UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F32B5.3F32B5.30chrI 2,693,421contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domains IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species), IPR003968 (Potassium channel, voltage dependent, Kv)
2F31F7.3F31F7.3n/achrV 6,269,506
3ZC204.6ZC204.6n/achrII 1,644,534
4M01D7.1M01D7.1n/achrI 1,859,236This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
5ZK1010.8ZK1010.8n/achrIII 12,998,222contains similarity to Homo sapiens BRG1-binding protein ELD/OSA1 isoform 1; TR:Q8IZY8
6C25G6.3C25G6.3n/achrX 1,235,994contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR011130 (SecA preprotein cross-linking region), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
7bli-3F56C11.1n/achrI 150,659bli-3 encodes a large homolog of dual oxidase ('Ce-Duox1'), with an N-terminal peroxidase domain, two central calmodulin-binding EF hands, and a C-terminal superoxide-generating NADPH-oxidase domain; BLI-3 is required for dityrosine cross-linking of collagen, and thus for cuticular integrity; BLI-3 is thought to use cytosolic NADPH to generate reactive oxygen, which then drives the peroxidase ectodomain to cross-link free tyrosine in collagen; BLI-3 is expressed exclusively in hypodermal cells at low levels, with peaks of expression corresponding to collagen/cuticle biosynthesis.
8K02F6.6K02F6.6n/achrII 2,530,385contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
9ZK550.3ZK550.3n/achrIV 17,252,502contains similarity to Pfam domain PF01432 Peptidase family M3 contains similarity to Interpro domain IPR001567 (Peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F)
10C06C3.7C06C3.7n/achrII 9,385,835contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Protein that binds tRNA and methionyl- and glutamyl-tRNA synthetases (Mes1p and Ygl245wp), delivering tRNA to them, stimulating catalysis, and ensuring their localization to the cytoplasm; also binds quadruplex nucleic acids; SGD:YGL105W
11C14C6.6C14C6.6n/achrV 546,947contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
12fbxb-118W06A11.3n/achrII 4,063,201C. elegans FBXB-118 protein ;
13K06H6.5K06H6.5n/achrV 577,400contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
14srt-62T27C10.2n/achrI 10,900,411C. elegans SRT-62 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
15C54H2.4C54H2.4n/achrX 5,768,086
16B0034.5B0034.5n/achrII 5,973,873contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
17W02D9.8W02D9.8n/achrI 12,558,734contains similarity to Interpro domain IPR004692 (Preprotein translocase SecG subunit)
18C07E3.8C07E3.8n/achrII 10,352,798contains similarity to Pfam domain PF06542 Protein of unknown function (DUF1114) contains similarity to Interpro domain IPR009497 (Protein of unknown function DUF1114)
19C18D4.3C18D4.3n/achrV 17,532,536contains similarity to Acetobacter diazotrophicus FixX.; TR:Q9FA07
20srg-21Y25C1A.9n/achrII 3,089,880C. elegans SRG-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF02118 C.elegans Srg family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
21F44F1.2F44F1.2n/achrI 13,253,455
22R03A10.5R03A10.5n/achrX 15,448,432contains similarity to Pfam domains PF01105 (emp24/gp25L/p24 family/GOLD) , PF00650 (CRAL/TRIO domain) contains similarity to Interpro domains IPR001251 (Cellular retinaldehyde-binding/triple function, C-terminal), IPR000348 (emp24/gp25L/p24)
23Y59C2A.2Y59C2A.2n/achrII 2,201,637contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
24T27A1.3T27A1.3n/achrII 536,941This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
25sri-25C41G6.10n/achrV 15,218,422C. elegans SRI-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
26F56C3.4F56C3.4n/achrX 1,360,874
27T06D4.2T06D4.2n/achrII 3,385,081
28F56C3.3F56C3.3n/achrX 1,358,147
29sri-54T10D4.8n/achrII 3,136,737C. elegans SRI-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
30gnrr-2C15H11.2n/achrV 14,410,464C. elegans GNRR-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like), IPR001817 (Vasopressin receptor)
31C17D12.5C17D12.5n/achrI 11,586,755contains similarity to Interpro domains IPR000608 (Ubiquitin-conjugating enzyme, E2), IPR016135 (Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like)
32T04B8.2T04B8.2n/achrII 631,033This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; its encoded protein also contains a Pfam-B45 motif of presently unknown function.
33F21A9.1F21A9.1n/achrI 3,712,645
34K09D9.12K09D9.12n/achrV 4,003,740
35nhr-221T24A6.8n/achrV 3,534,117C. elegans NHR-221 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
36gnrr-7F13D2.3n/achrX 11,186,568C. elegans GNRR-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
37E03H4.11E03H4.11n/achrI 12,433,962contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
38F36F12.1F36F12.1n/achrV 2,101,648contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
39bra-1F54B11.6n/achrX 13,598,994The bra-1 gene encodes a homolog of the human BMP receptor-associated molecule (BRAM1) that negatively regulates the DAF-1/DAF-7/DAF-14 TGF-beta signalling pathway.
40tbx-38C24H11.3n/achrIII 11,785,014tbx-38 encodes a T box transcription factor; during embryonic development, tbx-38 functions redundantly with tbx-37 to effect Notch-mediated pharyngeal mesoderm induction in descendants of the ABa blastomere; in addition, tbx-38 and tbx-37 are required for proper cell fate specification of other ABa descendants, such as those that give rise to hypodermal tissue; TBX-38 expression appears to be limited to the 8 ABa descendents at the 24-cell stage of embryogenesis, with expression diminishing markedly during the next cell cycle; negative regulation of TBX-38 expression in ABp descendants depends upon Notch signaling, while negative regulation of expression in EMS descendents is likely controlled, in part, by ref-1 and unc-37, which encode bHLH and Groucho-like proteins, respectively.
41F35A5.5F35A5.5n/achrX 3,794,638contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR000976 (Wilm's tumour protein)
42srx-6F07G11.8n/achrV 7,312,511C. elegans SRX-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
43W02D9.9W02D9.9n/achrI 12,557,310contains similarity to Bacteroides thetaiotaomicron Arabinose-proton symporter (Arabinose transporter).; TR:Q8AAL0
44T05C1.5T05C1.5n/achrII 4,490,625contains similarity to Pfam domain PF01549 ShK domain-like contains similarity to Interpro domain IPR003582 (Metridin-like ShK toxin)
45R09H3.3R09H3.3n/achrX 1,667,620
46K12B6.7K12B6.7n/achrV 6,297,759
47C08B6.10C08B6.10n/achrV 10,126,265contains similarity to Interpro domains IPR006030 (Molluscan rhodopsin C-terminal tail), IPR000694 (Proline-rich region)
48F47G6.3F47G6.3n/achrI 1,467,585contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
49K04F1.13K04F1.13n/achrV 1,652,895contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
50C09B9.1C09B9.1n/achrIV 5,039,116