UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1nhr-4F32B6.10chrIV 9,880,614nhr-4 is predicted to encode a nuclear hormone receptor (NHR); expression may peak during the late larval stages, based on mRNA expression analysis.
2srh-23C02E7.5n/achrV 4,921,905C. elegans SRH-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
3tsg-101C09G12.9n/achrIV 3,512,510C09G12.9 encodes the C. elegans ortholog of S. cerevisiae vacuolar protein sorting protein Vps23p and human TUMOR SUSCEPTIBILITY GENE 101 (TSG101; OMIM:601387), mutations in which are associated with several types of cancer and with varying responses to HIV infection; the product of C09G12.9 is predicted to be a component of C. elegans ESCRT-1 (Endosomal Sorting Complex Required for Transport), and RNAi experiments indicate that its activity is essential for embryonic and larval development.
4ZK112.6ZK112.6n/achrIII 7,740,126contains similarity to Leptospira interrogans serogroup Icterohaemorrhagiae serovar copenhageni Acetyl-coenzyme A synthetase (EC 6.2.1.1) (Acetate--CoA ligase) (Acyl-sactivating enzyme).; SW:Q72LY9
5ceh-1F16H11.4n/achrX 4,653,768ceh-1 encodes a protein that contains a homeobox domain.
6srg-33F21F8.1n/achrV 8,292,769C. elegans SRG-33 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
7srw-122H27D07.5n/achrV 2,951,456C. elegans SRW-122 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
8fbxa-23T12B5.13n/achrIII 948,457C. elegans FBXA-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
9srh-62ZK6.9n/achrV 402,409C. elegans SRH-62 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
10nhr-198K06B4.80.0000000001chrV 15,695,079C. elegans NHR-198 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
11C16D9.8C16D9.8n/achrV 8,262,448
12tni-4W03F8.1n/achrIV 5,205,854tni-4 encodes one of the four elegans troponin I proteins; tni-4 is required for the normal development of the pharynx during embryonic development; TNI-4 interacts only with the pharyngeal troponin C; tni-4 is expressed exclusively in the pharyngeal muscles.
13gst-25F37F2.3n/achrI 1,452,100C. elegans GST-25 protein; contains similarity to Pfam domains PF00043 (Glutathione S-transferase, C-terminal domain) , PF02798 (Glutathione S-transferase, N-terminal domain) contains similarity to Interpro domains IPR012336 (Thioredoxin-like fold), IPR003082 (Glutathione S-transferase, Pi class), IPR012335 (Thioredoxin fold), IPR004046 (Glutathione S-transferase, C-terminal), IPR004045 (Glutathione S-transferase, N-terminal), IPR010987 (Glutathione S-transferase, C-terminal-like)
14clec-178T19E7.1n/achrIV 5,654,480C. elegans CLEC-178 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
15lgc-13T01H10.1n/achrX 12,110,105C. elegans LGC-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
16F56H6.9F56H6.9n/achrI 12,305,199contains similarity to Pfam domain PF03385 Protein of unknown function, DUF288 contains similarity to Interpro domain IPR005049 (Protein of unknown function DUF288)
17mbr-1T01C1.2n/achrX 10,720,732C. elegans MBR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF05225 helix-turn-helix, Psq domain contains similarity to Interpro domains IPR011526 (Helix-turn-helix, Psq-like), IPR007889 (Helix-turn-helix, Psq)
18T02B11.6T02B11.6n/achrV 887,079contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
19F59E12.8F59E12.8n/achrII 5,635,699contains similarity to Interpro domain IPR015683 (Glutamate receptor-related)
20srm-1T28H11.2n/achrIV 5,013,566C. elegans SRM-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001991 (Sodium:dicarboxylate symporter)
21srv-7T22B7.5n/achrX 5,643,888C. elegans SRV-7 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like)
22F47F2.2F47F2.2n/achrX 3,886,480
23nhr-116F09C6.90.00000000000005chrV 16,913,761C. elegans NHR-116 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
24Y102A5C.27Y102A5C.27n/achrV 16,988,446contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
25str-46C31B8.6n/achrV 2,899,200C. elegans STR-46 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26K10H10.9K10H10.9n/achrII 14,514,333contains similarity to Vibrio vulnificus Conserved hypothetical protein.; TR:Q8D6Y7
27T08A9.5T08A9.5n/achrX 7,312,937
28T27E4.5T27E4.5n/achrV 9,069,053contains similarity to Pfam domain PF00095 WAP-type (Whey Acidic Protein) 'four-disulfide core' contains similarity to Interpro domain IPR008197 (Whey acidic protein, 4-disulphide core)
29F59D12.1F59D12.1n/achrX 15,669,484contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
30acr-5K03F8.2n/achrIII 6,512,172acr-5 encodes a predicted member of the alpha subunit family of nicotinic acetylcholine receptors that is expressed in the nervous system.
31smf-2K11G12.3n/achrX 6,717,366C. elegans SMF-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF01566 Natural resistance-associated macrophage protein contains similarity to Interpro domain IPR001046 (Natural resistance-associated macrophage protein)
32Y48A6C.1Y48A6C.1n/achrIII 11,104,510contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
33srab-1C04F5.4n/achrV 5,101,092C. elegans SRAB-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF02175 C.elegans integral membrane protein Srb contains similarity to Interpro domain IPR002184 (Serpentine beta receptor)
34fpn-1.3R08F11.6n/achrV 3,796,213C. elegans FPN-1.3 protein; contains similarity to Pfam domain PF06963 Ferroportin1 (FPN1) contains similarity to Interpro domains IPR009716 (Ferroportin1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
35C37E2.3C37E2.3n/achrX 14,180,268contains similarity to Pfam domain PF04750 FAR-17a/AIG1-like protein contains similarity to Interpro domains IPR006838 (FAR-17a/AIG1-like protein), IPR002208 (SecY protein)
36K08B4.5K08B4.5n/achrIV 6,087,860contains similarity to Pfam domain PF00443 Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase contains similarity to Interpro domains IPR001394 (Peptidase C19, ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 2), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR001019 (Guanine nucleotide binding protein (G-protein), alpha subunit)
37cah-1F54D8.4n/achrIII 5,084,208cah-1 encodes a member of the carbonic anhydrase family.
38clec-231C29F3.4n/achrV 15,350,031C. elegans CLEC-231 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
39odr-10C53B7.5n/achrX 6,865,080odr-10 encodes a member of the 7-transmembrane family of odorant receptors which affects chemotaxis to the volatile odorant diacetyl; ODR-10 is strongly expressed in the cilia of the AWA olfactory neurons and, at low levels, in the CEP neurons; expression of odr-10 mRNA and of an odr-10::GFP fusion gene is greatly reduced in odr-7 mutant animals, suggesting that odr-7, which encodes a predicted transcription factor, functions upstream of odr-10 in specifying AWA neuronal cell fate.
40C31E10.1C31E10.1n/achrX 13,985,013contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000238 (Ribosome-binding factor A)
41T27C5.8T27C5.8n/achrV 17,417,742contains similarity to Pfam domain PF06653 Protein of unknown function (DUF1164) contains similarity to Interpro domain IPR009545 (Protein of unknown function DUF1164)
42F30A10.9F30A10.9n/achrI 9,505,158contains similarity to Pfam domain PF04900 Fcf1 contains similarity to Interpro domains IPR006984 (Protein of unknown function DUF652), IPR006596 (Nucleotide binding protein, PINc)
43T21E12.3T21E12.3n/achrI 4,403,989contains similarity to Pfam domain PF03761 Domain of unknown function (DUF316) contains similarity to Interpro domains IPR005514 (Protein of unknown function DUF316), IPR009003 (Peptidase, trypsin-like serine and cysteine)
44C24A3.1C24A3.1n/achrX 9,003,584contains similarity to Aedes aegypti Condensin, SMC5-subunit, putative (Fragment).; TR:Q16IF0
45F15G9.5F15G9.5n/achrX 9,735,456contains similarity to Homo sapiens Fibrillin 2 precursor; ENSEMBL:ENSP00000262464
46C07A9.12C07A9.12n/achrIII 9,726,313contains similarity to Pfam domain PF01705 CX module contains similarity to Interpro domain IPR002619 (Protein of unknown function CX)
47xbx-1F02D8.3n/achrV 14,981,466C. elegans XBX-1 protein ; contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Cytoplasmic dynein 2 light intermediate chain 1; ENSEMBL:ENSP00000260605
48F55H12.3F55H12.3n/achrI 8,884,703contains similarity to Pfam domains PF00008 (EGF-like domain) (5), PF07645 (Calcium binding EGF domain) , PF07699 (GCC2 and GCC3) (3), PF07974 (EGF-like domain) (5), PF00057 (Low-density lipoprotein receptor domain class A) , PF02494 (HYR domain) , PF00084 (Sushi domain (SCR repeat)) (2)contains similarity to Interpro domains IPR000483 (Cysteine-rich flanking region, C-terminal), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR003410 (Hyalin), IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR006209 (EGF-like), IPR000152 (Aspartic acid and asparagine hydroxylation site), IPR006210 (EGF), IPR002049 (EGF-like, laminin), IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich), IPR011641 (GCC2 and GCC3), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001881 (EGF-like calcium-binding), IPR016060 (Complement control module), IPR009030 (Growth factor, receptor), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR001304 (C-type lectin), IPR013111 (EGF, extracellular), IPR013091 (EGF calcium-binding), IPR008985 (Concanavalin A-like lectin/glucanase)
49C03A3.3C03A3.3n/achrX 11,268,134contains similarity to Pfam domain PF00753 Metallo-beta-lactamase superfamily contains similarity to Interpro domain IPR001279 (Beta-lactamase-like)
50ver-2T17A3.8n/achrIII 148,578C. elegans VER-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) , PF00569 (Zinc finger, ZZ type) contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related), IPR008266 (Tyrosine protein kinase, active site), IPR000433 (Zinc finger, ZZ-type)