAi results in moderate reduction of fat content, TKR-1 may play a specific role in regulating lipid metabolism; a tkr-1 reporter gene fusion is reportedly expressed in the socket cells of the deirid and post-deirid sensilla from the L2 larval stage through adulthood.
10C16D6.1C16D6.1n/achrX 12,525,704contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
11btb-15C08E3.2n/achrII 1,611,924C. elegans BTB-15 protein; contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
12C14A6.5C14A6.5n/achrV 18,164,125contains similarity to Arabidopsis thaliana Calreticulin 2 precursor.; SW:CRT2_ARATH
13T20B6.1T20B6.1n/achrIII 2,898,031contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
14dyf-5M04C9.5n/achrI 9,360,991dyf-5 encodes a putative MAP kinase orthologous to human MAK/ICK (OMIM:154235), Chlamydomonas reinhardtii LF4, and Leishmania mexicana MPK9; DYF-5 negatively regulates cilial length, restricts KAP-1 to middle ciliary segments, is required for normal localization of six IFT components, and is required for OSM-3 to comigrate normally with IFT particles; DYF-5 is also required for dye-filling of amphid and phasmid neurons and for normal chemotaxis, dauer formation, and male mating; DYF-5 is expressed in head neurons (including amphid neurons), tail neurons (including phasmid neurons), CAN cells, excretory canal neurons, posterior lateral ganglion neurons and in many male tail cells; dyf-5 mutant cilia are abnormally elongated, either failing to enter the amphid channel or accumulating IFT proteins at their distal ends, whereas DYF-5 overexpression results in truncated cilia; the dyf-5 promoter region contains an X-box, predicted to be bound and transcriptionally activated by DAF-19, and dyf-5 is regulated by DAF-19 in vivo; dyf-5 animals are slightly shorter than normal.
15C56E6.6C56E6.6n/achrII 6,542,233contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR000483 (Cysteine-rich flanking region, C-terminal), IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype)
16W02B8.3W02B8.3n/achrII 13,917,920contains similarity to Pfam domain PF04870 Protein of unknown function, DUF644 contains similarity to Interpro domain IPR006954 (Protein of unknown function DUF644)
17ZK1290.10ZK1290.10n/achrII 7,552,859contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
18sra-30Y40H7A.6n/achrIV 15,197,622C. elegans SRA-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
19M28.4M28.4n/achrII 10,645,246contains similarity to Homo sapiens Kinesin-like protein 2; ENSEMBL:ENSP00000324020
20R07C3.10R07C3.10n/achrII 910,744
21str-130C09H5.9n/achrV 8,089,962C. elegans STR-130 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22F55B12.2F55B12.2n/achrV 13,816,154contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
23flp-32R03A10.2n/achrX 15,434,497C. elegans FLP-32 protein ;
24sre-14C42C1.1n/achrIV 12,260,640C. elegans SRE-14 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000326 (Phosphatidic acid phosphatase type 2/haloperoxidase), IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
25T07F8.1T07F8.1n/achrII 7,150,444contains similarity to Pfam domain PF06918 Protein of unknown function (DUF1280) contains similarity to Interpro domain IPR009689 (Protein of unknown function DUF1280)
26F31F4.11F31F4.11n/achrV 663,441contains similarity to Pfam domains PF00788 (Ras association (RalGDS/AF-6) domain) , PF02204 (Vacuolar sorting protein 9 (VPS9) domain) contains similarity to Interpro domains IPR013995 (Vacuolar sorting protein 9, subgroup), IPR003123 (Vacuolar sorting protein 9), IPR000159 (Ras-association)
27str-140C09H5.3n/achrV 8,066,820C. elegans STR-140 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28F29A7.3F29A7.3n/achrII 2,753,579contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
29lgc-31F21A3.7n/achrV 15,516,308C. elegans LGC-31 protein
30D2005.6D2005.6n/achrI 7,790,102contains similarity to Homo sapiens Fusion protein SYT-SSX1; ENSEMBL:ENSP00000269138
31str-4C50B6.10n/achrV 13,338,836C. elegans STR-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
32Y113G7B.24Y113G7B.24n/achrV 20,231,897contains similarity to Pfam domain PF05916 Synthetic lethal mutants of dpb11-1 five contains similarity to Interpro domain IPR008591 (GINS complex, Sld5 component)
33mif-3F13G3.9n/achrI 7,313,193C. elegans MIF-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01187 Macrophage migration inhibitory factor (MIF) contains similarity to Interpro domains IPR014347 (Tautomerase), IPR001398 (Macrophage migration inhibitory factor)
34F08G12.5F08G12.5n/achrX 11,309,490contains similarity to Pfam domain PF00097 Zinc finger, C3HC4 type (RING finger) contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
35srw-140C03A7.3n/achrV 5,166,467C. elegans SRW-140 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
36ssu-1Y113G7A.11n/achrV 20,126,167ssu-1 encodes, by alternative splicing, two isoforms of a cytosolic alcohol sulfotransferase that interacts in the ASJ amphid neurons with the stomatins UNC-1 and UNC-24; the longer SSU-1 isoform is required for normal anesthetic sensitivity and unc-1 phenotypes; ssu-1(fc73) suppresses the anesthetic sensitivity and uncoordinated phenotypes of unc-1 and unc-24 mutants; ssu-1(fc73), along with daf-12, suppresses the synthetic constitutive dauer-formation phenotype of fc83;unc-24(e138) mutants; ssu-1 suppression is rescued by transgenic expression of SSU-1 in the ASJ neurons alone, implying that sulfation is required for an endocrine function; SSU-1 protein sulfates 4-nitrophenol and 2-naphthol substrates, and bisphenol A, but not monoamines or hydroxysteroids; SSU-1 is cytosolic, but its activity is not detectable in cytosolic extracts; ssu-1 is strongly expressed in embryos, growing larvae, and dauer larvae; ssu-1 expression is increased in daf-2; by homology with other sulfotransferases, SSU-1 may link sulfates to the alcohol group of small molecules as part of detoxification or signal transduction.
37F56F11.5F56F11.5n/achrIII 2,853,197
38CD4.5CD4.5n/achrV 5,590,729
39gcy-18ZK896.8n/achrIV 12,863,005gcy-18 encodes a receptor-type guanylyl cyclase that, along with gcy-8 and gcy-23, constitutes a subfamily of guanylyl cyclase genes in C. elegans; gcy-18 functions redundantly with gcy-8 and gcy-23, and upstream of tax-4, to regulate thermotaxis via the AFD thermosensory neurons, although of the three guanylyl cyclases required, genetic analyses suggest that GCY-18 is the primary guanylyl cyclase required; in addition, microarray experiments indicate that gcy-18 expression is induced in daf-16(RNAi); daf-2(RNAi) double mutants and repressed in daf-2(RNAi) mutants, suggesting that GCY-18 activity may contribute to a shortened lifespan; consistent with this, loss of gcy-18 activity via RNAi does result in lifespan extension; GCY-18 is expressed exclusively in the AFD thermosensory neurons, where it localizes to sensory endings.
40srz-103F14F8.4n/achrV 16,678,452C. elegans SRZ-103 protein; contains similarity to Interpro domain IPR001046 (Natural resistance-associated macrophage protein)
41Y39E4B.13Y39E4B.13n/achrIII 13,092,265contains similarity to Caulobacter crescentus Localization factor podJL (Polar organelle development protein)s[Contains: Localization factor podJS].; SW:PODJ_CAUCR
42F54C4.4F54C4.4n/achrIII 87,055
43ZK380.2ZK380.2n/achrX 1,633,167contains similarity to Interpro domain IPR011072 (HR1 rho-binding repeat)
44srd-30F07C4.5n/achrV 7,630,532C. elegans SRD-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45C44B11.1C44B11.1n/achrIII 3,156,820contains similarity to Pfam domain PF06905 Fas apoptotic inhibitory molecule (FAIM1) contains similarity to Interpro domain IPR010695 (Fas apoptotic inhibitory molecule)
46T09E8.4T09E8.4n/achrV 13,182,889contains similarity to Pfam domain PF02460 Patched family contains similarity to Interpro domains IPR003392 (Patched), IPR000731 (Sterol-sensing 5TM box)
47C03C10.2C03C10.2n/achrIII 4,092,033contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
48srb-2C27D6.9n/achrII 5,168,699C. elegans SRB-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF02175 C.elegans integral membrane protein Srb contains similarity to Interpro domain IPR002184 (Serpentine beta receptor)
49str-250C06B3.10n/achrV 13,919,315C. elegans STR-250 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50fbxa-129F59A1.8n/achrV 17,656,084C. elegans FBXA-129 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)