UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1hlh-28F31A3.23e-149chrX 17,550,714C. elegans HLH-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
2F14D2.5F14D2.5n/achrII 3,340,796
3str-1C42D4.5n/achrIV 7,174,381C. elegans STR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
4K08D9.2K08D9.2n/achrV 3,228,961contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
5gcy-9ZK455.2n/achrX 11,335,257gcy-9 encodes a membrane guanylyl cyclase; gcy-9 expression is reportedly weak and variable in non-neuronal tissues.
6srh-308F58E10.6n/achrV 14,016,755C. elegans SRH-308 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7M03E7.2M03E7.2n/achrV 5,617,970contains similarity to Plasmodium berghei 58 kDa phosphoprotein (Heat shock-related protein) (HRP).; SW:Q08168
8F56B3.9F56B3.9n/achrIV 772,200
9R17.3R17.3n/achrIII 10,836,977R17.3 encodes an ortholog of human retinal pigment epithelium (RPE)-spondin (RPESP).
10str-113Y39H10B.1n/achrV 3,665,916C. elegans STR-113 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
11evl-20F22B5.1n/achrII 8,444,637evl-20 encodes a functional ortholog of human ADP-ribosylation factor-like protein 2 (ARL2; OMIM:601175), with evl-20(ar103) mutants being rescued by transgenic human ARL2 but not ARL1 or ARL3-7; EVL-20 is required for cortical microtubule formation during cytokinesis and morphogenesis; EVL-20 is required for vulval, gonadal, and male tail development, as well as for embryonic mitosis, hypodermal enclosure, and elongation; EVL-20 is expressed in migrating hypodermal embryonic cells, larval vulval and somatic gonad cells, larval and adult neurons, and adult male proctodeal cells, being subcellularly associated with both the cell cortex and astral microtubules.
12sre-8F40G12.1n/achrV 14,258,150C. elegans SRE-8 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
13srd-29F07C4.3n/achrV 7,636,306C. elegans SRD-29 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
14E04F6.10E04F6.10n/achrII 7,215,446
15srd-3K10B4.5n/achrII 127,822C. elegans SRD-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16F02E11.4F02E11.4n/achrII 3,276,774contains similarity to Interpro domain IPR002625 (Smr protein/MutS2 C-terminal)
17C27F2.5C27F2.5n/achrIII 4,961,124C27F2.5 encodes the C. elegans ortholog of the conserved vacuolar protein sorting protein EAP30/SNF8/VPS22; by homology, the product of C27F2.5 is predicted to be a component of an ESCRT-II complex (Endosomal Sorting Complex Required for Transport) that functions in endosomal transport.
18srg-64ZK678.6n/achrX 15,738,657C. elegans SRG-64 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000609 (Serpentine gamma receptor, Caenorhabditis species)
19F47E1.3F47E1.3n/achrX 9,049,405contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR007086 (Zinc finger, C2H2-subtype), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
20F44E5.2F44E5.2n/achrII 11,770,321contains similarity to Pfam domain PF00560 Leucine Rich Repeat
21C34B2.9C34B2.9n/achrI 10,701,670contains similarity to Interpro domain IPR001904 (Paxillin)
22srh-222F47C12.10n/achrIV 3,980,509C. elegans SRH-222 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
23F40E3.3F40E3.3n/achrI 2,638,982
24C10E2.4C10E2.4n/achrX 16,750,349
25clec-168F38A1.7n/achrIV 1,258,213C. elegans CLEC-168 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
26str-134C05E4.6n/achrV 744,563C. elegans STR-134 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27sri-69Y102A5C.32n/achrV 17,007,786C. elegans SRI-69 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
28rpb-12F23B2.13n/achrIV 9,146,652C. elegans RPB-12 protein; contains similarity to Pfam domain PF03604 DNA directed RNA polymerase, 7 kDa subunit contains similarity to Interpro domain IPR006591 (RNA polymerase Rbp10)
29ZK380.2ZK380.2n/achrX 1,633,167contains similarity to Interpro domain IPR011072 (HR1 rho-binding repeat)
30Y54G11A.11Y54G11A.11n/achrII 14,350,230contains similarity to Pfam domain PF05129 Transcription elongation factor Elf1 like contains similarity to Interpro domain IPR007808 (Protein of unknown function DUF701, zinc-binding putative)
31T02G6.6T02G6.6n/achrI 11,821,054contains similarity to Pfam domain PF07735 F-box associated contains similarity to Interpro domain IPR012885 (F-box associated type 2)
32F58E1.13F58E1.13n/achrII 1,695,343
33srw-1Y75B12B.7n/achrV 15,198,801C. elegans SRW-1 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
34F36A4.11F36A4.11n/achrIV 4,245,281
35C27D6.1C27D6.1n/achrII 5,174,657contains similarity to Interpro domain IPR009057 (Homeodomain-like)
36Y116A8C.25Y116A8C.25n/achrIV 17,076,616contains similarity to Pfam domain PF03881 Fructosamine kinase contains similarity to Interpro domains IPR011009 (Protein kinase-like), IPR005581 (Fructosamine kinase)
37srw-53T05G11.7n/achrV 15,944,112C. elegans SRW-53 protein; contains similarity to Pfam domain PF06976 Protein of unknown function (DUF1300) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR010726 (Protein of unknown function DUF1300)
38athp-1C44B9.4n/achrIII 10,887,899C. elegans ATHP-1 protein; contains similarity to Pfam domains PF02178 (AT hook motif) (2), PF00628 (PHD-finger) contains similarity to Interpro domains IPR008984 (SMAD/FHA domain), IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR000637 (HMG-I and HMG-Y, DNA-binding), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type), IPR000294 (Vitamin K-dependent carboxylation/gamma-carboxyglutamic region), IPR000253 (Forkhead-associated), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
39M01G12.5M01G12.5n/achrI 12,130,715contains similarity to Interpro domain IPR000215 (Protease inhibitor I4, serpin)
40C02F4.5C02F4.5n/achrIV 10,523,762contains similarity to Rattus norvegicus Collagen type XXVII proalpha 1 chain.; TR:Q80ZF0
41Y39E4B.7Y39E4B.7n/achrIII 13,113,204contains similarity to Pfam domain PF01529 (DHHC zinc finger domain)
42K02E7.4K02E7.4n/achrII 1,073,572contains similarity to Pfam domain PF02214 K+ channel tetramerisation domain contains similarity to Interpro domain IPR003131 (Potassium channel, voltage dependent, Kv, tetramerisation)
43F28A10.5F28A10.5n/achrII 850,172contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
44srh-281F11A5.1n/achrV 16,191,496C. elegans SRH-281 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
45Y56A3A.33Y56A3A.33n/achrIII 12,001,104contains similarity to Pfam domain PF00929 Exonuclease contains similarity to Interpro domains IPR013520 (Exonuclease, RNase T and DNA polymerase III), IPR006055 (Exonuclease), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
46T14G10.8T14G10.8n/achrIV 10,146,609contains similarity to Homo sapiens Splice isoform 1 of P08235 Mineralocorticoid receptor; ENSEMBL:ENSP00000281330
47R52.5R52.5n/achrII 2,109,416contains similarity to Pfam domain PF02343 Domain of unknown function DUF130 contains similarity to Interpro domain IPR003326 (Protein of unknown function DUF130)
48F20H11.6F20H11.6n/achrIII 6,599,869
49srx-13C44B12.4n/achrIV 1,116,817C. elegans SRX-13 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
50fip-5F41E7.4n/achrX 10,302,828C. elegans FIP-5 protein; contains similarity to Interpro domain IPR000480 (Glutelin)