UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F28C6.1F28C6.10chrII 8,591,963F28C6.1 encodes an AP-2-like transcription factor that is ~60% identical to that of F28C6.2 which lies immediately adjacent to F28C6.1 on chromosome II; loss of F28C6.1 activity via large-scale RNAi experiments results in embryonic and larval lethality.
2K03A11.1K03A11.1n/achrX 13,053,489contains similarity to Interpro domain IPR001130 (Deoxyribonuclease, TatD-related)
3K09E3.6K09E3.6n/achrX 17,114,487contains similarity to Pfam domain PF03353 DUF278 contains similarity to Interpro domain IPR005020 (Protein of unknown function DUF278)
4ZK112.4ZK112.4n/achrIII 7,729,788
5E01G6.3E01G6.3n/achrX 12,243,099contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domains IPR002018 (Carboxylesterase, type B), IPR016196 (MFS general substrate transporter)
6nhr-231Y17D7B.1n/achrV 18,792,886C. elegans NHR-231 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
7F39G3.2F39G3.2n/achrV 4,739,477contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
8K09F6.5K09F6.5n/achrII 2,272,724contains similarity to Interpro domain IPR000358 (Ribonucleotide reductase)
9T28F2.1T28F2.1n/achrI 3,640,560contains similarity to Pfam domain PF01531 Glycosyl transferase family 11 contains similarity to Interpro domain IPR002516 (Glycosyl transferase, family 11)
10C26B9.6C26B9.6n/achrX 5,334,221contains similarity to Pfam domains PF00097 (Zinc finger, C3HC4 type (RING finger)) , PF02825 (WWE domain) (2)contains similarity to Interpro domains IPR001841 (Zinc finger, RING-type), IPR004170 (WWE), IPR013083 (Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type)
11sdz-31T11A5.5n/achrV 9,880,568C. elegans SDZ-31 protein; contains similarity to Interpro domains IPR001376 (Gliadin, alpha/beta), IPR000896 (Hemocyanin, copper-containing)
12Y54E2A.12Y54E2A.12n/achrII 14,799,590contains similarity to Interpro domain IPR000195 (RabGAP/TBC)
13F26F2.5F26F2.5n/achrV 20,569,246contains similarity to Homo sapiens zinc finger protein 318; ENSEMBL:ENSP00000302698
14srt-17F48G7.6n/achrV 624,474C. elegans SRT-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
15F11E6.7F11E6.7n/achrIV 17,459,510contains similarity to Trichomonas vaginalis G3 Flocculin, putative.; TR:A2FIF9
16hst-2C34F6.4n/achrX 11,205,546hst-2 encodes the C. elegans ortholog of the heparan sulfate modifying enzyme 2O-sulfotransferase; by homology, HST-2 is predicted to function in heparan sulfate biosynthesis by catalyzing the chain-modifying sulfation of the C2 hydroxyl group of hexuronic acid; during development, hst-2 activity is required for normal body size, cell migration, and nervous system development; an hst-2::gfp reporter fusion is first expressed in embryos, continuing on through adulthood; expression is detected in many tissues, including the pharynx, hypodermis, muscles, vulva, and distal tip cells (DTCs) of the somatic gonad.
17str-228C07G3.5n/achrV 3,511,106C. elegans STR-228 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
18rab-10T23H2.5n/achrI 6,457,920rab-10 encodes a Rab-like GTPase that is a member of the Ras superfamily of small GTPases; rab-10 activity is required, upstream of rme-1, for basolateral endocytic recycling in the intestine, but not in oocytes or coelomocytes; a RAB-10::GFP fusion protein is widely expressed and in the intestine, localizes to endosomes and the Golgi.
19B0454.5B0454.5n/achrII 3,039,835contains similarity to Homo sapiens 21 kDa protein; VG:OTTHUMP00000165983
20math-30F52C6.5n/achrII 1,908,950C. elegans MATH-30 protein; contains similarity to Pfam domain PF00917 MATH domain contains similarity to Interpro domains IPR008974 (TRAF-like), IPR002083 (MATH)
21K08D9.2K08D9.2n/achrV 3,228,961contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
22F36D3.1F36D3.1n/achrV 16,501,082contains similarity to Interpro domain IPR008928 ()
23ZK563.5ZK563.5n/achrX 3,378,206contains similarity to Aedes aegypti Putative uncharacterized protein.; TR:Q17A46
24mdt-31F32H2.2n/achrI 8,966,630C. elegans MDT-31 protein; contains similarity to Pfam domain PF05669 SOH1 contains similarity to Interpro domain IPR008831 (SOH1)
25F58E1.11F58E1.11n/achrII 1,692,234contains similarity to Interpro domain IPR002034 (Alpha-isopropylmalate/homocitrate synthase, conserved site)
26pqn-29F10F2.9n/achrIII 4,645,137The protein product of this gene is predicted to contain a glutamine/asparagine (Q/N)-rich ('prion') domain, by the algorithm of Michelitsch and Weissman (as of the WS77 release of WormBase, i.e., in wormpep77).
27hlh-28F31A3.2n/achrX 17,550,714C. elegans HLH-28 protein; contains similarity to Pfam domain PF00010 Helix-loop-helix DNA-binding domain contains similarity to Interpro domains IPR001092 (Basic helix-loop-helix dimerisation region bHLH), IPR011598 (Helix-loop-helix DNA-binding)
28Y54G9A.5Y54G9A.5n/achrII 13,723,894
29srw-97ZC204.15n/achrII 1,668,270C. elegans SRW-97 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
30C04E12.10C04E12.10n/achrV 3,379,728contains similarity to Pfam domain PF04721 Domain of unknown function (DUF750) contains similarity to Interpro domain IPR006588 (Protein of unknown function PAW)
31C06E1.11C06E1.11n/achrIII 8,615,394
32F26A1.9F26A1.9n/achrIII 4,825,812
33E03H12.9E03H12.9n/achrIV 4,990,834contains similarity to Pfam domain PF08277 PAN-like domain contains similarity to Interpro domain IPR006583 (CW)
34str-255C45H4.15n/achrV 2,162,667C. elegans STR-255 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR000301 (CD9/CD37/CD63 antigen)
35hpr-17F32A11.2n/achrII 13,155,162C. elegans HPR-17 protein; contains similarity to Pfam domain PF03215 Rad17 cell cycle checkpoint protein contains similarity to Interpro domains IPR004582 (Checkpoint protein Rad24), IPR003593 (AAA+ ATPase, core)
36ugt-32F47C10.6n/achrV 3,842,918C. elegans UGT-32 protein; contains similarity to Pfam domain PF00201 UDP-glucoronosyl and UDP-glucosyl transferase contains similarity to Interpro domain IPR002213 (UDP-glucuronosyl/UDP-glucosyltransferase)
37F36F12.4F36F12.4n/achrV 2,089,002contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
38K08H10.9K08H10.9n/achrV 9,992,294contains similarity to Pfam domain PF04051 Transport protein particle (TRAPP) component, Bet3 contains similarity to Interpro domain IPR007194 (Transport protein particle (TRAPP) component, Bet3)
39M03E7.2M03E7.2n/achrV 5,617,970contains similarity to Plasmodium berghei 58 kDa phosphoprotein (Heat shock-related protein) (HRP).; SW:Q08168
40str-154Y45G12C.12n/achrV 2,559,268C. elegans STR-154 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001046 (Natural resistance-associated macrophage protein), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
41C18E3.5C18E3.5n/achrI 4,198,275contains similarity to Pfam domain PF00400 WD domain, G-beta repeat contains similarity to Interpro domains IPR011046 (WD40 repeat-like), IPR001680 (WD40 repeat), IPR001632 (G-protein, beta subunit), IPR015943 (WD40/YVTN repeat-like)
42C48B4.8C48B4.8n/achrIII 9,560,470contains similarity to Bacillus subtilis Hypothetical protein ywcE precursor.; SW:YWCE_BACSU
43sdz-1B0303.8n/achrIII 8,699,816C. elegans SDZ-1 protein ;
44F56B3.9F56B3.9n/achrIV 772,200
45acc-3F55D10.5n/achrX 4,725,216C. elegans ACC-3 protein; contains similarity to Pfam domains PF02931 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand binding domain) , PF02932 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region) contains similarity to Interpro domains IPR001390 (Gamma-aminobutyric-acid A receptor, alpha subunit), IPR006028 (Gamma-aminobutyric acid A receptor), IPR006201 (Neurotransmitter-gated ion-channel), IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding), IPR006029 (Neurotransmitter-gated ion-channel transmembrane region)
46B0238.7B0238.7n/achrV 5,261,699contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
47C14C6.3C14C6.3n/achrV 544,415
48C44C10.7C44C10.7n/achrX 11,687,559contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
49stdh-4F25G6.5n/achrV 8,550,589stdh-4 encodes a putative steroid dehydrogenase expressed in larval and adult pharynx; STDH-4 is orthologous to human HSD17B3 (OMIM:605573, mutated in pseudohermaphroditism), HSD17B12 (OMIM:609574), and HSDL1, and paralogous to LET-767 and STDH-1/-3; STDH-4 has no obvious function in mass RNAi assays.
50T05A8.7T05A8.7n/achrII 2,741,328