UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F28H7.2F28H7.22e-156chrV 10,748,416contains similarity to Pfam domains PF01370 (NAD dependent epimerase/dehydratase family) , PF00106 (short chain dehydrogenase) contains similarity to Interpro domains IPR001509 (NAD-dependent epimerase/dehydratase), IPR003560 (2,3-dihydro-2,3-dihydroxybenzoate dehydrogenase), IPR002347 (Glucose/ribitol dehydrogenase), IPR002198 (Short-chain dehydrogenase/reductase SDR), IPR016040 (NAD(P)-binding)
2clec-19F36H5.6n/achrII 1,744,331C. elegans CLEC-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR002345 (Lipocalin), IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
3srh-257T06E6.6n/achrV 15,409,280C. elegans SRH-257 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR000175 (Sodium:neurotransmitter symporter), IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR013333 (Ryanodine receptor, N-terminal)
4F21F3.3F21F3.3n/achrI 4,902,556contains similarity to Pfam domain PF04140 Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase (ICMT) family contains similarity to Interpro domains IPR007269 (Isoprenylcysteine carboxyl methyltransferase), IPR001958 (Tetracycline resistance protein, TetA)
5K04D7.4K04D7.4n/achrIV 10,189,101contains similarity to Pfam domains PF00047 (Immunoglobulin domain) , PF00041 (Fibronectin type III domain) (3), PF00102 (Protein-tyrosine phosphatase) contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR007110 (Immunoglobulin-like), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase), IPR003599 (Immunoglobulin subtype), IPR003962 (Fibronectin, type III subdomain), IPR013151 (Immunoglobulin)
6C24G7.1C24G7.1n/achrI 4,110,897contains similarity to Pfam domain PF00858 Amiloride-sensitive sodium channel contains similarity to Interpro domain IPR001873 (Na+ channel, amiloride-sensitive)
7F26A1.14F26A1.14n/achrIII 4,849,521contains similarity to Interpro domains IPR003593 (AAA+ ATPase, core), IPR008431 (Cyclic nucleotide phosphodiesterase)
8srz-54Y102A5C.25n/achrV 16,981,243C. elegans SRZ-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
9D1065.3D1065.3n/achrV 4,060,947contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
10sra-27F18C5.1n/achrII 6,569,673C. elegans SRA-27 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domains IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
11R01H10.4R01H10.4n/achrIII 10,255,933contains similarity to Sus scrofa Outer dense fiber protein.; SW:ODFP_PIG
12B0205.10B0205.10n/achrI 10,709,574contains similarity to Interpro domains IPR000893 (Luteovirus ORF6 protein), IPR000694 (Proline-rich region)
13his-58F54E12.4n/achrIV 11,339,852his-58 encodes an H2B histone.
14R107.2R107.2n/achrIII 9,044,850contains similarity to Pfam domain PF01256 Carbohydrate kinase contains similarity to Interpro domain IPR000631 (Carbohydrate kinase)
15str-109F10A3.5n/achrV 16,161,427C. elegans STR-109 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16F53A9.5F53A9.5n/achrX 8,699,785contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
17W02H3.1W02H3.1n/achrX 11,104,112contains similarity to Bacillus halodurans Myo-inositol 2-dehydrogenase.; TR:Q9KAH1
18C01B4.6C01B4.6n/achrV 2,501,738contains similarity to Pfam domain PF01263 Aldose 1-epimerase contains similarity to Interpro domains IPR008183 (Aldose 1-epimerase), IPR015443 (Aldose-1-epimerase), IPR011013 (Glycoside hydrolase-type carbohydrate-binding), IPR014718 (Glycoside hydrolase-type carbohydrate-binding, subgroup)
19C33A11.2C33A11.2n/achrX 15,367,917contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG4025-PA;; FLYBASE:CG4025
20gcy-37C54E4.3n/achrIV 2,154,905gcy-37 encodes a predicted soluble guanylyl cyclase that is expressed in four candidate sensory neurons connected to the pseudocoelom, URXL, URXR, AQR, and PQR; as loss of gcy-37 activity via RNA-mediated interference does not result in any abnormalities, the precise role of GCY-37 in C. elegans development and/or behavior is not yet known; GCY-37 expression in neurons connected to the pseudocoelom suggests, however, that GCY-37 may play a role in fluid homeostasis.
21W10D9.2W10D9.2n/achrII 451,150This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins.
22Y48A6B.9Y48A6B.9n/achrIII 11,034,508contains similarity to Pfam domain PF08240 Alcohol dehydrogenase GroES-like domain contains similarity to Interpro domains IPR011032 (GroES-like), IPR013154 (Alcohol dehydrogenase GroES-like), IPR002085 (Alcohol dehydrogenase superfamily, zinc-containing), IPR016040 (NAD(P)-binding)
23str-257C01B4.1n/achrV 2,519,650C. elegans STR-257 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24Y4C6B.5Y4C6B.5n/achrIV 5,322,131contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
25clec-122Y25C1A.3n/achrII 3,107,043C. elegans CLEC-122 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000104 (Antifreeze protein, type I), IPR003983 (Leukotriene B4 type 1 receptor), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
26M70.5M70.5n/achrIV 2,270,286contains similarity to Pfam domain PF01436 NHL repeat contains similarity to Interpro domains IPR011042 (Six-bladed beta-propeller, TolB-like), IPR001258 (NHL repeat)
27C40A11.8C40A11.8n/achrII 2,150,922
28F59B2.11F59B2.11n/achrIII 9,014,893contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein; VG:OTTHUMP00000025312
29K09E3.5K09E3.5n/achrX 17,109,938contains similarity to Pfam domain PF03353 DUF278 contains similarity to Interpro domain IPR005020 (Protein of unknown function DUF278)
30T20H12.1T20H12.1n/achrII 3,950,365
31sptf-2T22C8.5n/achrII 8,626,542C. elegans SPTF-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF00096 Zinc finger, C2H2 type contains similarity to Interpro domains IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like), IPR013087 (Zinc finger, C2H2-type/integrase, DNA-binding), IPR003656 (Zinc finger, BED-type predicted), IPR007087 (Zinc finger, C2H2-type)
32set-5C47E8.8n/achrV 14,702,283set-5 encodes a large (1,675-residue) protein with an N-terminal SET domain and a C-terminal SPK domain; SET-5 has no non-nematode orthologs, but is paralogous to Y57A10A.1; SET-5's domain organization resembles that of SET-24; neither set-5(ok1568) nor set-5(RNAi) have any obvious phenotypes.
33Y39E4B.11Y39E4B.11n/achrIII 13,206,068
34T28A11.6T28A11.6n/achrV 3,262,901
35pptr-1W08G11.4n/achrV 16,362,503C. elegans PPTR-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF01603 Protein phosphatase 2A regulatory B subunit (B56 family) contains similarity to Interpro domains IPR002554 (Protein phosphatase 2A, regulatory B subunit, B56), IPR016024 (Armadillo-type fold)
36T23G11.1T23G11.1n/achrI 7,701,721contains similarity to Plasmodium falciparum Hypothetical protein.; TR:Q8I452
37C02B10.6C02B10.6n/achrIV 5,071,570contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
38F28B1.5F28B1.5n/achrV 17,058,496
39clec-92Y52B11A.5n/achrI 11,016,484C. elegans CLEC-92 protein; contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
40srd-46F17A2.10n/achrX 12,332,621C. elegans SRD-46 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
41R03H4.1R03H4.1n/achrV 9,018,100contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
42M01G5.3M01G5.3n/achrIII 1,513,690contains similarity to Pfam domain PF07851 TMPIT-like protein contains similarity to Interpro domain IPR012926 (TMPIT-like)
43F28C6.5F28C6.5n/achrII 8,599,990contains similarity to Mus musculus Activity-dependent neuroprotector (Activity-dependent neuroprotectivesprotein).; SW:ADNP_MOUSE
44T07D3.2T07D3.2n/achrII 902,779contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
45scl-20ZK384.2n/achrV 18,733,634C. elegans SCL-20 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR002413 (Ves allergen), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
46srw-143H27D07.3n/achrV 2,940,553C. elegans SRW-143 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
47ZK524.4ZK524.4n/achrI 7,463,889contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
48ceh-27F46F3.1n/achrV 11,663,161ceh-27 encodes a homeodomain protein of the NK-2 class that contains Drosophila scarecrow and human NKX-2 (OMIM:606727); CEH-27 activity is essential for embryogenesis and appears to be required for maintaining hypodermal integrity during movement as embryos lacking CEH-27 burst at a breach in the ventral hypodermis upon commencement of muscle contractions; CEH-27 expression is first detected in the ~100-cell embryo in what appear to be MS-derived cells while in later embryos expression is seen in a number of cells in the anterior head region.
49srbc-41F16B4.10n/achrV 1,613,815C. elegans SRBC-41 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR000832 (GPCR, family 2, secretin-like)
50T10B9.9T10B9.9n/achrII 9,775,421contains similarity to Avian adenovirus gal1 Orf2 protein.; TR:Q64786