UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1grl-12F28A12.24e-83chrV 8,636,381grl-12 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
2srh-278T09F5.8n/achrV 15,171,028C. elegans SRH-278 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
3F27E5.5F27E5.5n/achrII 10,129,961contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
4F08D12.4F08D12.4n/achrII 2,778,750contains similarity to Interpro domain IPR016187 (C-type lectin fold)
5str-37C50B6.12n/achrV 13,328,296C. elegans STR-37 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
6ztf-9ZK287.6n/achrV 9,691,558C. elegans ZTF-9 protein; contains similarity to Interpro domain IPR015880 (Zinc finger, C2H2-like)
7C50F7.6C50F7.6n/achrIV 7,721,871contains similarity to Homo sapiens Isoform 4 of PDZ domain-containing RING finger protein 4; ENSEMBL:ENSP00000370169
8F45G2.7F45G2.7n/achrIII 13,433,876contains similarity to Oceanobacillus iheyensis Two-component response regulator involved in modulation ofsflagellar.; TR:Q8EQW9
9ZC477.4ZC477.4n/achrIV 7,098,647
10flh-2C26E6.2n/achrIII 4,953,580C. elegans FLH-2 protein; contains similarity to Pfam domain PF04500 FLYWCH zinc finger domain contains similarity to Interpro domain IPR007588 (Zinc finger, FLYWCH-type)
11F26F2.3F26F2.3n/achrV 20,561,363contains similarity to Saccharomyces cerevisiae Profilin synthetic lethal protein, has region of coiled-coil structure; subunit of the Exocyst complex--the Exocyst complex contains the gene products encoded by SEC3, SEC5, SEC6, SEC8, SEC10, SEC15 and EXO70 and is required for exocytosis; SGD:YER008C
12B0238.7B0238.7n/achrV 5,261,699contains similarity to Pfam domain PF00135 Carboxylesterase contains similarity to Interpro domain IPR002018 (Carboxylesterase, type B)
13srh-3K04F1.5n/achrV 1,683,835C. elegans SRH-3 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domains IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1), IPR001024 (Lipoxygenase, LH2)
14ZK380.4ZK380.4n/achrX 1,652,654
15srh-206Y102A5C.15n/achrV 16,954,279C. elegans SRH-206 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
16R09H3.1R09H3.1n/achrX 1,660,650contains similarity to Sulfolobus solfataricus DNA double-strand break repair rad50 ATPase.; SW:Q97WH0
17M01E5.1M01E5.1n/achrI 13,275,251contains similarity to Ichthyophthirius multifiliis Immobilization antigen isoform.; TR:Q9BMH3
18T19D2.3T19D2.3n/achrX 3,939,726
19M04D8.4M04D8.4n/achrIII 10,030,454contains similarity to Clostridium perfringens Hypothetical protein CPE0262.; TR:Q8XNS0
20F36F12.4F36F12.4n/achrV 2,089,002contains similarity to Pfam domain PF01697 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domain IPR008166 (Protein of unknown function DUF23)
21K07G6.1K07G6.1n/achrII 1,741,871
22ZK688.1ZK688.1n/achrIII 7,910,130
23srh-207ZK262.1n/achrV 18,409,607C. elegans SRH-207 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
24srh-104F21H7.7n/achrV 16,243,471C. elegans SRH-104 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
25sre-7K02E11.2n/achrV 14,245,132C. elegans SRE-7 protein; contains similarity to Pfam domain PF03125 C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR004151 (C. elegans Sre G protein-coupled chemoreceptor)
26scrm-3C04E12.7n/achrV 3,356,584scrm-3 encodes a putative phospholipid scramblase homologous to human PLSCR1-5, and paralogous to other C. elegans SCRMs (e.g., SCRM-1); SCRM-3 is expressed in neurons, anal depressor muscle, and occasionally in body wall muscle cells; however, in apoptotic germline cells, SCRM-3 is fully dispensable for normally rapid engulfment and largely dispensable for phosphatidylserine exposure; SCRM-3 does not bind WAH-1 in vitro, and scrm-3(tm631) mutants have no obvious phenotype.
27C54G10.1C54G10.1n/achrV 14,641,219contains similarity to Homo sapiens similar to secreted gel-forming mucin; ENSEMBL:ENSP00000328427
28Y41C4A.9Y41C4A.9n/achrIII 11,714,688contains similarity to Pfam domain PF06862 Protein of unknown function (DUF1253) contains similarity to Interpro domain IPR010678 (Protein of unknown function DUF1253)
29H10E21.4H10E21.4n/achrIII 18,471contains similarity to Pfam domain PF00036 EF hand contains similarity to Interpro domains IPR011992 (EF-Hand type), IPR002048 (Calcium-binding EF-hand), IPR008080 (Parvalbumin), IPR003299 (Flagellar calcium-binding protein (calflagin))
30srbc-70F30B5.6n/achrIV 4,227,430C. elegans SRBC-70 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domain IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
31F52G3.4F52G3.4n/achrX 16,950,151
32F21C10.5F21C10.5n/achrV 9,125,800contains similarity to Xenopus tropicalis H/ACA ribonucleoprotein complex subunit 1-like protein.; SW:Q5RJV1
33egl-2F16B3.1n/achrV 1,294,353egl-2 encodes a voltage-gated potassium channel that affects egg laying, muscle activation, defecation, mechanosensation, and chemosensation; expressed in the intestinal muscle, AFD, ALN, AQR, ASE, AWC, BAG, IL2, PLN, PQR, and URX neurons as well as a subset of sensory neurons in the male tail.
34F36D4.1F36D4.1n/achrV 9,418,520
35srv-22H04M03.9n/achrIV 5,879,196C. elegans SRV-22 protein; contains similarity to Pfam domain PF01748 Caenorhabditis serpentine receptor-like protein contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002651 (Protein of unknown function DUF32)
36K07H8.5K07H8.5n/achrIV 8,272,091
37clec-44R07C3.12n/achrII 921,144C. elegans CLEC-44 protein; contains similarity to Pfam domain PF00059 Lectin C-type domain contains similarity to Interpro domains IPR000859 (CUB), IPR016187 (C-type lectin fold), IPR016186 (C-type lectin-like), IPR001304 (C-type lectin)
38hlh-8C02B8.4n/achrX 8,118,315The hlh-8 gene encodes a helix-loop-helix protein required for normal muscle development, and hence for normal defecation and egg-laying.
39K09H9.4K09H9.4n/achrI 3,134,515contains similarity to Interpro domains IPR015706 (RNA-directed DNA polymerase (reverse transcriptase), related), IPR003286 (Nematode reverse transcriptase-like)
40F31B9.1F31B9.1n/achrX 15,912,318contains similarity to Pfam domain PF00001 7 transmembrane receptor (rhodopsin family) contains similarity to Interpro domains IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily), IPR002286 (P2 purinoceptor), IPR006121 (Heavy metal transport/detoxification protein), IPR000276 (GPCR, rhodopsin-like)
41nhr-273T12C9.1n/achrII 4,436,140C. elegans NHR-273 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR000324 (Vitamin D receptor), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
42nas-33K04E7.3n/achrX 6,453,429C. elegans NAS-33 protein; contains similarity to Pfam domains PF00090 (Thrombospondin type 1 domain) , PF01400 (Astacin (Peptidase family M12A)) contains similarity to Interpro domains IPR000884 (Thrombospondin, type I), IPR000742 (EGF-like, type 3), IPR006030 (Molluscan rhodopsin C-terminal tail), IPR006025 (Peptidase M, neutral zinc metallopeptidases, zinc-binding site), IPR000694 (Proline-rich region), IPR001506 (Peptidase M12A, astacin), IPR006026 (Peptidase, metallopeptidases), IPR000859 (CUB), IPR013032 (EGF-like region, conserved site)
43B0454.5B0454.5n/achrII 3,039,835contains similarity to Homo sapiens 21 kDa protein; VG:OTTHUMP00000165983
44C25A1.5C25A1.5n/achrI 10,178,041contains similarity to Pfam domains PF04116 (Fatty acid hydroxylase superfamily) , PF00173 (Cytochrome b5-like Heme/Steroid binding domain) contains similarity to Interpro domains IPR006694 (Fatty acid hydroxylase), IPR001199 (Cytochrome b5)
45F44C8.7F44C8.7n/achrV 2,216,907contains similarity to Pfam domain PF04142 Nucleotide-sugar transporter contains similarity to Interpro domains IPR004689 (UDP-galactose transporter), IPR007271 (Nucleotide-sugar transporter)
46M04B2.2M04B2.2n/achrIV 11,529,284contains similarity to Pfam domains PF01170 (Putative RNA methylase family UPF0020) , PF02926 (THUMP domain) contains similarity to Interpro domains IPR004114 (THUMP), IPR001091 (Site-specific DNA-methyltransferase (cytosine-N4-specific)), IPR000241 (Putative RNA methylase)
47K09C4.6K09C4.6n/achrX 3,275,175
48srj-26ZK262.10n/achrV 18,422,252C. elegans SRJ-26 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
49mom-4F52F12.3n/achrI 9,898,245mom-4 encodes a MAP kinase kinase kinase-related protein orthologous to Drosophila Tak1 and the vertebrate MAPKKK7 proteins; during embryonic development, mom-4 activity is required for positive regulation of the Wnt pathway signaling that governs anterior/posterior (A/P) polarity: MOM-4 stimulates the WRM-1/LIT-1-dependent phosphorylation of POP-1, a TCF/LEF-related transcription factor, leading to its downregulation in posterior daughters of A/P cell divisions.
50C09D4.2C09D4.2n/achrI 5,492,333