UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1thn-3F28D1.45e-143chrIV 12,381,933C. elegans THN-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00314 Thaumatin family contains similarity to Interpro domain IPR001938 (Thaumatin, pathogenesis-related)
2nhr-79T26H2.9n/achrV 19,209,750C. elegans NHR-79 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001723 (Steroid hormone receptor), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
3srg-53T02B11.1n/achrV 880,685C. elegans SRG-53 protein ;
4T11F8.4T11F8.4n/achrIV 5,475,352contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR000209 (Peptidase S8 and S53, subtilisin, kexin, sedolisin), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
5B0496.6B0496.6n/achrIV 7,419,545contains similarity to Pfam domain PF03134 TB2/DP1, HVA22 family contains similarity to Interpro domain IPR004345 (TB2/DP1 and HVA22 related protein)
6sri-21T24A6.4n/achrV 3,550,559C. elegans SRI-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
7scl-26C50E3.10n/achrV 7,601,057C. elegans SCL-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
8ugt-55T04H1.7n/achrV 12,257,184C. elegans UGT-55 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
9srab-21T20D4.18n/achrV 3,423,693C. elegans SRAB-21 protein; contains similarity to Pfam domain PF02117 C.elegans Sra family integral membrane protein contains similarity to Interpro domain IPR000344 (Nematode chemoreceptor, Sra)
10nhr-214T07C5.3n/achrX 12,701,293C. elegans NHR-214 protein; contains similarity to Pfam domain PF00104 Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
11K02B2.6K02B2.6n/achrIV 5,961,963
12B0554.7B0554.7n/achrV 439,300contains similarity to Pfam domains PF07690 (Major Facilitator Superfamily) , PF05978 (Eukaryotic protein of unknown function (DUF895)) contains similarity to Interpro domains IPR010291 (Protein of unknown function DUF895, eukaryotic), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
13E01B7.1E01B7.1n/achrV 17,926,717contains similarity to Interpro domains IPR001763 (Rhodanese-like), IPR000694 (Proline-rich region)
14B0336.3B0336.3n/achrIII 5,713,118contains similarity to Pfam domain PF00642 Zinc finger C-x8-C-x5-C-x3-H type (and similar) contains similarity to Interpro domains IPR000571 (Zinc finger, CCCH-type), IPR000694 (Proline-rich region), IPR000504 (RNA recognition motif, RNP-1), IPR012677 (Nucleotide-binding, alpha-beta plait), IPR001984 (Peptidase S16, Lon protease)
15clec-147C04H5.2n/achrII 14,536,651C. elegans CLEC-147 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
16F09C12.2F09C12.2n/achrII 5,111,113F09C12.2 encodes a kinase most closely related to mitogen-activated protein (MAP) kinases; as loss of F09C12.2 activity via mutation or large-scale RNAi results in no obvious defects, the precise role of F09C12.2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
17F46B3.16F46B3.16n/achrV 20,630,275
18F10C2.7F10C2.7n/achrV 12,055,113contains similarity to Pfam domain PF07690 Major Facilitator Superfamily contains similarity to Interpro domains IPR007114 (Major facilitator superfamily), IPR011701 (Major facilitator superfamily MFS-1), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
19srh-214T20B3.4n/achrV 16,828,966C. elegans SRH-214 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
20C07D8.3C07D8.3n/achrX 7,361,807
21C09D4.6C09D4.6n/achrI 5,486,821
22dsl-5F58B3.8n/achrIV 11,620,190dsl-5 encodes a putative secreted protein with single DSL and EGF domains in series, somewhat like Delta/LAG-2; DSL-5 belongs to a nematode-specific family of Delta/LAG-2-like proteins that includes DSL-1, -2, -3, -5, -6, and -7.
23Y54E2A.4Y54E2A.4n/achrII 14,754,890contains similarity to Archaeoglobus fulgidus NADH oxidase (NOXA-3).; TR:O29847
24C14C6.6C14C6.6n/achrV 546,947contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
25C50H2.6C50H2.6n/achrV 9,921,737contains similarity to Pfam domain PF00501 AMP-binding enzyme contains similarity to Interpro domain IPR000873 (AMP-dependent synthetase and ligase)
26Y57G11C.8Y57G11C.8n/achrIV 14,782,524contains similarity to Homo sapiens Hypothetical protein; ENSEMBL:ENSP00000302919
27twk-40T28A8.1n/achrIII 13,487,791C. elegans TWK-40 protein; contains similarity to Pfam domain PF07885 Ion channel contains similarity to Interpro domains IPR003280 (Potassium channel, two pore-domain), IPR003938 (Potassium channel, voltage-dependent, EAG/ELK/ERG), IPR013099 (Ion transport 2), IPR003092 (Potassium channel, two pore-domain, TASK)
28gly-14M01F1.1n/achrIII 3,491,809gly-14 encodes a UDP-N-acetyl-D-glucosamine:alpha-3-D-mannoside beta-1, 2-N-acetylglucosaminyltransferase I (GnT 1); GLY-14 exhibits GnT 1 activity when assayed in vitro; a gly-14::lacZ reporter construct is expressed only in the intestine throughout larval and adult stages, with expression generally restricted to the anterior and posterior gut cells.
29F32B5.3F32B5.3n/achrI 2,693,421contains similarity to Pfam domain PF03269 Caenorhabditis protein of unknown function, DUF268 contains similarity to Interpro domains IPR004951 (Protein of unknown function DUF268, Caenorhabditis species), IPR003968 (Potassium channel, voltage dependent, Kv)
30str-124T22H6.3n/achrX 12,788,379C. elegans STR-124 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
31cyp-33C3F41B5.4n/achrV 2,243,821C. elegans CYP-33C3 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
32M151.2M151.2n/achrII 3,632,782contains similarity to Interpro domain IPR000533 (Tropomyosin)
33T05A10.6T05A10.6n/achrX 10,793,737contains similarity to Interpro domain IPR014044 (SCP-like extracellular)
34F11G11.13F11G11.13n/achrII 4,875,478contains similarity to Pfam domain PF00217 ATP:guanido phosphotransferase, C-terminal catalytic domain contains similarity to Interpro domains IPR000749 (ATP:guanido phosphotransferase), IPR014746 (Glutamine synthetase/guanido kinase, catalytic region)
35clec-190M199.4n/achrIV 15,125,488C. elegans CLEC-190 protein; contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR001304 (C-type lectin)
36clec-46F07C4.9n/achrV 7,637,516C. elegans CLEC-46 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
37fbxa-165C08E3.8n/achrII 1,615,632This gene encodes a protein containing an F-box, a motif predicted to mediate protein-protein interactions either with homologs of yeast Skp-1p or with other proteins; this gene's encoded protein also contains an FTH/DUF38 motif, which may also mediate protein-protein interaction.
38sulp-2F14D12.5n/achrX 5,597,522sulp-2 encodes one of eight C. elegans members of the sulfate permease family of anion transporters; by homology, SULP-2 is predicted to function as an anion transporter that regulates cellular pH and volume via transmembrane movement of electrolytes and fluids and when expressed in Xenopus oocytes, SULP-2 does exhibit modest uptake of sulfate; a SULP-2::GFP fusion is expressed in the intestine and rectal gland cells, where it localizes to the basolateral membrane and in cephalic and deirid neurons, where it localizes to sensillar endings.
39C25E10.7C25E10.7n/achrV 9,050,528C25E10.7 encodes a putative secreted TIL-domain protease inhibitor paralogous to SWM-1, ISL-1, and the products of 11 other C. elegans genes; C25E10.7 and its relatives are collectively similar to other TIL-domain protease inhibitors from nematodes, insects, and vertebrates; C25E10.7 has no obvious function in mass RNAi assays.
40F58E2.5F58E2.5n/achrIV 3,445,718contains similarity to Pfam domain PF00188 SCP-like extracellular protein contains similarity to Interpro domains IPR014044 (SCP-like extracellular), IPR001283 (Allergen V5/Tpx-1 related)
41E03H4.11E03H4.11n/achrI 12,433,962contains similarity to Pfam domain PF01762 Galactosyltransferase contains similarity to Interpro domain IPR002659 (Glycosyl transferase, family 31)
42T24H10.5T24H10.5n/achrII 9,103,999contains similarity to Arthrobacter sp C2-2 Putative histidine kinase.; TR:Q8KRF2
43C49D10.7C49D10.7n/achrII 3,856,247contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domain IPR002656 (Acyltransferase 3)
44F31D5.4F31D5.4n/achrII 4,179,466contains similarity to Pfam domain PF01825 Latrophilin/CL-1-like GPS domain contains similarity to Interpro domain IPR000203 (GPS)
45lgc-51F12B6.3n/achrI 2,244,756C. elegans LGC-51 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR002289 (Gamma-aminobutyric-acid A receptor, beta subunit), IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
46sri-54T10D4.8n/achrII 3,136,737C. elegans SRI-54 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001411 (Tetracycline resistance protein, TetB)
47clec-163Y39A1B.1n/achrIII 10,795,241C. elegans CLEC-163 protein; contains similarity to Pfam domains PF00092 (von Willebrand factor type A domain) , PF00059 (Lectin C-type domain) contains similarity to Interpro domains IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin), IPR002035 (von Willebrand factor, type A)
48C09B9.1C09B9.1n/achrIV 5,039,116
49F18E3.10F18E3.10n/achrV 7,424,056contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
50gld-1T23G11.3n/achrI 7,696,949gld-1 encodes a protein containing a K homology RNA binding domain that is required for meiotic cell cycle progression during oogenesis in parallel with gld-2, and also affects spermatogenesis; it physically interacts with its putative mRNA targets in vitro and with FOG-2, and is expressed in the cytoplasm at high levels during meiotic prophase.