UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F28E10.4F28E10.45e-161chrIV 4,566,721contains similarity to Interpro domain IPR000839 (Porin, Oms28 type)
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3fbxa-32ZC47.6n/achrIII 1,268,313This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
4K05G3.1K05G3.1n/achrX 16,501,554contains similarity to Pfam domain PF01612 3'-5' exonuclease contains similarity to Interpro domain IPR002562 (3'-5' exonuclease)
5K06A1.3K06A1.3n/achrII 6,442,625contains similarity to Pfam domain PF00100 Zona pellucida-like domain contains similarity to Interpro domain IPR001507 (Endoglin/CD105 antigen)
6srab-22T20D4.2n/achrV 3,427,052C. elegans SRAB-22 protein ;
7T03F7.5T03F7.5n/achrV 11,297,691contains similarity to Staphylococcus aureus YdbT-like protein.; TR:Q8GPI5
8F36H12.15F36H12.15n/achrIV 5,268,338
9twk-30F36A2.4n/achrI 8,810,320C. elegans TWK-30 protein; contains similarity to Pfam domains PF00041 (Fibronectin type III domain) (2), PF07885 (Ion channel) (2)contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR008957 (Fibronectin, type III-like fold), IPR003961 (Fibronectin, type III), IPR003938 (Potassium channel, voltage-dependent, EAG/ELK/ERG), IPR003962 (Fibronectin, type III subdomain), IPR013099 (Ion transport 2)
10F41E6.9F41E6.9n/achrV 8,605,583contains similarity to Pfam domain PF03357 Snf7 contains similarity to Interpro domain IPR005024 (Snf7)
11F35E12.8F35E12.8n/achrV 13,750,531contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR003366 (CUB-like region)
12T22D1.11T22D1.11n/achrIV 6,927,277contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
13F57G4.9F57G4.9n/achrV 17,644,291contains similarity to Xenopus laevis Putative uncharacterized protein.; TR:Q08AY0
14srh-213T22F3.5n/achrV 3,593,857C. elegans SRH-213 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
15T22D1.1T22D1.1n/achrIV 6,924,455contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR008167 (Protein of unknown function DUF23, C-terminal), IPR001711 (Phospholipase C, phosphatidylinositol-specific, Y domain), IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
16C56A3.3C56A3.3n/achrV 13,533,300C56A3.3 encodes a homolog of the functionally active Fmrf Receptor (FR; CG2114) of D. melanogaster; it is thus possible that C56A3.3 is a receptor for one of the FMRF-like neurotransmitters in C. elegans (e.g., FLP-1 through FLP-12).
17K06H6.2K06H6.2n/achrV 586,550contains similarity to Pfam domain PF05050 Protein of unknown function (DUF672) contains similarity to Interpro domain IPR007744 (Protein of unknown function DUF672)
18sra-32B0304.5n/achrII 4,530,916C. elegans SRA-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
19T22C8.2T22C8.2n/achrII 8,616,005contains similarity to Pfam domain PF01630 Hyaluronidase contains similarity to Interpro domains IPR013785 (Aldolase-type TIM barrel), IPR001968 (Glycoside hydrolase, family 56), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR013032 (EGF-like region, conserved site), IPR017430 (Glycoside hydrolase,family 56,Hyaluronidase), IPR001329 (Glycoside hydrolase, family 56, allergen Api/Dol m 2)
20F32H2.8F32H2.8n/achrI 8,992,131contains similarity to Pfam domain PF03314 Protein of unknown function, DUF273 contains similarity to Interpro domains IPR004988 (Protein of unknown function DUF273), IPR002229 (Blood group Rhesus C/E and D polypeptide)
21srh-279F11A5.2n/achrV 16,193,941C. elegans SRH-279 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22R09D1.13R09D1.13n/achrII 9,444,567contains similarity to Pfam domains PF07714 (Protein tyrosine kinase) , PF00069 (Protein kinase domain) contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
23srt-19F47D2.1n/achrV 4,286,112C. elegans SRT-19 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR002651 (Protein of unknown function DUF32), IPR002232 (5-Hydroxytryptamine 6 receptor)
24K10D11.4K10D11.4n/achrIV 12,993,278contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
25C25F9.5C25F9.5n/achrV 19,409,124contains similarity to Pfam domain PF00176 SNF2 family N-terminal domain contains similarity to Interpro domain IPR000330 (SNF2-related)
26str-33C24B9.1n/achrV 2,729,388C. elegans STR-33 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
27sur-6F26E4.1n/achrI 9,756,000C. elegans SUR-6 protein; contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR000009 (Protein phosphatase 2A, regulatory subunit PR55), IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
28B0041.5B0041.5n/achrI 4,649,524contains similarity to Interpro domain IPR010916 (TonB box, conserved site)
29F59A3.7F59A3.7n/achrI 5,517,931
30R06F6.6R06F6.6n/achrII 10,807,531contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR013847 (POU), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
31C14A11.5C14A11.5n/achrX 2,806,295
32cyp-13A1T10B9.8n/achrII 9,780,487C. elegans CYP-13A1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002402 (Cytochrome P450, E-class, group II), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV)
33E03H4.12E03H4.12n/achrI 12,436,494contains similarity to Pfam domain PF03360 Glycosyltransferase family 43 contains similarity to Interpro domain IPR005027 (Glycosyl transferase, family 43)
34nhr-247ZK1037.5n/achrV 15,324,578C. elegans NHR-247 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
35nhr-164C41G6.5n/achrV 15,234,803C. elegans NHR-164 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
36Y65A5A.2Y65A5A.2n/achrIV 16,413,511contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Required for invasion and pseudohyphae formation in response to nitrogen starvation; SGD:YIR019C
37F20B4.3F20B4.3n/achrX 17,706,033
38phy-3T20B3.7n/achrV 16,836,164C. elegans PHY-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF03171 2OG-Fe(II) oxygenase superfamily contains similarity to Interpro domains IPR006620 (Prolyl 4-hydroxylase, alpha subunit), IPR017853 (Glycoside hydrolase, catalytic core), IPR005123 (2OG-Fe(II) oxygenase)
39C33H5.16C33H5.16n/achrIV 7,802,511contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
40gpa-15M04C7.1n/achrI 8,533,150gpa-15 encodes a member of the G protein alpha subunit family of heterotrimeric GTPases; it is expressed in ADL, ASH, ASK, PHA, PHB, the distal tip cell, the anchor cell, and many male-specific neurons.
41Y57A10C.10Y57A10C.10n/achrII 12,440,350contains similarity to Pfam domain PF01838 (Domain of unknown function DUF40)
42fbxa-218Y49E10.17n/achrIII 12,438,684C. elegans FBXA-218 protein; contains similarity to Pfam domain PF01827 FTH domain contains similarity to Interpro domain IPR002900 (Protein of unknown function DUF38, Caenorhabditis species)
43lgc-23C15A7.1n/achrX 12,066,273C. elegans LGC-23 protein; contains similarity to Pfam domain PF02931 Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain contains similarity to Interpro domains IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
44ubc-17B0403.2n/achrX 7,052,951C. elegans UBC-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF00179 Ubiquitin-conjugating enzyme contains similarity to Interpro domains IPR016135 (Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like), IPR000608 (Ubiquitin-conjugating enzyme, E2)
45C50C3.2C50C3.2n/achrIII 8,185,577contains similarity to Pfam domains PF00435 (Spectrin repeat) (4), PF00036 (EF hand) contains similarity to Interpro domains IPR002017 (Spectrin repeat), IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand)
46C01G6.7C01G6.7n/achrII 9,292,949contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
47sra-4AH6.8n/achrII 9,542,193C. elegans SRA-4 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
48C26E1.3C26E1.3n/achrV 13,303,181contains similarity to Interpro domains IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
49C38C6.5C38C6.5n/achrII 14,631,497contains similarity to Interpro domain IPR001574 (Ribosome-inactivating protein)
50F49F1.8F49F1.8n/achrIV 4,132,560contains similarity to Pfam domain PF00098 Zinc knuckle contains similarity to Interpro domains IPR013084 (Zinc finger, CCHC retroviral-type), IPR001878 (Zinc finger, CCHC-type)