UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F31F7.3F31F7.32e-65chrV 6,269,506
2F47G6.3F47G6.3n/achrI 1,467,585contains similarity to Homo sapiens Putative uncharacterized protein (Fragment); ENSEMBL:ENSP00000333119
3R03A10.5R03A10.5n/achrX 15,448,432contains similarity to Pfam domains PF01105 (emp24/gp25L/p24 family/GOLD) , PF00650 (CRAL/TRIO domain) contains similarity to Interpro domains IPR001251 (Cellular retinaldehyde-binding/triple function, C-terminal), IPR000348 (emp24/gp25L/p24)
4fbxb-118W06A11.3n/achrII 4,063,201C. elegans FBXB-118 protein ;
5C54H2.4C54H2.4n/achrX 5,768,086
6Y59C2A.2Y59C2A.2n/achrII 2,201,637contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
7F32B5.3F32B5.3n/achrI 2,693,421contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domains IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species), IPR003968 (Potassium channel, voltage dependent, Kv)
8C14C6.6C14C6.6n/achrV 546,947contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
9C25G6.3C25G6.3n/achrX 1,235,994contains similarity to Pfam domain PF02178 AT hook motif contains similarity to Interpro domains IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR011130 (SecA preprotein cross-linking region), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
10C23H5.1C23H5.1n/achrIV 2,132,010contains similarity to Pfam domains PF08242 (Methyltransferase domain) , PF08241 (Methyltransferase domain) contains similarity to Interpro domains IPR013217 (Methyltransferase type 12), IPR013216 (Methyltransferase type 11)
11gnrr-7F13D2.3n/achrX 11,186,568C. elegans GNRR-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
12sri-54T10D4.8n/achrII 3,136,737C. elegans SRI-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
13C31E10.5C31E10.5n/achrX 13,993,587contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of Q92614 Myosin XVIIIA; ENSEMBL:ENSP00000332202
14bli-3F56C11.1n/achrI 150,659bli-3 encodes a large homolog of dual oxidase ('Ce-Duox1'), with an N-terminal peroxidase domain, two central calmodulin-binding EF hands, and a C-terminal superoxide-generating NADPH-oxidase domain; BLI-3 is required for dityrosine cross-linking of collagen, and thus for cuticular integrity; BLI-3 is thought to use cytosolic NADPH to generate reactive oxygen, which then drives the peroxidase ectodomain to cross-link free tyrosine in collagen; BLI-3 is expressed exclusively in hypodermal cells at low levels, with peaks of expression corresponding to collagen/cuticle biosynthesis.
15str-211C02E7.13n/achrV 4,943,703C. elegans STR-211 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16K02F6.6K02F6.6n/achrII 2,530,385contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
17srbc-65Y32B12B.3n/achrV 16,551,603C. elegans SRBC-65 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
18nhr-189F47C10.8n/achrV 3,859,413C. elegans NHR-189 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
19K09D9.12K09D9.12n/achrV 4,003,740
20sri-25C41G6.10n/achrV 15,218,422C. elegans SRI-25 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
21C31H1.7C31H1.7n/achrIV 5,809,426
22F46A8.6F46A8.6n/achrI 11,244,411contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000352916
23srw-14C41G6.8n/achrV 15,226,687C. elegans SRW-14 protein; contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000975 (Interleukin-1)
24C50C3.7C50C3.7n/achrIII 8,160,210contains similarity to Pfam domain PF03372 Endonuclease/Exonuclease/phosphatase family contains similarity to Interpro domains IPR000300 (Inositol polyphosphate related phosphatase), IPR005135 (Endonuclease/exonuclease/phosphatase)
25AH9.1AH9.1n/achrX 2,245,299contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
26C09B9.1C09B9.1n/achrIV 5,039,116
27C26B2.5C26B2.5n/achrIV 8,040,889
28K06H6.5K06H6.5n/achrV 577,400contains similarity to Pfam domain PF04590 Protein of unknown function, DUF595 contains similarity to Interpro domain IPR007669 (Protein of unknown function DUF595)
29F49D11.4F49D11.4n/achrI 10,914,398contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
30fbxa-37ZC47.14n/achrIII 1,286,023This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
31bath-33C08E3.3n/achrII 1,605,408C. elegans BATH-33 protein; contains similarity to Pfam domains PF00917 (MATH domain) , PF00651 (BTB/POZ domain) contains similarity to Interpro domains IPR002083 (MATH), IPR000210 (BTB/POZ-like), IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ)
32C25E10.7C25E10.7n/achrV 9,050,528C25E10.7 encodes a putative secreted TIL-domain protease inhibitor paralogous to SWM-1, ISL-1, and the products of 11 other C. elegans genes; C25E10.7 and its relatives are collectively similar to other TIL-domain protease inhibitors from nematodes, insects, and vertebrates; C25E10.7 has no obvious function in mass RNAi assays.
33nhr-76C05G6.1n/achrIV 630,739C. elegans NHR-76 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
34Y56A3A.16Y56A3A.16n/achrIII 11,912,267contains similarity to Homo sapiens Isoform 1 of Pleckstrin homology domain-containing family M member 3; ENSEMBL:ENSP00000373899
35ZK945.8ZK945.8n/achrII 10,108,812contains similarity to Pfam domain PF07491 Protein phosphatase inhibitor contains similarity to Interpro domain IPR011107 (Protein phosphatase inhibitor)
36R07C3.8R07C3.8n/achrII 914,449
37srh-178ZK228.8n/achrV 18,479,364C. elegans SRH-178 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
38T05H4.3T05H4.3n/achrV 6,444,929contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat contains similarity to Interpro domains IPR001611 (Leucine-rich repeat), IPR003591 (Leucine-rich repeat, typical subtype), IPR003603 (U2A'/phosphoprotein 32 family A, C-terminal)
39T21H3.5T21H3.5n/achrV 1,159,760
40ikb-1C04F12.3n/achrI 9,687,053ikb-1 encodes an ortholog of human BCL3 (OMIM:109560) that physically interacts with the checkpoint protein MRT-2; ikb-1(nr2019) and ikb-1(nr2027) mutants display no obvious phenotype other than shortened lifespan; mutation of BCL3 is frequently associated with recurring translocations found in the neoplastic cells of patients with chronic lymphocytic leukemia, and has been implicated in cell cycle control (perhaps via apoptosis).
41B0034.5B0034.5n/achrII 5,973,873contains similarity to Interpro domain IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
42R07E5.5R07E5.5n/achrIII 4,398,025contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
43acr-3K11G12.7n/achrX 6,711,143acr-3 encodes a non-alpha subunit of the nicotinic acetylcholine receptor (nAChR) superfamily; ACR-3 functions as a ligand-gated ion channel that likely mediates fast actions of acetylcholine at neuromuscular junctions and in the nervous system; when coexpressed with UNC-38, an nAChR alpha subunit, the resulting hetero-oligomer can form levamisole-gated channels; ACR-3 is a member of the UNC-29-like group of nAChR subunits.
44F38C2.1F38C2.1n/achrIV 16,249,570contains similarity to Carnobacterium piscicola ATP-dependent translocator.; TR:Q46317
45F44F1.2F44F1.2n/achrI 13,253,455
46C18D4.3C18D4.3n/achrV 17,532,536contains similarity to Acetobacter diazotrophicus FixX.; TR:Q9FA07
47C26C6.8C26C6.8n/achrI 7,504,574contains similarity to Pfam domains PF07653 (Variant SH3 domain) (3), PF00018 (SH3 domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR001452 (Src homology-3), IPR000108 (Neutrophil cytosol factor 2), IPR011511 (Variant SH3)
48T10E9.5T10E9.5n/achrI 6,522,462
49amt-3M195.3n/achrII 8,366,108amt-3 encodes one of four C. elegans homologs of AMT1 (AT11_ARATH), a high-affinity ammonium transporter from Arabidopsis thaliana; AMT-3 is closely similar to its paralog AMT-2, with somewhat more distant paralogy to AMT-1 and AMT-4.
50C47E8.3C47E8.3n/achrV 14,681,957contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)