UCSC C. elegans Gene Sorter
 
genome assembly search
sort by display output 
#
Name
WormBase
BLASTP
E-Value
Genome Position
Description
1F26C11.3F26C11.30chrII 9,906,024contains similarity to Interpro domains IPR000436 (Sushi/SCR/CCP), IPR016060 (Complement control module)
2F08F8.2F08F8.2n/achrIII 7,360,724contains similarity to Pfam domain PF00368 Hydroxymethylglutaryl-coenzyme A reductase contains similarity to Interpro domains IPR004554 (Hydroxymethylglutaryl-CoA reductase, class I, catalytic), IPR009029 (Hydroxymethylglutaryl-CoA reductase, class I/II, substrate-binding), IPR002202 (Hydroxymethylglutaryl-CoA reductase, class I/II, catalytic)
3T26E4.5T26E4.5n/achrV 15,787,827contains similarity to Interpro domain IPR008996 ()
4srw-119K12D9.7n/achrV 2,999,188C. elegans SRW-119 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
5lin-49F42A9.2n/achrIV 8,623,398C. elegans LIN-49 protein; contains similarity to Pfam domains PF00628 (PHD-finger) , PF00439 (Bromodomain) contains similarity to Interpro domains IPR001965 (Zinc finger, PHD-type), IPR001487 (Bromodomain), IPR002219 (Protein kinase C, phorbol ester/diacylglycerol binding), IPR011011 (Zinc finger, FYVE/PHD-type)
6him-14ZK1127.11n/achrII 7,067,448him-14 encodes a germline-specific member of the MutS family of DNA mismatch repair (MMR) proteins that is orthologous to human MSH4 and Saccharomyces cerevisiae Msh4p; during the pachytene stage of meiosis, HIM-14 activity is required for promoting crossing over between homologous chromosomes and thus, for chiasmata formation and proper chromosome segregation; in contrast, HIM-14 activity does not appear to be required for mismatch repair, nor for chromosome pairing or synapsis; him-14 mRNA expression is detected exclusively in the germline.
7B0496.1B0496.1n/achrIV 7,446,888contains similarity to Pfam domain PF00651 BTB/POZ domain contains similarity to Interpro domains IPR011333 (BTB/POZ fold), IPR013069 (BTB/POZ), IPR000210 (BTB/POZ-like)
8T11G6.5T11G6.5n/achrIV 10,839,263contains similarity to Interpro domain IPR000694 (Proline-rich region)
9F26A1.6F26A1.6n/achrIII 4,816,522contains similarity to Lumbricus rubellus Amine oxidase-like protein (Fragment).; TR:Q94610
10mdf-1C50F4.11n/achrV 9,542,977mdf-1 encodes a coiled-coil domain-containing protein that is orthologous to the Saccharomyces cerevisiae mitotic spindle checkpoint protein Mad1p; consistent with a role as a checkpoint protein, MDF-1 is required in C. elegans for mitotic genome stability and hence, long-term survival and fertility; in vitro, MDF-1 interacts with MDF-2, the C. elegans Mad2p ortholog.
11F28G4.5F28G4.5n/achrV 16,290,444contains similarity to Pfam domain PF01757 Acyltransferase family contains similarity to Interpro domains IPR002656 (Acyltransferase 3), IPR006621 (Nose resistant to fluoxetine-4, N-terminal)
12K10C9.4K10C9.4n/achrV 1,051,572contains similarity to Interpro domain IPR003945 (NADH-plastoquinone oxidoreductase, chain 5)
13K03E5.1K03E5.1n/achrI 3,431,349contains similarity to Pfam domain PF00431 CUB domain contains similarity to Interpro domains IPR002172 (Low density lipoprotein-receptor, class A, cysteine-rich), IPR000859 (CUB)
14T25F10.4T25F10.4n/achrV 6,761,420contains similarity to Interpro domain IPR006202 (Neurotransmitter-gated ion-channel ligand-binding)
15prg-2C01G5.2n/achrIV 6,528,248C. elegans PRG-2 protein; contains similarity to Pfam domains PF02171 (Piwi domain) , PF02170 (PAZ domain) contains similarity to Interpro domains IPR003165 (Stem cell self-renewal protein Piwi), IPR003100 (Argonaute and Dicer protein, PAZ), IPR012337 (Polynucleotidyl transferase, Ribonuclease H fold)
16F35E12.2F35E12.2n/achrV 13,723,593contains similarity to Pfam domain PF02408 CUB-like domain contains similarity to Interpro domain IPR003366 (CUB-like region)
17D2089.3D2089.3n/achrII 10,663,519contains similarity to Homo sapiens hypothetical protein LOC150383; ENSEMBL:ENSP00000325301
18srw-113ZK1037.9n/achrV 15,333,837C. elegans SRW-113 protein; contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
19wah-1Y56A3A.32n/achrIII 11,994,707wah-1 encodes a putative flavin-adenine dinucleotide (FAD)-binding oxidoreductase orthologous to mammalian PDCD8 (AIF; OMIM:300169, mutated in Harlequin mice); WAH-1 is required for apoptotic DNA degratation, SCRM-1 phospholipid scramblase activity, phosphatidylserine exposure, rapid apoptosis during embryonic development, and rapid engulfment of apoptotic cells in the germline; WAH-1 is also required for normally rapid growth and large brood sizes, and has a subtle proapoptotic function revealed in ced-3 or ced-4 mutant backgrounds; WAH-1 is expressed in most, if not all, cells of embryos and larvae; WAH-1 is normally mitochondrial, but can be released into the cytosol and nucleus by EGL-1 and CED-3; residues 380-550 of WAH-1 specifically bind SCRM-1 in vitro, but not SCRM-2 through SCRM-4, and WAH-1 binding is required in liposomes for more than residual SCRM-1 activity; WAH-1 also binds and activates CPS-6, promoting apoptotic DNA degradation, and transgenic coexpression of WAH-1 with CPS-6 specifically induces ectopic CED-3-dependent apoptosis in touch receptor neurons; CPS-6 shares a genetic pathway with WAH-1, whereas CED-3, CED-4, CED-8, and NUC-1 act independently of it; WAH-1 is paralogous to C. elegans F20D6.11 and human AIFM3 (AIFL).
20E03H4.4E03H4.4n/achrI 12,409,488contains similarity to Pfam domain PF03385 Protein of unknown function, DUF288 contains similarity to Interpro domain IPR005049 (Protein of unknown function DUF288)
21srh-296Y94A7B.4n/achrV 17,811,540C. elegans SRH-296 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
22C37A2.6C37A2.6n/achrI 6,788,535contains similarity to Pfam domain PF06325 Ribosomal protein L11 methyltransferase (PrmA) contains similarity to Interpro domain IPR010456 (Ribosomal L11 methyltransferase)
23F59D6.4F59D6.4n/achrV 3,030,897contains similarity to Pfam domain PF01030 Receptor L domain contains similarity to Interpro domain IPR000494 (EGF receptor, L domain)
24F13G3.10F13G3.10n/achrI 7,313,972contains similarity to Interpro domain IPR010989 (t-SNARE)
25T11F9.12T11F9.12n/achrV 11,494,950contains similarity to Interpro domain IPR011735 (Conserved hypothetical protein, HtrL)
26E03H4.2E03H4.2n/achrI 12,403,805contains similarity to Pfam domain PF01482 Domain of unknown function DUF13 contains similarity to Interpro domain IPR002485 (Protein of unknown function DUF13)
27C35C5.2C35C5.2n/achrX 11,539,654contains similarity to Pfam domains PF04389 (Peptidase family M28) , PF02225 (PA domain) , PF04253 (Transferrin receptor-like dimerisation domain) contains similarity to Interpro domains IPR007365 (Transferrin receptor-like, dimerisation), IPR007484 (Peptidase M28), IPR003137 (Protease-associated PA)
28str-207F26G5.4n/achrV 4,952,370C. elegans STR-207 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
29cyp-33C1C45H4.2n/achrV 2,180,672C. elegans CYP-33C1 protein; contains similarity to Pfam domain PF00067 Cytochrome P450 contains similarity to Interpro domains IPR001128 (Cytochrome P450), IPR002401 (Cytochrome P450, E-class, group I), IPR002403 (Cytochrome P450, E-class, group IV), IPR002397 (Cytochrome P450, B-class)
30R10D12.6R10D12.6n/achrV 13,949,458contains similarity to Pfam domain PF01679 Uncharacterized protein family UPF0057 contains similarity to Interpro domain IPR000612 (Protein of unknown function UPF0057)
31srx-19T05A12.1n/achrIV 6,874,033C. elegans SRX-19 protein ;
32ZK524.4ZK524.4n/achrI 7,463,889contains similarity to Pfam domain PF00069 Protein kinase domain contains similarity to Interpro domains IPR017441 (Protein kinase ATP binding, conserved site), IPR002290 (Serine/threonine protein kinase), IPR011009 (Protein kinase-like), IPR008271 (Serine/threonine protein kinase, active site), IPR000719 (Protein kinase, core), IPR001245 (Tyrosine protein kinase), IPR017442 (Serine/threonine protein kinase-related)
33C02B10.6C02B10.6n/achrIV 5,071,570contains similarity to Pfam domain PF00102 Protein-tyrosine phosphatase contains similarity to Interpro domains IPR003595 (Protein-tyrosine phosphatase, catalytic), IPR016130 (Protein-tyrosine phosphatase, active site), IPR000242 (Protein-tyrosine phosphatase, receptor/non-receptor type), IPR000387 (Protein-tyrosine phosphatase)
34F14F9.6F14F9.6n/achrV 5,148,306
35acy-1F17C8.1n/achrIII 4,726,505The acy-1 gene encodes a protein with 40% identity to mammalian adenylyl cyclases, most closely related to the divergent mouse isoform type IX, that affects viability, muscle contraction, locomotion, and molting; it acts genetically downstream of gsa-1 and is expressed in excitable cells.
36hyl-2K02G10.6n/achrX 4,698,095hyl-2 encodes a predicted transmembrane protein that is related to Saccharomyces cerevisiae LAG1 (longevity assurance gene), a protein preferentially expressed in young yeasts; by homology, HYL-2 is predicted to have several possible functions, including regulation of lipid, particularly ceramide, biosynthesis, regulation of lipid transport, and regulation of protein translocation in the endoplasmic reticulum ; however, as loss of hyl-2 activity via RNA-mediated interference (RNAi) does not result in any obvious abnormalities, the precise role of hyl-2 in C. elegans development and/or behavior is not yet known.
37grl-13F32D1.4n/achrV 4,363,652grl-13 encodes a hedgehog-like protein, with an N-terminal signal sequence, a central low-complexity region, and a C-terminal Ground-like (Grl) domain; GRL-13 is expressed in larval arcade cells; the Grl domain is predicted to form a cysteine-crosslinked protein involved in intercellular signalling, and it has subtle similarity to the N-terminal Hedge domain of HEDGEHOG proteins.
38C08G5.6C08G5.6n/achrII 771,341
39str-204F10D2.1n/achrV 7,160,334C. elegans STR-204 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
40ZK863.1ZK863.1n/achrV 12,169,192contains similarity to Interpro domain IPR017452 (GPCR, rhodopsin-like superfamily)
41str-63C17B7.1n/achrV 3,352,167C. elegans STR-63 protein; contains similarity to Pfam domain PF01461 7TM chemoreceptor contains similarity to Interpro domain IPR003002 (7TM chemoreceptor, subfamily 1)
42nhr-159C17E7.7n/achrV 3,876,286C. elegans NHR-159 protein; contains similarity to Pfam domains PF00104 (Ligand-binding domain of nuclear hormone receptor) , PF00105 (Zinc finger, C4 type (two domains)) contains similarity to Interpro domains IPR008946 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding), IPR013088 (Zinc finger, NHR/GATA-type), IPR001628 (Zinc finger, nuclear hormone receptor-type), IPR000536 (Nuclear hormone receptor, ligand-binding, core)
43Y54E2A.4Y54E2A.4n/achrII 14,754,890contains similarity to Archaeoglobus fulgidus NADH oxidase (NOXA-3).; TR:O29847
44C35C5.6C35C5.6n/achrX 11,566,764contains similarity to Drosophila melanogaster Flybase gene name is CG2478-PA;; FLYBASE:CG2478
45srv-6C52B9.5n/achrX 4,258,053C. elegans SRV-6 protein ;
46F42G2.6F42G2.6n/achrII 2,428,176contains similarity to Pfam domain PF00046 Homeobox domain contains similarity to Interpro domains IPR012287 (Homeodomain-related), IPR000533 (Tropomyosin), IPR001356 (Homeobox), IPR009057 (Homeodomain-like)
47K03H6.4K03H6.4n/achrIV 1,519,644
48T20B6.2T20B6.2n/achrIII 2,895,298contains similarity to Pfam domain PF02206 Domain of unknown function contains similarity to Interpro domains IPR000694 (Proline-rich region), IPR003125 (Protein of unknown function WSN)
49cee-1F26F4.1n/achrIII 4,913,131C. elegans CEE-1 protein; contains similarity to Pfam domain PF04190 Protein of unknown function (DUF410) contains similarity to Interpro domain IPR007317 (Protein of unknown function DUF410)
50math-50ZK250.8n/achrII 1,957,153math-50 encodes a protein which has a meprin-associated Traf homology (MATH) domain and may be involved in apoptosis.